More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0089 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  45.84 
 
 
962 aa  840    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  62.51 
 
 
929 aa  1135    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  44.38 
 
 
967 aa  729    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  48.68 
 
 
949 aa  869    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  49.28 
 
 
930 aa  895    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  63.19 
 
 
947 aa  1144    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  43.44 
 
 
952 aa  708    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  62.51 
 
 
949 aa  1134    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  40.02 
 
 
943 aa  638    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
921 aa  1881    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  43.55 
 
 
959 aa  730    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  45.62 
 
 
956 aa  817    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  48.69 
 
 
910 aa  823    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  45.72 
 
 
960 aa  840    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  34.89 
 
 
945 aa  535  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  36.84 
 
 
944 aa  531  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  35.33 
 
 
945 aa  525  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  34.96 
 
 
969 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  34.26 
 
 
974 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  33.44 
 
 
958 aa  512  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  34.72 
 
 
947 aa  511  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  33.48 
 
 
959 aa  509  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  34.89 
 
 
944 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  34.12 
 
 
952 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  35.45 
 
 
949 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  35.45 
 
 
949 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  34.96 
 
 
945 aa  503  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  35.01 
 
 
950 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  35.33 
 
 
949 aa  502  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  34.32 
 
 
943 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  35.63 
 
 
949 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  35.01 
 
 
944 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  35.01 
 
 
950 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  34.39 
 
 
947 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  34.9 
 
 
950 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  34.28 
 
 
944 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  33.05 
 
 
950 aa  482  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  34.32 
 
 
944 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  32.62 
 
 
954 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  38.57 
 
 
901 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  37.95 
 
 
903 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  38.26 
 
 
904 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  31.11 
 
 
954 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  46.71 
 
 
458 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  46.67 
 
 
458 aa  366  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  47.03 
 
 
458 aa  364  4e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  30.01 
 
 
896 aa  337  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  28.12 
 
 
937 aa  319  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.41 
 
 
945 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  41.95 
 
 
447 aa  298  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  43.06 
 
 
423 aa  279  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  27.73 
 
 
876 aa  278  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  27.66 
 
 
919 aa  267  8e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  39.9 
 
 
429 aa  266  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  27.47 
 
 
949 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  39.24 
 
 
442 aa  263  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  38.95 
 
 
470 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  40.29 
 
 
429 aa  257  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  24.7 
 
 
929 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  39.34 
 
 
427 aa  256  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  26.76 
 
 
934 aa  253  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  35.44 
 
 
440 aa  248  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  26.67 
 
 
918 aa  247  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  25.84 
 
 
853 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  25.58 
 
 
840 aa  240  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  26.94 
 
 
921 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  32.24 
 
 
440 aa  235  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  26.08 
 
 
948 aa  234  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  26.48 
 
 
942 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  36.59 
 
 
413 aa  232  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  25.83 
 
 
912 aa  231  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  34.08 
 
 
520 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  34.15 
 
 
519 aa  230  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  33.85 
 
 
520 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  24.41 
 
 
912 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  26.01 
 
 
957 aa  226  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  35.44 
 
 
464 aa  224  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  34.55 
 
 
414 aa  224  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  33.03 
 
 
442 aa  224  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  32.72 
 
 
443 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  32.72 
 
 
443 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  34.72 
 
 
422 aa  223  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  34.95 
 
 
411 aa  223  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  32.8 
 
 
461 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0362  peptidase M16 domain-containing protein  26.04 
 
 
910 aa  223  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.626365  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  32.49 
 
 
443 aa  222  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  33.1 
 
 
443 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  33.5 
 
 
443 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  32.42 
 
 
443 aa  218  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  34.4 
 
 
443 aa  218  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  31.81 
 
 
443 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  33.77 
 
 
470 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  32.8 
 
 
441 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  35.59 
 
 
436 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  36.68 
 
 
433 aa  217  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  34.46 
 
 
464 aa  214  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  32.05 
 
 
443 aa  214  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  32.05 
 
 
443 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  36.21 
 
 
439 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  31.81 
 
 
443 aa  213  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>