More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5911 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  45.52 
 
 		 918 aa  834    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  69.99 
 
 		 942 aa  1255    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  42.17 
 
 		 948 aa  723    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  43.23 
 
 		 912 aa  785    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  48.38 
 
 		 921 aa  838    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  45.14 
 
 		 949 aa  789    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  40.22 
 
 		 919 aa  697    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  100 
 
 		 957 aa  1932    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  47.15 
 
 		 928 aa  774    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  47.42 
 
 		 934 aa  847    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  35.53 
 
 		 912 aa  609  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  36.88 
 
 		 903 aa  539  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27040  zinc protease  33.67 
 
 		 908 aa  429  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.883186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  29.88 
 
 		 929 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  30.34 
 
 		 876 aa  336  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.18 
 
 		 896 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  27.61 
 
 		 937 aa  270  8e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  26.23 
 
 		 945 aa  265  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  39.23 
 
 		 439 aa  264  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  38 
 
 		 464 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  27.52 
 
 		 959 aa  245  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  37.91 
 
 		 424 aa  236  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  36.36 
 
 		 422 aa  230  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  27.18 
 
 		 947 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  27.07 
 
 		 949 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  27.07 
 
 		 929 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  26.01 
 
 		 921 aa  225  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  27.74 
 
 		 954 aa  225  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  26.21 
 
 		 952 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  25.36 
 
 		 947 aa  222  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  33.19 
 
 		 493 aa  219  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  27.42 
 
 		 943 aa  217  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  25.06 
 
 		 947 aa  215  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  28.61 
 
 		 949 aa  212  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  24.71 
 
 		 959 aa  211  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.05 
 
 		 945 aa  211  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  25.03 
 
 		 969 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  24.09 
 
 		 958 aa  206  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  25.54 
 
 		 950 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  25.43 
 
 		 950 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  25.43 
 
 		 944 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  25.43 
 
 		 950 aa  199  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.06 
 
 		 945 aa  199  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  25.24 
 
 		 949 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  25.46 
 
 		 944 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  24.39 
 
 		 950 aa  196  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  26.57 
 
 		 944 aa  195  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 		 441 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  24.43 
 
 		 956 aa  194  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  33.57 
 
 		 457 aa  194  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  25.27 
 
 		 949 aa  194  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 		 457 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  25.24 
 
 		 949 aa  191  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  27.12 
 
 		 910 aa  191  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  33.73 
 
 		 428 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  25.27 
 
 		 949 aa  188  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  25.74 
 
 		 944 aa  188  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  24.66 
 
 		 962 aa  188  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  30.99 
 
 		 442 aa  188  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  27.59 
 
 		 431 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  24.87 
 
 		 960 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  29.79 
 
 		 443 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  29.79 
 
 		 443 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  30.9 
 
 		 465 aa  185  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  33.33 
 
 		 466 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  24.48 
 
 		 943 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  31.43 
 
 		 455 aa  184  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  26.81 
 
 		 945 aa  184  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  29.79 
 
 		 443 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  30.21 
 
 		 443 aa  183  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  29.55 
 
 		 443 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  25.09 
 
 		 974 aa  182  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  29.55 
 
 		 443 aa  181  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  30.59 
 
 		 443 aa  181  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  29.88 
 
 		 454 aa  181  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  31.11 
 
 		 434 aa  180  9e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  25.09 
 
 		 944 aa  180  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  30.68 
 
 		 441 aa  180  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  30.26 
 
 		 443 aa  180  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  31.48 
 
 		 461 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  25.42 
 
 		 930 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  29.37 
 
 		 901 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  30.02 
 
 		 443 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  29.09 
 
 		 504 aa  178  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  30.02 
 
 		 443 aa  178  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  31.64 
 
 		 453 aa  177  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  29.03 
 
 		 903 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  28.36 
 
 		 415 aa  176  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.62 
 
 		 506 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  25.16 
 
 		 954 aa  175  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  30.99 
 
 		 470 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  30.38 
 
 		 443 aa  175  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  30.58 
 
 		 443 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  30.1 
 
 		 443 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  30.27 
 
 		 443 aa  174  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  30.99 
 
 		 459 aa  174  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  29.23 
 
 		 447 aa  171  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  25.73 
 
 		 903 aa  171  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2243  peptidase M16 domain-containing protein  35.07 
 
 		 476 aa  171  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193562  normal  0.100659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  28.83 
 
 		 440 aa  171  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>