More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2253 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  37.89 
 
 
912 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  40.57 
 
 
918 aa  707    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  38.68 
 
 
919 aa  636    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  43.35 
 
 
949 aa  748    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
912 aa  1858    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  40.77 
 
 
934 aa  723    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  37.06 
 
 
948 aa  622  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  36.23 
 
 
957 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  34.57 
 
 
921 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  35.24 
 
 
928 aa  590  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  34.4 
 
 
942 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  31.96 
 
 
903 aa  499  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  28.78 
 
 
929 aa  357  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27040  zinc protease  25.84 
 
 
908 aa  317  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.883186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.29 
 
 
896 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  34.66 
 
 
439 aa  267  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  36.58 
 
 
464 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  25.28 
 
 
876 aa  258  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  25.64 
 
 
945 aa  257  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  27.41 
 
 
969 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  26.16 
 
 
954 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.55 
 
 
937 aa  242  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  27.11 
 
 
943 aa  240  8e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  26.96 
 
 
952 aa  225  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  25.6 
 
 
947 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  24.38 
 
 
921 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  25.47 
 
 
947 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  25.89 
 
 
944 aa  220  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  24.9 
 
 
950 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  26.66 
 
 
958 aa  218  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.24 
 
 
945 aa  218  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  26.62 
 
 
949 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  26.21 
 
 
945 aa  213  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  26.34 
 
 
944 aa  213  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  25.94 
 
 
949 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  26.94 
 
 
949 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  25.67 
 
 
944 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  25.85 
 
 
949 aa  208  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  25.89 
 
 
944 aa  205  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  23.91 
 
 
962 aa  204  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  26.46 
 
 
944 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  26.86 
 
 
950 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  24.01 
 
 
959 aa  202  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  26.33 
 
 
950 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  26.33 
 
 
950 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  25.72 
 
 
943 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  25.68 
 
 
949 aa  197  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  23.8 
 
 
960 aa  195  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  24.86 
 
 
949 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  24.86 
 
 
929 aa  195  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  33.57 
 
 
443 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  23.09 
 
 
952 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  33.56 
 
 
461 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  32.78 
 
 
443 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  24.78 
 
 
947 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  32.55 
 
 
431 aa  191  5.999999999999999e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  24.91 
 
 
959 aa  190  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  32.55 
 
 
443 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  25.68 
 
 
930 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  24.13 
 
 
974 aa  189  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  32.55 
 
 
443 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  31.31 
 
 
441 aa  188  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  33.8 
 
 
443 aa  188  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  31.07 
 
 
441 aa  187  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  25.45 
 
 
945 aa  187  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  29.63 
 
 
422 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  30.86 
 
 
424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  33.87 
 
 
441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1139  M16 family peptidase  32.45 
 
 
413 aa  185  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  30.24 
 
 
440 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  32.48 
 
 
443 aa  184  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  28.07 
 
 
465 aa  183  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  31.28 
 
 
416 aa  182  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  24.89 
 
 
954 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  28.67 
 
 
453 aa  182  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  31.28 
 
 
416 aa  182  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  32.16 
 
 
443 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  31.07 
 
 
443 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  27.14 
 
 
443 aa  181  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  31.4 
 
 
442 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  32.16 
 
 
443 aa  179  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  32.64 
 
 
443 aa  178  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  31.92 
 
 
443 aa  178  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  31.92 
 
 
443 aa  177  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  28.9 
 
 
457 aa  177  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  31.06 
 
 
443 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  28.9 
 
 
441 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  29.98 
 
 
453 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  30.71 
 
 
415 aa  176  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1205  M16 family peptidase  30.54 
 
 
416 aa  175  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.75942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  28.9 
 
 
457 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  29.22 
 
 
489 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  30.28 
 
 
447 aa  174  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  22.13 
 
 
840 aa  174  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  28.84 
 
 
466 aa  174  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  27.66 
 
 
428 aa  171  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  27.67 
 
 
470 aa  171  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  26.48 
 
 
493 aa  170  9e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  30.73 
 
 
417 aa  169  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  27.79 
 
 
462 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>