More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3796 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  100 
 
 		 433 aa  863    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0931  peptidase M16 domain-containing protein  81.07 
 
 		 428 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3747  peptidase M16 domain-containing protein  62.7 
 
 		 448 aa  537  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4128  peptidase M16 domain-containing protein  62.09 
 
 		 437 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  60.71 
 
 		 436 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  60.1 
 
 		 428 aa  491  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06870  predicted Zn-dependent peptidase  59.67 
 
 		 428 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.677092  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1775  peptidase M16 domain-containing protein  55.74 
 
 		 438 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  57.64 
 
 		 434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0081  peptidase M16 domain-containing protein  44.68 
 
 		 463 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2243  peptidase M16 domain-containing protein  39.01 
 
 		 476 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193562  normal  0.100659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  41.22 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  40.43 
 
 		 429 aa  245  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  38.8 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  38.94 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  38.94 
 
 		 458 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  37.07 
 
 		 470 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  34.62 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  36.03 
 
 		 411 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  33.9 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  36.68 
 
 		 921 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  38.68 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  33.82 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  33.91 
 
 		 411 aa  210  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  34.93 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  30.5 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  31.4 
 
 		 947 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  35.86 
 
 		 949 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  33.49 
 
 		 466 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  38.05 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  34.17 
 
 		 943 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  31.8 
 
 		 493 aa  202  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  33.25 
 
 		 950 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  34.49 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  32.77 
 
 		 453 aa  199  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  31.34 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  35.19 
 
 		 447 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  38.2 
 
 		 428 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  32.27 
 
 		 470 aa  196  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  34.72 
 
 		 956 aa  196  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  35.03 
 
 		 962 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  30 
 
 		 947 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  32.2 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  35.03 
 
 		 960 aa  193  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  31.81 
 
 		 489 aa  192  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  34.95 
 
 		 959 aa  192  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  35.97 
 
 		 967 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  36.34 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  33.41 
 
 		 930 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  33.96 
 
 		 947 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  37.15 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  36.06 
 
 		 457 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  31.58 
 
 		 493 aa  189  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  30.46 
 
 		 454 aa  189  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  33.49 
 
 		 929 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  33.49 
 
 		 949 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  30.3 
 
 		 455 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  31.89 
 
 		 952 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  31.98 
 
 		 470 aa  186  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  34.46 
 
 		 952 aa  186  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  31.45 
 
 		 465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  36.99 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  32.24 
 
 		 943 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  32.42 
 
 		 944 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  30.5 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  30.66 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  35.05 
 
 		 910 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  30.4 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  32.86 
 
 		 954 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  30.95 
 
 		 945 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  32.25 
 
 		 944 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  31.71 
 
 		 958 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  32.5 
 
 		 945 aa  179  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.57 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  31.05 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  28.61 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  31.59 
 
 		 944 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  30.57 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  31.73 
 
 		 954 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  39.6 
 
 		 901 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  39.93 
 
 		 903 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  31.49 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  29.08 
 
 		 443 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  32.43 
 
 		 949 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  31.54 
 
 		 945 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  28.91 
 
 		 550 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  30.22 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  29.31 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  31.37 
 
 		 484 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  29.58 
 
 		 443 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  31.02 
 
 		 949 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  28.09 
 
 		 501 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  30.77 
 
 		 950 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  36.67 
 
 		 959 aa  173  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  30.54 
 
 		 944 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  31.53 
 
 		 482 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  39.27 
 
 		 904 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  30.77 
 
 		 950 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  31.02 
 
 		 949 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  30.54 
 
 		 950 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>