More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5316 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  44.27 
 
 
948 aa  748    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  46.23 
 
 
934 aa  847    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  45.14 
 
 
949 aa  806    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  100 
 
 
942 aa  1905    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  48.58 
 
 
921 aa  855    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  46.34 
 
 
912 aa  803    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  46.7 
 
 
918 aa  857    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  42.66 
 
 
919 aa  722    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  69.92 
 
 
957 aa  1274    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  47.72 
 
 
928 aa  779    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  33.99 
 
 
912 aa  582  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  37.07 
 
 
903 aa  553  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27040  zinc protease  34.18 
 
 
908 aa  428  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.883186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  28.06 
 
 
929 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  30.57 
 
 
876 aa  337  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  31.16 
 
 
896 aa  337  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  28.67 
 
 
937 aa  294  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.31 
 
 
945 aa  278  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  39.05 
 
 
439 aa  272  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  38.19 
 
 
464 aa  264  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.69 
 
 
954 aa  264  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  27.41 
 
 
959 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  26.53 
 
 
921 aa  241  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  26.34 
 
 
959 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  28.08 
 
 
949 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  37.05 
 
 
424 aa  233  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  24.71 
 
 
947 aa  229  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  35.81 
 
 
422 aa  229  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  26.19 
 
 
962 aa  228  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  27.18 
 
 
949 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  28.13 
 
 
929 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  25.65 
 
 
960 aa  225  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  28.85 
 
 
947 aa  224  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  25.78 
 
 
956 aa  223  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.18 
 
 
945 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  24.81 
 
 
969 aa  220  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  23.68 
 
 
947 aa  219  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  26.81 
 
 
952 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  32.77 
 
 
493 aa  218  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  24.38 
 
 
952 aa  216  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  26.12 
 
 
943 aa  216  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  24.53 
 
 
958 aa  213  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  23.72 
 
 
950 aa  209  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  30.52 
 
 
431 aa  207  5e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  33.18 
 
 
428 aa  207  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  31.76 
 
 
465 aa  204  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  26.71 
 
 
944 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  26.59 
 
 
950 aa  201  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  26.71 
 
 
950 aa  201  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  34.67 
 
 
466 aa  200  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  26.71 
 
 
950 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  26.41 
 
 
944 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  31.96 
 
 
441 aa  197  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  31.75 
 
 
443 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  25.93 
 
 
974 aa  196  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  25.71 
 
 
949 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  31.96 
 
 
457 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  26.01 
 
 
903 aa  194  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  31.52 
 
 
443 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  31.52 
 
 
443 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  25.88 
 
 
949 aa  193  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  26.47 
 
 
944 aa  193  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  26.52 
 
 
949 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  31.72 
 
 
457 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  24.6 
 
 
945 aa  192  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  31.28 
 
 
443 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  25.78 
 
 
949 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  25.2 
 
 
930 aa  192  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  31.52 
 
 
443 aa  190  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  31.61 
 
 
470 aa  190  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  30.09 
 
 
442 aa  190  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  30.39 
 
 
443 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  31.04 
 
 
443 aa  189  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  31.71 
 
 
443 aa  188  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  31.5 
 
 
443 aa  188  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  25.13 
 
 
954 aa  187  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  31.91 
 
 
492 aa  187  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  25.68 
 
 
944 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  30.93 
 
 
441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  31.28 
 
 
443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  31.28 
 
 
455 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  31.04 
 
 
443 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  31.04 
 
 
443 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  27.85 
 
 
901 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  31.28 
 
 
443 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  24.72 
 
 
943 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  29.6 
 
 
504 aa  184  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  26.16 
 
 
945 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  31.53 
 
 
461 aa  184  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  29.98 
 
 
454 aa  182  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  28.86 
 
 
434 aa  183  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  26.03 
 
 
944 aa  183  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.36 
 
 
506 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  29.21 
 
 
468 aa  178  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  30.79 
 
 
453 aa  177  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  30.91 
 
 
443 aa  177  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  31.29 
 
 
459 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  28.87 
 
 
442 aa  176  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  33.08 
 
 
477 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  32.88 
 
 
479 aa  175  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>