More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1835 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  47.98 
 
 
912 aa  862    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  45.66 
 
 
942 aa  783    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  60.55 
 
 
918 aa  1129    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  47.14 
 
 
948 aa  824    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  44.65 
 
 
919 aa  781    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
949 aa  1955    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  45.23 
 
 
957 aa  787    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  45.84 
 
 
928 aa  781    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  46.46 
 
 
921 aa  791    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  42.67 
 
 
912 aa  748    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  63.23 
 
 
934 aa  1205    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  36.75 
 
 
903 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  30.32 
 
 
929 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27040  zinc protease  29.68 
 
 
908 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.883186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  29.02 
 
 
945 aa  341  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  28.27 
 
 
937 aa  323  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  28.22 
 
 
876 aa  318  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.93 
 
 
896 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  39.63 
 
 
464 aa  287  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  38.3 
 
 
439 aa  282  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  27.47 
 
 
921 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  26.75 
 
 
950 aa  251  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  27.28 
 
 
947 aa  249  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  27.64 
 
 
949 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  26.41 
 
 
954 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  26.58 
 
 
947 aa  242  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  28.3 
 
 
952 aa  242  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  27.18 
 
 
949 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  27.64 
 
 
945 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  26.37 
 
 
969 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  27.57 
 
 
945 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  27.17 
 
 
949 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  26.17 
 
 
959 aa  234  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  27.19 
 
 
949 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  27.16 
 
 
944 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  28.41 
 
 
944 aa  231  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  27.05 
 
 
950 aa  230  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  26.35 
 
 
962 aa  229  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  27.05 
 
 
950 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  28.18 
 
 
943 aa  229  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  26.95 
 
 
950 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  26.38 
 
 
960 aa  226  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  27.01 
 
 
945 aa  226  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  26.74 
 
 
944 aa  226  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  28.19 
 
 
929 aa  225  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  26.07 
 
 
958 aa  225  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  28.19 
 
 
949 aa  225  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  27.86 
 
 
947 aa  224  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  27.35 
 
 
944 aa  221  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  27.24 
 
 
944 aa  220  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  27.04 
 
 
943 aa  219  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  25.45 
 
 
974 aa  218  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  27.16 
 
 
959 aa  218  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  28.1 
 
 
949 aa  217  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  32.48 
 
 
443 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  32.48 
 
 
443 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  32.48 
 
 
443 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  32.94 
 
 
422 aa  215  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  35.65 
 
 
457 aa  214  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  33.02 
 
 
442 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  35.89 
 
 
441 aa  212  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  31.32 
 
 
443 aa  211  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  31.68 
 
 
443 aa  209  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  31.68 
 
 
443 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  31.68 
 
 
443 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  31.44 
 
 
443 aa  207  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  35.41 
 
 
457 aa  205  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  32.38 
 
 
424 aa  204  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  32.94 
 
 
441 aa  204  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
428 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  30.97 
 
 
443 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  32.33 
 
 
443 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  31.49 
 
 
493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  25.59 
 
 
956 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  31.79 
 
 
443 aa  199  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  32.23 
 
 
443 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  31.07 
 
 
443 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  32.08 
 
 
461 aa  195  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  24.92 
 
 
930 aa  190  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  31.65 
 
 
440 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  27.02 
 
 
954 aa  188  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  30.98 
 
 
443 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  31.67 
 
 
447 aa  184  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  26.12 
 
 
903 aa  179  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  23.59 
 
 
910 aa  179  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  26.14 
 
 
901 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  27.5 
 
 
431 aa  172  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  29.38 
 
 
415 aa  172  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1139  M16 family peptidase  27.87 
 
 
413 aa  171  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  26.61 
 
 
518 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  27.98 
 
 
528 aa  171  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  28.44 
 
 
434 aa  171  8e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  31.76 
 
 
470 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  35.34 
 
 
967 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0119  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase)  27.71 
 
 
413 aa  167  5.9999999999999996e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.369766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  29.27 
 
 
466 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  25.84 
 
 
903 aa  166  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  33.72 
 
 
414 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  28.33 
 
 
465 aa  164  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.64 
 
 
452 aa  164  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>