More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1057 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  71.01 
 
 
944 aa  1400    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  71.53 
 
 
944 aa  1410    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  69.56 
 
 
944 aa  1364    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  52.88 
 
 
959 aa  1007    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  54.67 
 
 
945 aa  1024    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  71.64 
 
 
949 aa  1404    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  71.32 
 
 
950 aa  1404    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  47.41 
 
 
947 aa  910    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  68.78 
 
 
944 aa  1358    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  100 
 
 
945 aa  1946    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  71.32 
 
 
950 aa  1405    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  51.47 
 
 
969 aa  927    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  64.71 
 
 
974 aa  1298    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  47.3 
 
 
947 aa  892    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  49.37 
 
 
950 aa  947    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  50.84 
 
 
958 aa  1007    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  69.31 
 
 
945 aa  1390    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  71.43 
 
 
944 aa  1397    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  71.43 
 
 
949 aa  1402    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  71.75 
 
 
949 aa  1405    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  46.32 
 
 
952 aa  857    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  68.44 
 
 
943 aa  1365    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  71.64 
 
 
949 aa  1403    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  71.22 
 
 
950 aa  1405    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  35.07 
 
 
954 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  35.4 
 
 
921 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  34.92 
 
 
949 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  35.36 
 
 
947 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  34.92 
 
 
929 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  33.48 
 
 
943 aa  465  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  33.3 
 
 
956 aa  434  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  33.15 
 
 
962 aa  435  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  32.85 
 
 
960 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  34.11 
 
 
949 aa  425  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  33.02 
 
 
930 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  33.01 
 
 
959 aa  406  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  32.18 
 
 
952 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  32.66 
 
 
967 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  29.69 
 
 
910 aa  372  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  31.51 
 
 
901 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  31.22 
 
 
903 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  30.8 
 
 
904 aa  335  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  29.46 
 
 
954 aa  334  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  41.63 
 
 
458 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  41.71 
 
 
458 aa  327  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  41.71 
 
 
458 aa  327  7e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.74 
 
 
896 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  25.51 
 
 
937 aa  268  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  35.2 
 
 
440 aa  263  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  33.81 
 
 
440 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  24.84 
 
 
929 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  27.5 
 
 
918 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  37.74 
 
 
470 aa  257  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  34.53 
 
 
422 aa  253  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  35.89 
 
 
447 aa  248  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  35.54 
 
 
429 aa  248  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  26.68 
 
 
934 aa  244  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  27.39 
 
 
949 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  35.43 
 
 
429 aa  240  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  25.58 
 
 
876 aa  235  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  24.72 
 
 
945 aa  235  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  34.05 
 
 
442 aa  233  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  48.85 
 
 
423 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  33.33 
 
 
427 aa  216  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  32.48 
 
 
465 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  35.36 
 
 
461 aa  214  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  30.4 
 
 
453 aa  212  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 
457 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  33.33 
 
 
457 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  27.35 
 
 
919 aa  209  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  33.88 
 
 
464 aa  208  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  30.7 
 
 
453 aa  207  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  32.67 
 
 
443 aa  207  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  33.09 
 
 
441 aa  207  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  34.25 
 
 
476 aa  207  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  35.31 
 
 
461 aa  206  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  35.25 
 
 
489 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  31.63 
 
 
452 aa  204  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  34.33 
 
 
464 aa  204  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  30.3 
 
 
450 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  32.67 
 
 
442 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  33.17 
 
 
482 aa  201  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  32.33 
 
 
448 aa  200  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  31.4 
 
 
443 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  34.79 
 
 
463 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  30.77 
 
 
459 aa  198  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  31.13 
 
 
470 aa  199  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  30.07 
 
 
450 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  30.24 
 
 
443 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  25.19 
 
 
921 aa  198  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  31.6 
 
 
461 aa  197  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  36.3 
 
 
413 aa  197  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  24.29 
 
 
912 aa  197  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  32.21 
 
 
492 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  32.92 
 
 
414 aa  197  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  34.78 
 
 
469 aa  196  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  34.95 
 
 
413 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  32.94 
 
 
441 aa  195  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  31.3 
 
 
443 aa  195  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  30.42 
 
 
465 aa  195  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>