More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3129 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
967 aa  1944    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  49.78 
 
 
956 aa  832    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  46.66 
 
 
960 aa  812    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  42.84 
 
 
929 aa  682    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  44.38 
 
 
921 aa  739    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  46.11 
 
 
930 aa  813    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  42.95 
 
 
947 aa  683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  57.66 
 
 
952 aa  1055    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  45.53 
 
 
949 aa  765    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  46.67 
 
 
962 aa  812    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  59.94 
 
 
959 aa  1108    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  42.95 
 
 
949 aa  683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  46.68 
 
 
910 aa  801    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  36.12 
 
 
943 aa  529  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  31.75 
 
 
945 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  31.84 
 
 
974 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  33.33 
 
 
947 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  31.54 
 
 
945 aa  416  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  31.48 
 
 
952 aa  415  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  33.3 
 
 
949 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  32.72 
 
 
969 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  32.33 
 
 
943 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  32.12 
 
 
944 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  33.01 
 
 
949 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  32.94 
 
 
949 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  32.87 
 
 
949 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  31.73 
 
 
950 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  31.86 
 
 
947 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  32.08 
 
 
950 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  32.08 
 
 
950 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  32.08 
 
 
950 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  31.55 
 
 
944 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  32.31 
 
 
944 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  30.84 
 
 
959 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  31 
 
 
944 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  32.01 
 
 
945 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  29.06 
 
 
958 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  30.56 
 
 
944 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  34.05 
 
 
901 aa  359  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  33.22 
 
 
903 aa  354  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  28.42 
 
 
954 aa  341  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  32.97 
 
 
904 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  29.95 
 
 
954 aa  314  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  45.28 
 
 
458 aa  310  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  44.77 
 
 
458 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  45.04 
 
 
458 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.64 
 
 
896 aa  280  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  41.57 
 
 
427 aa  261  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  25.49 
 
 
937 aa  259  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  41.2 
 
 
423 aa  254  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  24.73 
 
 
929 aa  251  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  41.42 
 
 
429 aa  241  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  26.09 
 
 
918 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  25.9 
 
 
945 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  35.49 
 
 
440 aa  238  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  38.8 
 
 
442 aa  233  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  27.91 
 
 
921 aa  233  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  27.63 
 
 
957 aa  231  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  24.87 
 
 
948 aa  224  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  37.62 
 
 
470 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  44.29 
 
 
447 aa  222  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  25.69 
 
 
919 aa  221  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  28.06 
 
 
942 aa  221  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  40 
 
 
429 aa  220  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  35.66 
 
 
413 aa  208  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  33.04 
 
 
440 aa  207  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  25.13 
 
 
876 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  35.45 
 
 
482 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  26.68 
 
 
903 aa  204  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  42.71 
 
 
411 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4128  peptidase M16 domain-containing protein  34.19 
 
 
437 aa  199  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0081  peptidase M16 domain-containing protein  34.15 
 
 
463 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 
414 aa  196  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0931  peptidase M16 domain-containing protein  40.66 
 
 
428 aa  196  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  34 
 
 
436 aa  195  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  33.17 
 
 
411 aa  194  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3747  peptidase M16 domain-containing protein  33.26 
 
 
448 aa  194  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  33.89 
 
 
433 aa  193  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  35.98 
 
 
413 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  30.84 
 
 
422 aa  189  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  36.81 
 
 
428 aa  187  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1775  peptidase M16 domain-containing protein  37.09 
 
 
438 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  32.48 
 
 
470 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06870  predicted Zn-dependent peptidase  36.8 
 
 
428 aa  183  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.677092  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  31.08 
 
 
767 aa  181  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  46.32 
 
 
434 aa  180  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  26.11 
 
 
853 aa  179  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2243  peptidase M16 domain-containing protein  30.98 
 
 
476 aa  178  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193562  normal  0.100659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  32.33 
 
 
463 aa  177  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  34.37 
 
 
457 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  31.03 
 
 
476 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  33.89 
 
 
489 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  30.75 
 
 
453 aa  175  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  30.29 
 
 
489 aa  175  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  34 
 
 
411 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  35.04 
 
 
457 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  30.12 
 
 
530 aa  174  6.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  30.53 
 
 
493 aa  174  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  31.59 
 
 
443 aa  173  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  30.82 
 
 
443 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>