More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3560 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  47.82 
 
 		 947 aa  895    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  53.55 
 
 		 959 aa  1013    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  100 
 
 		 949 aa  1962    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  50.32 
 
 		 950 aa  954    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  68.89 
 
 		 945 aa  1382    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  87.39 
 
 		 944 aa  1709    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  87.37 
 
 		 950 aa  1717    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  87.37 
 
 		 950 aa  1716    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  71.64 
 
 		 945 aa  1396    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  73.83 
 
 		 944 aa  1428    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  71.82 
 
 		 944 aa  1421    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  46.76 
 
 		 947 aa  871    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  71.93 
 
 		 944 aa  1415    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  67.22 
 
 		 974 aa  1345    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  52.24 
 
 		 958 aa  1043    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  47.7 
 
 		 952 aa  882    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  94.1 
 
 		 949 aa  1829    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  54.78 
 
 		 945 aa  989    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  49.89 
 
 		 969 aa  891    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  87.5 
 
 		 944 aa  1706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  93.68 
 
 		 949 aa  1821    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  70.46 
 
 		 943 aa  1392    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  93.89 
 
 		 949 aa  1823    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  87.16 
 
 		 950 aa  1714    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  36.34 
 
 		 954 aa  548  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  35.63 
 
 		 921 aa  512  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  34.72 
 
 		 943 aa  483  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  33.26 
 
 		 949 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  33.26 
 
 		 929 aa  446  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  33.07 
 
 		 947 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  34.49 
 
 		 930 aa  430  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 		 949 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  32.89 
 
 		 959 aa  422  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  33.19 
 
 		 967 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  31.8 
 
 		 960 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  31.95 
 
 		 962 aa  412  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  32.35 
 
 		 956 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  32.4 
 
 		 952 aa  406  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  31.39 
 
 		 910 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  31.41 
 
 		 901 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  31.71 
 
 		 903 aa  353  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  29.65 
 
 		 954 aa  336  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  31.52 
 
 		 904 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  41.84 
 
 		 458 aa  323  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  41.84 
 
 		 458 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  41.84 
 
 		 458 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.83 
 
 		 896 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.82 
 
 		 937 aa  279  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  35.97 
 
 		 440 aa  273  9e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  38.86 
 
 		 470 aa  271  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  25.66 
 
 		 929 aa  259  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  26.79 
 
 		 876 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  35.55 
 
 		 440 aa  253  9.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  34.12 
 
 		 422 aa  250  9e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  25.72 
 
 		 945 aa  247  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  26.28 
 
 		 934 aa  244  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  35.29 
 
 		 429 aa  243  9e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  27.38 
 
 		 949 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  26.53 
 
 		 918 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  34.72 
 
 		 429 aa  236  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  34.9 
 
 		 447 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  33.97 
 
 		 442 aa  233  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  51.15 
 
 		 423 aa  225  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  32.23 
 
 		 453 aa  220  7.999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  32.55 
 
 		 470 aa  213  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  26.86 
 
 		 919 aa  213  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  32.77 
 
 		 457 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  32.53 
 
 		 457 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  32.61 
 
 		 441 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  30.67 
 
 		 465 aa  211  7e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  31.6 
 
 		 452 aa  209  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  25.85 
 
 		 912 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  32.86 
 
 		 427 aa  207  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  31.68 
 
 		 443 aa  207  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  32.08 
 
 		 428 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  36.04 
 
 		 461 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  33.88 
 
 		 489 aa  207  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  25.51 
 
 		 928 aa  206  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  31.86 
 
 		 461 aa  206  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  25.94 
 
 		 903 aa  206  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  36.64 
 
 		 469 aa  205  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  26.07 
 
 		 921 aa  205  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  25.79 
 
 		 853 aa  204  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  34.79 
 
 		 461 aa  204  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  34.24 
 
 		 464 aa  204  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  33.79 
 
 		 464 aa  203  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  31.73 
 
 		 447 aa  203  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  30.79 
 
 		 443 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  31.03 
 
 		 443 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  32.46 
 
 		 476 aa  202  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  32.68 
 
 		 441 aa  202  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  31.03 
 
 		 443 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  36.84 
 
 		 413 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  33.5 
 
 		 411 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  32.4 
 
 		 482 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  31.06 
 
 		 450 aa  201  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  30.7 
 
 		 459 aa  201  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  30.9 
 
 		 465 aa  201  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  30.9 
 
 		 465 aa  201  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  31.03 
 
 		 443 aa  201  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>