More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4079 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  53.37 
 
 
950 aa  1028    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  53.93 
 
 
945 aa  1003    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  50 
 
 
969 aa  910    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  100 
 
 
959 aa  1982    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  53.55 
 
 
949 aa  1016    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  53.47 
 
 
950 aa  1029    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  53.94 
 
 
944 aa  1029    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  53.77 
 
 
944 aa  1029    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  53.18 
 
 
944 aa  1025    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  47.36 
 
 
950 aa  889    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  50.73 
 
 
974 aa  978    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  45.43 
 
 
952 aa  840    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  53.02 
 
 
945 aa  1007    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  45.59 
 
 
947 aa  856    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  53.38 
 
 
958 aa  1033    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  46.71 
 
 
947 aa  870    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  55.14 
 
 
949 aa  1039    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  54.42 
 
 
949 aa  1038    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  53.73 
 
 
945 aa  1035    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  54.56 
 
 
943 aa  1035    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  55.21 
 
 
949 aa  1043    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  53.47 
 
 
950 aa  1030    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  53.31 
 
 
944 aa  1017    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  53.96 
 
 
944 aa  1030    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  34.03 
 
 
954 aa  522  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  33.55 
 
 
921 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  31.69 
 
 
947 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  31.17 
 
 
943 aa  459  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  31.25 
 
 
949 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  31.25 
 
 
929 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  30.8 
 
 
949 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  32 
 
 
962 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  33.06 
 
 
959 aa  425  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  30.82 
 
 
930 aa  422  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  32 
 
 
960 aa  422  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  31.45 
 
 
952 aa  416  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  30.93 
 
 
956 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  29.68 
 
 
910 aa  392  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  30.96 
 
 
967 aa  379  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  30.79 
 
 
901 aa  356  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  30.55 
 
 
903 aa  347  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 
954 aa  340  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  28.89 
 
 
904 aa  337  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  38.33 
 
 
458 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  38.1 
 
 
458 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  38.1 
 
 
458 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.32 
 
 
896 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  27.01 
 
 
929 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.2 
 
 
945 aa  283  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  27.67 
 
 
937 aa  278  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  26.84 
 
 
934 aa  258  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  33.81 
 
 
440 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  37.41 
 
 
470 aa  251  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  24.63 
 
 
876 aa  249  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  33.41 
 
 
440 aa  244  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  26.17 
 
 
918 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  26.67 
 
 
919 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  32.3 
 
 
422 aa  236  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  26.25 
 
 
942 aa  231  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  26.2 
 
 
949 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  33.8 
 
 
429 aa  228  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  33.1 
 
 
429 aa  225  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  36.15 
 
 
423 aa  221  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  24.1 
 
 
921 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  24.47 
 
 
957 aa  214  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  31.94 
 
 
447 aa  214  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  25.6 
 
 
948 aa  210  9e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  32.09 
 
 
442 aa  210  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  31.78 
 
 
427 aa  209  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  24.25 
 
 
853 aa  208  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  25.23 
 
 
912 aa  204  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  31.57 
 
 
452 aa  202  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  32.47 
 
 
453 aa  201  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  34.47 
 
 
489 aa  200  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  24.74 
 
 
928 aa  200  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  30.68 
 
 
457 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  29.4 
 
 
443 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  32.19 
 
 
442 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  30.68 
 
 
443 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  30.6 
 
 
441 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  33.33 
 
 
441 aa  196  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  30.56 
 
 
687 aa  196  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  31.63 
 
 
443 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  30.91 
 
 
443 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  32.83 
 
 
461 aa  195  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  31.63 
 
 
443 aa  195  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  31.28 
 
 
447 aa  195  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  29.73 
 
 
443 aa  195  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  30.12 
 
 
428 aa  195  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  30.98 
 
 
443 aa  194  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  30.75 
 
 
461 aa  194  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  30.19 
 
 
457 aa  194  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  32.56 
 
 
461 aa  194  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  29.64 
 
 
443 aa  194  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  32.98 
 
 
464 aa  193  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  29.08 
 
 
411 aa  193  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  23.96 
 
 
912 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  32.98 
 
 
467 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  29.52 
 
 
470 aa  192  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  29.35 
 
 
414 aa  191  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>