More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01108 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  100 
 
 
954 aa  1950    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  36.33 
 
 
943 aa  557  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  35.53 
 
 
944 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  36.31 
 
 
969 aa  549  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  35.48 
 
 
945 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  34.99 
 
 
944 aa  538  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  36.34 
 
 
949 aa  538  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  35.64 
 
 
945 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  35.68 
 
 
945 aa  535  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  35.65 
 
 
944 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  35.68 
 
 
950 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  36.09 
 
 
949 aa  532  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  35.53 
 
 
944 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  35.82 
 
 
944 aa  528  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  35.58 
 
 
950 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  35.47 
 
 
950 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  35.87 
 
 
949 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  35.87 
 
 
949 aa  526  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  34.03 
 
 
959 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  34.09 
 
 
974 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  33.54 
 
 
947 aa  511  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  32.85 
 
 
952 aa  497  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  33.92 
 
 
958 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  33.09 
 
 
950 aa  489  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  33.59 
 
 
947 aa  489  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  32.62 
 
 
921 aa  459  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  30.38 
 
 
949 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  29.46 
 
 
943 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  29.37 
 
 
947 aa  376  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  28.92 
 
 
956 aa  372  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  28.31 
 
 
930 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  29.26 
 
 
929 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  29.26 
 
 
949 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  28.94 
 
 
962 aa  362  3e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  29.16 
 
 
959 aa  355  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  28.87 
 
 
960 aa  354  5e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  29.02 
 
 
952 aa  353  8.999999999999999e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  27.78 
 
 
910 aa  338  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  28.16 
 
 
967 aa  335  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  26.95 
 
 
954 aa  311  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  28.76 
 
 
904 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  28.25 
 
 
901 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.19 
 
 
945 aa  265  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  38 
 
 
458 aa  264  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  38 
 
 
458 aa  264  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  38 
 
 
458 aa  263  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  26.39 
 
 
896 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  25.95 
 
 
937 aa  251  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  32.63 
 
 
440 aa  246  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  26.13 
 
 
929 aa  241  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  32.18 
 
 
440 aa  240  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  27.06 
 
 
918 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  31.1 
 
 
422 aa  214  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  34.37 
 
 
903 aa  212  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  32.48 
 
 
470 aa  210  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  25.32 
 
 
934 aa  205  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  24.97 
 
 
948 aa  205  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 
413 aa  204  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  33.66 
 
 
436 aa  203  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  32.35 
 
 
414 aa  202  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0081  peptidase M16 domain-containing protein  33.25 
 
 
463 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  33.91 
 
 
447 aa  201  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  25.66 
 
 
853 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  33.03 
 
 
429 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  34.47 
 
 
428 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  35.05 
 
 
442 aa  193  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  24.7 
 
 
903 aa  194  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4128  peptidase M16 domain-containing protein  33.01 
 
 
437 aa  193  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  25.08 
 
 
919 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  25.59 
 
 
928 aa  192  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3747  peptidase M16 domain-containing protein  32.85 
 
 
448 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  24.11 
 
 
912 aa  191  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  32.27 
 
 
411 aa  191  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  33.02 
 
 
429 aa  191  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  23.63 
 
 
876 aa  189  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06870  predicted Zn-dependent peptidase  31.97 
 
 
428 aa  188  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.677092  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  27.02 
 
 
949 aa  187  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.87 
 
 
506 aa  183  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  24.89 
 
 
912 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  30.9 
 
 
453 aa  181  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  27.83 
 
 
443 aa  181  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  31.22 
 
 
413 aa  181  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  32.86 
 
 
433 aa  181  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1775  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
438 aa  180  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  30.11 
 
 
473 aa  180  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  30.93 
 
 
411 aa  179  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  30.94 
 
 
443 aa  179  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  30.17 
 
 
465 aa  178  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  30.94 
 
 
443 aa  178  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  29.6 
 
 
442 aa  177  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  43.72 
 
 
423 aa  177  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  30.94 
 
 
443 aa  177  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  25.28 
 
 
942 aa  177  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  24.65 
 
 
921 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  25.16 
 
 
957 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  32.65 
 
 
434 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2243  peptidase M16 domain-containing protein  37.76 
 
 
476 aa  175  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193562  normal  0.100659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  28.34 
 
 
495 aa  175  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  30.07 
 
 
504 aa  174  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  30.96 
 
 
443 aa  174  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>