More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2703 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
440 aa  911    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  72.37 
 
 
447 aa  675    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  63.3 
 
 
442 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  61.93 
 
 
441 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  61.06 
 
 
443 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  60.97 
 
 
443 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  60.23 
 
 
461 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  61.2 
 
 
443 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  60.74 
 
 
443 aa  534  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  61.99 
 
 
443 aa  531  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  61.2 
 
 
443 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  61.2 
 
 
443 aa  534  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  60.51 
 
 
443 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  60.51 
 
 
443 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  60.51 
 
 
443 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  58.64 
 
 
443 aa  526  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  60.28 
 
 
443 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  59.53 
 
 
443 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  39.32 
 
 
428 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  39.76 
 
 
441 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  39.27 
 
 
457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  39.27 
 
 
457 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  34.4 
 
 
443 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  34.09 
 
 
452 aa  272  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  35.68 
 
 
466 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  34.47 
 
 
453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  33.18 
 
 
493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  33.26 
 
 
470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  35.33 
 
 
514 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  33.94 
 
 
477 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  33.95 
 
 
494 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  34.3 
 
 
459 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  33.65 
 
 
876 aa  246  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  34.42 
 
 
513 aa  243  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  32.08 
 
 
506 aa  243  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  31.31 
 
 
454 aa  242  9e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  33.33 
 
 
501 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  32.69 
 
 
504 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  35.34 
 
 
453 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  32.77 
 
 
532 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  33.57 
 
 
422 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  34.77 
 
 
459 aa  236  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  32.21 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  34.13 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  31.38 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  33.03 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  31.38 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  30.05 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  34.13 
 
 
441 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  31.89 
 
 
456 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  33.73 
 
 
431 aa  231  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  32.33 
 
 
518 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  32.06 
 
 
526 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  32.22 
 
 
469 aa  229  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  30.66 
 
 
470 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  31.58 
 
 
499 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  31.85 
 
 
520 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  32.2 
 
 
528 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 
462 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  31.15 
 
 
453 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  33.56 
 
 
954 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  32.86 
 
 
492 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  31.94 
 
 
458 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  32.68 
 
 
539 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  31.94 
 
 
458 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  33.25 
 
 
411 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  29.6 
 
 
459 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  31.7 
 
 
458 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  30.57 
 
 
477 aa  217  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 
439 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  31.74 
 
 
424 aa  216  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  29.63 
 
 
526 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  31.13 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  32.09 
 
 
484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  30.44 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  32.62 
 
 
463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  32.52 
 
 
413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  33.42 
 
 
921 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  30.29 
 
 
451 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  30.15 
 
 
550 aa  213  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  30.18 
 
 
448 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  30.18 
 
 
448 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  33.1 
 
 
414 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  29.22 
 
 
450 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  31 
 
 
461 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  30.68 
 
 
442 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  29.98 
 
 
448 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  30.29 
 
 
451 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  28.46 
 
 
494 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  33.49 
 
 
509 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  29.52 
 
 
459 aa  209  7e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  32.24 
 
 
476 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  31.37 
 
 
896 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.45 
 
 
450 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  28.46 
 
 
494 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  29.81 
 
 
451 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  30.33 
 
 
451 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  31.06 
 
 
467 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  32.43 
 
 
411 aa  207  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0119  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase)  31.72 
 
 
413 aa  207  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.369766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>