More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1689 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  38.68 
 
 		 912 aa  636    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  44.71 
 
 		 948 aa  748    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  42.82 
 
 		 942 aa  708    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  45.13 
 
 		 934 aa  801    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  100 
 
 		 919 aa  1907    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  40.55 
 
 		 957 aa  696    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  41.84 
 
 		 921 aa  715    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  41.16 
 
 		 928 aa  709    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  50.93 
 
 		 912 aa  932    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  44.65 
 
 		 949 aa  781    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  47.2 
 
 		 918 aa  855    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  34.86 
 
 		 903 aa  544  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  29.92 
 
 		 929 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.47 
 
 		 896 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27040  zinc protease  26.52 
 
 		 908 aa  317  7e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.883186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  28.49 
 
 		 945 aa  317  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  40.58 
 
 		 439 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  27.61 
 
 		 876 aa  296  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  40.33 
 
 		 464 aa  286  8e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  27.46 
 
 		 921 aa  261  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26 
 
 		 937 aa  252  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.22 
 
 		 954 aa  249  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  26.25 
 
 		 958 aa  246  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  27.04 
 
 		 959 aa  240  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  27.47 
 
 		 944 aa  238  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  24.71 
 
 		 947 aa  237  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  26.67 
 
 		 959 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  25.75 
 
 		 962 aa  234  5e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  26.01 
 
 		 943 aa  234  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  25.49 
 
 		 952 aa  233  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  27.55 
 
 		 949 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  27.55 
 
 		 929 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  27.32 
 
 		 947 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  25.37 
 
 		 960 aa  231  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  27.03 
 
 		 944 aa  230  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  26.34 
 
 		 943 aa  230  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  27.2 
 
 		 945 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  26.9 
 
 		 950 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  24.97 
 
 		 952 aa  229  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  26.9 
 
 		 950 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  26.9 
 
 		 950 aa  227  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  23.99 
 
 		 947 aa  226  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  25.99 
 
 		 949 aa  224  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  26.57 
 
 		 944 aa  223  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  26.96 
 
 		 944 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.2 
 
 		 945 aa  221  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  27.77 
 
 		 949 aa  221  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  26.28 
 
 		 949 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  25.16 
 
 		 950 aa  220  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  26.24 
 
 		 949 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  26.15 
 
 		 944 aa  217  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  26.23 
 
 		 969 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  26.89 
 
 		 949 aa  213  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  25.63 
 
 		 956 aa  212  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  33.71 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  27.17 
 
 		 945 aa  204  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  26.3 
 
 		 974 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  25.45 
 
 		 930 aa  200  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  30.65 
 
 		 431 aa  195  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  29.82 
 
 		 415 aa  194  7e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  31.25 
 
 		 416 aa  194  8e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  31.25 
 
 		 416 aa  194  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  24.81 
 
 		 910 aa  193  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  25.08 
 
 		 954 aa  192  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  34.03 
 
 		 470 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  31.05 
 
 		 447 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  30.14 
 
 		 443 aa  193  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  30.82 
 
 		 493 aa  192  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1205  M16 family peptidase  30.5 
 
 		 416 aa  192  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.75942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  32.52 
 
 		 441 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  32.21 
 
 		 428 aa  191  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  30.73 
 
 		 422 aa  188  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  32.52 
 
 		 457 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  28.98 
 
 		 443 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  28.98 
 
 		 443 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0119  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase)  28.61 
 
 		 413 aa  186  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.369766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  29.63 
 
 		 440 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  31.99 
 
 		 441 aa  185  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  30.43 
 
 		 422 aa  185  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  32.03 
 
 		 457 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  31.99 
 
 		 441 aa  184  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  30.11 
 
 		 453 aa  184  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  28.76 
 
 		 443 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  31.21 
 
 		 470 aa  184  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  28.76 
 
 		 443 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  28.76 
 
 		 443 aa  183  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  28.76 
 
 		 443 aa  184  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  31.1 
 
 		 424 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  28.39 
 
 		 414 aa  182  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  29.4 
 
 		 442 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  29.08 
 
 		 443 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  28.98 
 
 		 440 aa  181  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  28.76 
 
 		 443 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  28.76 
 
 		 443 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  30.83 
 
 		 510 aa  180  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  34.24 
 
 		 469 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  28.43 
 
 		 518 aa  178  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  30.58 
 
 		 462 aa  177  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  31.65 
 
 		 504 aa  177  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  30.84 
 
 		 456 aa  177  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>