More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3545 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  88.15 
 
 
424 aa  757    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
422 aa  870    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  58.33 
 
 
876 aa  505  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  37.83 
 
 
493 aa  279  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  37.96 
 
 
465 aa  270  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  38.24 
 
 
439 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  38.05 
 
 
453 aa  249  8e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  34.11 
 
 
896 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  34.2 
 
 
929 aa  246  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  34.52 
 
 
461 aa  246  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  34.13 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  34.75 
 
 
452 aa  242  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  33.41 
 
 
447 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  33.41 
 
 
441 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  33.65 
 
 
442 aa  239  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  34.45 
 
 
443 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  33.65 
 
 
443 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  34.45 
 
 
443 aa  239  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  33.89 
 
 
443 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
443 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  33.89 
 
 
443 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  33.73 
 
 
443 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  36.36 
 
 
957 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  33.89 
 
 
443 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  33.17 
 
 
443 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  32.54 
 
 
945 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  30.43 
 
 
937 aa  235  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  35.81 
 
 
942 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  32.94 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  32.94 
 
 
443 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  32.7 
 
 
443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  35.17 
 
 
470 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  34.19 
 
 
504 aa  229  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  37.88 
 
 
459 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  32.46 
 
 
440 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  35.35 
 
 
443 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  33.41 
 
 
506 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  36.43 
 
 
466 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  32.56 
 
 
459 aa  225  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  32.94 
 
 
949 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  32.87 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  34.32 
 
 
459 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  32.39 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  34.61 
 
 
457 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  34.61 
 
 
457 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  36.47 
 
 
470 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  34.37 
 
 
441 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  38.02 
 
 
928 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  35.12 
 
 
492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  33.64 
 
 
934 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  32.17 
 
 
441 aa  216  8e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  31.56 
 
 
494 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  36.29 
 
 
477 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  31.93 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  33.73 
 
 
948 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  34.8 
 
 
456 aa  212  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  32.94 
 
 
912 aa  212  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  34.37 
 
 
428 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  31.08 
 
 
468 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  30.34 
 
 
455 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  30.47 
 
 
454 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  31.01 
 
 
494 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  34.52 
 
 
484 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  35.66 
 
 
443 aa  206  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  31.06 
 
 
464 aa  205  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  32.55 
 
 
464 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  32.88 
 
 
499 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  34.5 
 
 
448 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  32.41 
 
 
461 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  36.98 
 
 
509 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  34.2 
 
 
954 aa  203  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  32.01 
 
 
461 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  30.65 
 
 
453 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  33.03 
 
 
501 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  30.11 
 
 
532 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  34.29 
 
 
482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  33.81 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  33.1 
 
 
465 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  30.65 
 
 
489 aa  201  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  30.32 
 
 
442 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  33.1 
 
 
465 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  31.4 
 
 
476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  30.25 
 
 
493 aa  200  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  33.02 
 
 
451 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  31.78 
 
 
489 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  30.09 
 
 
459 aa  199  9e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  29.47 
 
 
518 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  32.4 
 
 
494 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  33.81 
 
 
462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  33.87 
 
 
484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  32.56 
 
 
451 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  32.56 
 
 
451 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  31.91 
 
 
469 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  29.77 
 
 
463 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  31.93 
 
 
477 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  33.02 
 
 
451 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  30.73 
 
 
919 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  34.81 
 
 
479 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  34.34 
 
 
450 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  32.79 
 
 
453 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>