More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  77.1 
 
 
428 aa  667    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06870  predicted Zn-dependent peptidase  100 
 
 
428 aa  861    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.677092  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  64.37 
 
 
434 aa  518  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4128  peptidase M16 domain-containing protein  61.67 
 
 
437 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3747  peptidase M16 domain-containing protein  60.38 
 
 
448 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  59.67 
 
 
433 aa  488  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0931  peptidase M16 domain-containing protein  59.67 
 
 
428 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  54.83 
 
 
436 aa  455  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1775  peptidase M16 domain-containing protein  54.95 
 
 
438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0081  peptidase M16 domain-containing protein  42.59 
 
 
463 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2243  peptidase M16 domain-containing protein  39.29 
 
 
476 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193562  normal  0.100659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  42.62 
 
 
458 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  42.38 
 
 
458 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  42.38 
 
 
458 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  33.25 
 
 
440 aa  240  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  38.57 
 
 
470 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  33.9 
 
 
440 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  40.29 
 
 
429 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  36.54 
 
 
414 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  40.66 
 
 
429 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  34.93 
 
 
943 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  38.08 
 
 
442 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  36.57 
 
 
447 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  37.5 
 
 
959 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  36.94 
 
 
441 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  35.7 
 
 
411 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  34.51 
 
 
921 aa  203  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  36.71 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  36.47 
 
 
457 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  33.58 
 
 
954 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  37.79 
 
 
423 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  36.28 
 
 
413 aa  199  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  31.11 
 
 
422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  31.88 
 
 
459 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  32.87 
 
 
947 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  33.87 
 
 
465 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  33.1 
 
 
470 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  36.1 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  34.74 
 
 
956 aa  196  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  34.25 
 
 
493 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  35.53 
 
 
466 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  34.38 
 
 
413 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  36.64 
 
 
462 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  31.97 
 
 
443 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  32.94 
 
 
947 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  33.81 
 
 
962 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  33.26 
 
 
949 aa  192  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  34.73 
 
 
952 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  32.45 
 
 
411 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  32.3 
 
 
950 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  34.26 
 
 
482 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  31.63 
 
 
441 aa  189  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  33.03 
 
 
945 aa  189  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  33.57 
 
 
960 aa  189  9e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  31.39 
 
 
441 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  34.12 
 
 
929 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  34.12 
 
 
949 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  31.97 
 
 
954 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  33.17 
 
 
453 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  33.18 
 
 
947 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  34.8 
 
 
459 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  33.65 
 
 
467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  33.65 
 
 
453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  32.51 
 
 
411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  37.24 
 
 
901 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  33.98 
 
 
448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  30 
 
 
493 aa  183  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  34.54 
 
 
455 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  36.8 
 
 
967 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  31.76 
 
 
930 aa  182  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  33.89 
 
 
469 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  37.23 
 
 
903 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  29.19 
 
 
443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  28.47 
 
 
443 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  31.79 
 
 
453 aa  180  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  34.86 
 
 
464 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  34.35 
 
 
459 aa  179  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  33.67 
 
 
945 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  28.78 
 
 
443 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  30.81 
 
 
443 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  35.5 
 
 
952 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  28.47 
 
 
443 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  29.38 
 
 
442 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  29.38 
 
 
443 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  33.09 
 
 
461 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  28.74 
 
 
454 aa  176  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  29.15 
 
 
459 aa  176  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  32.85 
 
 
450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  28.24 
 
 
443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  32.18 
 
 
974 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  38.73 
 
 
945 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  36.92 
 
 
904 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  31.8 
 
 
950 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  29.08 
 
 
443 aa  173  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  28 
 
 
443 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  33.09 
 
 
450 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  28.99 
 
 
489 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 
470 aa  172  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  38.89 
 
 
943 aa  172  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  32.54 
 
 
950 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>