More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3008 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  67.99 
 
 		 934 aa  1312    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  47.58 
 
 		 942 aa  831    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  47.2 
 
 		 919 aa  855    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 918 aa  1892    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  47.06 
 
 		 948 aa  857    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  45.61 
 
 		 957 aa  830    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  40.57 
 
 		 912 aa  707    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  45.31 
 
 		 928 aa  801    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  53.33 
 
 		 912 aa  985    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  49.38 
 
 		 921 aa  884    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  60.55 
 
 		 949 aa  1128    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  36.96 
 
 		 903 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  31.12 
 
 		 929 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27040  zinc protease  27.66 
 
 		 908 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.883186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.05 
 
 		 945 aa  310  9e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.83 
 
 		 896 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.82 
 
 		 937 aa  290  9e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  38.77 
 
 		 464 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  36.92 
 
 		 439 aa  278  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  27.33 
 
 		 876 aa  277  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  28.36 
 
 		 969 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  28.32 
 
 		 943 aa  270  8.999999999999999e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  26.04 
 
 		 952 aa  262  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  27.44 
 
 		 974 aa  262  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  28.11 
 
 		 950 aa  262  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  26.29 
 
 		 952 aa  261  6e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  27.92 
 
 		 945 aa  259  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  27.63 
 
 		 945 aa  258  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  26.14 
 
 		 945 aa  257  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  26.47 
 
 		 947 aa  257  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  27.34 
 
 		 943 aa  257  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  26.14 
 
 		 947 aa  253  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  26.67 
 
 		 921 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  26.42 
 
 		 959 aa  243  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  26.91 
 
 		 959 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  25.95 
 
 		 944 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  26.15 
 
 		 944 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  25.85 
 
 		 950 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  26.23 
 
 		 958 aa  235  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  25.85 
 
 		 950 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  26.48 
 
 		 944 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  26.34 
 
 		 944 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  25.74 
 
 		 950 aa  234  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  26.42 
 
 		 949 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  26.6 
 
 		 944 aa  233  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  25.87 
 
 		 949 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  25.61 
 
 		 949 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  27.93 
 
 		 954 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  26.53 
 
 		 949 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  27.06 
 
 		 954 aa  223  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  25.99 
 
 		 962 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  25.91 
 
 		 960 aa  217  9e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  25.32 
 
 		 956 aa  214  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  25.25 
 
 		 930 aa  208  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  26.54 
 
 		 929 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  26.56 
 
 		 949 aa  205  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  25.92 
 
 		 947 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  31.02 
 
 		 443 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  31.02 
 
 		 443 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  31.89 
 
 		 442 aa  194  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  30.9 
 
 		 493 aa  194  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  25.06 
 
 		 949 aa  194  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  32.53 
 
 		 457 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  30.79 
 
 		 443 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  32.77 
 
 		 441 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  30.07 
 
 		 443 aa  190  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  30.56 
 
 		 443 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  30.3 
 
 		 443 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  30.56 
 
 		 443 aa  187  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  30.79 
 
 		 443 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  30.07 
 
 		 443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  30.07 
 
 		 443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  30.23 
 
 		 422 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  30.3 
 
 		 424 aa  185  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  30.19 
 
 		 428 aa  184  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  32.05 
 
 		 457 aa  184  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  30.91 
 
 		 443 aa  184  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  31.34 
 
 		 443 aa  182  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  30.4 
 
 		 459 aa  181  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  24.63 
 
 		 910 aa  181  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  30.24 
 
 		 440 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  31.06 
 
 		 466 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  24.38 
 
 		 868 aa  179  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  28.85 
 
 		 443 aa  178  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  27.55 
 
 		 431 aa  178  5e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  29.95 
 
 		 461 aa  177  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  31.69 
 
 		 441 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  29.09 
 
 		 453 aa  174  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  22.95 
 
 		 840 aa  174  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  28.28 
 
 		 442 aa  174  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  29.62 
 
 		 434 aa  172  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  28.99 
 
 		 443 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  30.79 
 
 		 447 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  28.05 
 
 		 459 aa  172  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0119  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase)  29.14 
 
 		 413 aa  171  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.369766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  29.08 
 
 		 461 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  28.05 
 
 		 416 aa  171  7e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  28.05 
 
 		 416 aa  171  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  29.65 
 
 		 463 aa  170  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  29.1 
 
 		 417 aa  169  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>