More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3596 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  45.24 
 
 		 921 aa  805    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  46.66 
 
 		 942 aa  784    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  51.48 
 
 		 934 aa  937    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  47.74 
 
 		 948 aa  840    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  49.09 
 
 		 949 aa  862    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  100 
 
 		 912 aa  1877    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  50.93 
 
 		 919 aa  932    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  43.23 
 
 		 957 aa  783    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  45.03 
 
 		 928 aa  737    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  37.89 
 
 		 912 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  53.33 
 
 		 918 aa  985    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  37.98 
 
 		 903 aa  628  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  31.61 
 
 		 929 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27040  zinc protease  28.67 
 
 		 908 aa  357  6.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.883186  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  40.74 
 
 		 464 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.54 
 
 		 896 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  27.45 
 
 		 876 aa  298  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  38.7 
 
 		 439 aa  288  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.21 
 
 		 945 aa  280  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  27.08 
 
 		 937 aa  247  6.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  26.02 
 
 		 921 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  28.09 
 
 		 929 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  28.09 
 
 		 949 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  26.48 
 
 		 952 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.68 
 
 		 945 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  25.11 
 
 		 947 aa  218  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  26.73 
 
 		 943 aa  217  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  31.68 
 
 		 431 aa  217  9e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  27.76 
 
 		 947 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  27.69 
 
 		 954 aa  215  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  26.05 
 
 		 969 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  25.26 
 
 		 944 aa  212  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  25.63 
 
 		 945 aa  210  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  25.03 
 
 		 958 aa  210  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  24.89 
 
 		 962 aa  210  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  25.66 
 
 		 944 aa  207  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  24.71 
 
 		 960 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  27.69 
 
 		 949 aa  207  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  24.1 
 
 		 943 aa  206  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  32.94 
 
 		 422 aa  206  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  25.44 
 
 		 944 aa  204  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  25.11 
 
 		 959 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  25.18 
 
 		 959 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  31.17 
 
 		 434 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  25.55 
 
 		 944 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  25.55 
 
 		 950 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  24.35 
 
 		 947 aa  201  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  25.33 
 
 		 950 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  25.9 
 
 		 952 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  25.44 
 
 		 950 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  25.3 
 
 		 944 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  32.24 
 
 		 424 aa  197  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  24.76 
 
 		 949 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  25.21 
 
 		 950 aa  197  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  30.62 
 
 		 493 aa  195  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0119  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase)  28.57 
 
 		 413 aa  194  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.369766  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  29.06 
 
 		 415 aa  194  5e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  24.62 
 
 		 974 aa  194  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1139  M16 family peptidase  29.1 
 
 		 413 aa  193  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  24.66 
 
 		 949 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  24.36 
 
 		 945 aa  192  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  30.22 
 
 		 442 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  24.11 
 
 		 954 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  25.11 
 
 		 930 aa  191  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  24.45 
 
 		 949 aa  191  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  32.11 
 
 		 441 aa  188  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  31.91 
 
 		 466 aa  187  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  31.86 
 
 		 457 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  29.84 
 
 		 443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  30.75 
 
 		 447 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  25.55 
 
 		 903 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  31.62 
 
 		 457 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  29.31 
 
 		 443 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  30.46 
 
 		 443 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  29.32 
 
 		 443 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  29.93 
 
 		 441 aa  183  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  29.09 
 
 		 443 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  29.09 
 
 		 443 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  27.74 
 
 		 526 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  30.28 
 
 		 443 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  29.09 
 
 		 443 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  31.29 
 
 		 470 aa  180  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  29.17 
 
 		 453 aa  180  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  30.02 
 
 		 440 aa  180  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  26.46 
 
 		 901 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  29.09 
 
 		 443 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  27.93 
 
 		 414 aa  178  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  30.07 
 
 		 428 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  29.09 
 
 		 443 aa  179  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  29.09 
 
 		 443 aa  178  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  27.45 
 
 		 520 aa  178  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  28.64 
 
 		 443 aa  177  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  24.53 
 
 		 949 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  27.61 
 
 		 416 aa  175  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  27.61 
 
 		 416 aa  175  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  30.86 
 
 		 411 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  28.54 
 
 		 443 aa  174  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  28.68 
 
 		 417 aa  174  6.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  29.93 
 
 		 470 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  29.69 
 
 		 461 aa  173  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>