More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3417 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  88.41 
 
 		 943 aa  1686    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  77.34 
 
 		 935 aa  1481    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  77.56 
 
 		 935 aa  1487    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  77.45 
 
 		 935 aa  1485    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 924 aa  1884    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  97.73 
 
 		 943 aa  1843    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  91.77 
 
 		 943 aa  1741    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  78.54 
 
 		 948 aa  1506    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  77.34 
 
 		 934 aa  1477    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  36.81 
 
 		 963 aa  533  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  33.08 
 
 		 948 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  33.48 
 
 		 948 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  31.86 
 
 		 974 aa  422  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  28.37 
 
 		 1442 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  30.28 
 
 		 948 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  30.34 
 
 		 947 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  30.67 
 
 		 979 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  28.6 
 
 		 932 aa  334  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  28.06 
 
 		 958 aa  325  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  27.06 
 
 		 961 aa  321  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  27.22 
 
 		 963 aa  267  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  25.64 
 
 		 1005 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  23.81 
 
 		 978 aa  241  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  23.59 
 
 		 936 aa  218  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  24.55 
 
 		 950 aa  218  5.9999999999999996e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  24.19 
 
 		 941 aa  189  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  23.54 
 
 		 954 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  24.21 
 
 		 928 aa  179  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  24.24 
 
 		 955 aa  178  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  23.8 
 
 		 938 aa  178  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  23.54 
 
 		 937 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  34.9 
 
 		 916 aa  161  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  26.97 
 
 		 927 aa  160  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  22.37 
 
 		 915 aa  160  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  22.89 
 
 		 927 aa  157  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  22.8 
 
 		 927 aa  156  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  21.96 
 
 		 927 aa  156  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  22.78 
 
 		 931 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  22.78 
 
 		 931 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  22.36 
 
 		 927 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  22.36 
 
 		 927 aa  154  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  21.8 
 
 		 938 aa  154  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  22.52 
 
 		 926 aa  153  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  22.78 
 
 		 927 aa  152  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  26.38 
 
 		 933 aa  148  5e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  21.57 
 
 		 912 aa  144  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  31.47 
 
 		 932 aa  138  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  23.26 
 
 		 922 aa  137  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  33.03 
 
 		 918 aa  136  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  30.42 
 
 		 916 aa  134  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  20.03 
 
 		 912 aa  134  9e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  22.73 
 
 		 940 aa  113  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  30.62 
 
 		 924 aa  108  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  20.95 
 
 		 992 aa  107  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.86 
 
 		 942 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  30 
 
 		 913 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  28.3 
 
 		 1032 aa  102  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  27.83 
 
 		 925 aa  99.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  30.13 
 
 		 1088 aa  97.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  30.13 
 
 		 1088 aa  97.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  30.14 
 
 		 879 aa  92.4  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  31.88 
 
 		 464 aa  89.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  22.49 
 
 		 878 aa  89.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  24.8 
 
 		 439 aa  88.2  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  27.52 
 
 		 967 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  30.13 
 
 		 440 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  30.23 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  27.59 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  29.27 
 
 		 455 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  24.04 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  31.25 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  27.83 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  29.53 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  30.77 
 
 		 868 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  33.65 
 
 		 431 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  23.53 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  31.19 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  25.57 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  31.42 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  30 
 
 		 937 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  31.38 
 
 		 853 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3808  protein YhjJ  27.27 
 
 		 495 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3989  hypothetical protein  27.27 
 
 		 481 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.801432  normal  0.0802476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  29.68 
 
 		 453 aa  80.9  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3885  hypothetical protein  27.27 
 
 		 495 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3929  hypothetical protein  27.27 
 
 		 495 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0881778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3821  protein YhjJ  27.27 
 
 		 495 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  27.94 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  24.93 
 
 		 530 aa  80.1  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  30.37 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  28.33 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  30.73 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  31.16 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  29.89 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  26.62 
 
 		 943 aa  78.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  28.03 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3924  peptidase M16 domain-containing protein  27.6 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  29.81 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  26.61 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  29.86 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>