More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0240 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  47.06 
 
 		 918 aa  869    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  47.74 
 
 		 912 aa  856    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  47.14 
 
 		 949 aa  836    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 948 aa  1935    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  44.51 
 
 		 942 aa  744    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  42.63 
 
 		 921 aa  708    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  44.71 
 
 		 919 aa  761    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  43.28 
 
 		 957 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  45.9 
 
 		 928 aa  775    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  46.95 
 
 		 934 aa  863    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  37.06 
 
 		 912 aa  634  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  38.1 
 
 		 903 aa  621  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  29.98 
 
 		 929 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27040  zinc protease  29.06 
 
 		 908 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.883186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.43 
 
 		 945 aa  317  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.94 
 
 		 896 aa  317  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  27.83 
 
 		 876 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  41.83 
 
 		 439 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  40.92 
 
 		 464 aa  293  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  28.09 
 
 		 937 aa  284  7.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  26.72 
 
 		 969 aa  238  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  26.21 
 
 		 958 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  26.79 
 
 		 952 aa  234  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  26.57 
 
 		 921 aa  233  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  28.16 
 
 		 952 aa  228  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  27.17 
 
 		 959 aa  223  9e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  25.61 
 
 		 947 aa  222  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  26 
 
 		 947 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  27.57 
 
 		 943 aa  221  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.4 
 
 		 945 aa  218  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  27.4 
 
 		 949 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  27.4 
 
 		 929 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  25.23 
 
 		 950 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  34.67 
 
 		 424 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  27.35 
 
 		 947 aa  214  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  24.61 
 
 		 949 aa  212  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  33.57 
 
 		 493 aa  211  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  33.73 
 
 		 422 aa  211  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  26.36 
 
 		 959 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  24.92 
 
 		 945 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  24.41 
 
 		 949 aa  210  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  24.97 
 
 		 954 aa  209  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  24.01 
 
 		 949 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  24.79 
 
 		 944 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  24.69 
 
 		 950 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  24.17 
 
 		 944 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  27.4 
 
 		 974 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  25.77 
 
 		 944 aa  198  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  25.32 
 
 		 962 aa  199  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  26.22 
 
 		 950 aa  199  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  25.46 
 
 		 960 aa  198  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  24.59 
 
 		 950 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  24.73 
 
 		 943 aa  197  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  24.06 
 
 		 949 aa  196  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  25.03 
 
 		 903 aa  195  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  32.05 
 
 		 461 aa  195  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  30.75 
 
 		 442 aa  194  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  32.42 
 
 		 443 aa  194  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  34.84 
 
 		 428 aa  194  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  31.26 
 
 		 443 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  24.92 
 
 		 944 aa  190  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  30.35 
 
 		 443 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  31.25 
 
 		 470 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  31.02 
 
 		 443 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  33.41 
 
 		 457 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  30.95 
 
 		 441 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  30.57 
 
 		 443 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  33.49 
 
 		 441 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  24.48 
 
 		 956 aa  185  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  30.79 
 
 		 443 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  30.79 
 
 		 443 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  33.49 
 
 		 457 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  30.88 
 
 		 443 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  30.34 
 
 		 443 aa  184  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  25.9 
 
 		 949 aa  184  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  30.34 
 
 		 443 aa  184  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  28.86 
 
 		 431 aa  184  8.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  30.56 
 
 		 443 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  30.56 
 
 		 443 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  24.46 
 
 		 945 aa  183  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  25.91 
 
 		 944 aa  183  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  30.67 
 
 		 434 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  30 
 
 		 443 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  30.48 
 
 		 440 aa  182  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  30.14 
 
 		 453 aa  181  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  26 
 
 		 954 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  34.02 
 
 		 470 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  33.82 
 
 		 967 aa  178  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  29.43 
 
 		 414 aa  177  7e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  29.7 
 
 		 443 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  30.09 
 
 		 447 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  33.18 
 
 		 466 aa  174  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  30.64 
 
 		 411 aa  173  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  30.7 
 
 		 459 aa  170  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  28.99 
 
 		 415 aa  170  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  28.42 
 
 		 465 aa  169  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  30.39 
 
 		 470 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  24.57 
 
 		 930 aa  169  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  31.03 
 
 		 461 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  33.02 
 
 		 469 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>