More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4238 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
436 aa  874    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  60.71 
 
 
433 aa  504  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4128  peptidase M16 domain-containing protein  59.24 
 
 
437 aa  481  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3747  peptidase M16 domain-containing protein  58.19 
 
 
448 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0931  peptidase M16 domain-containing protein  59.05 
 
 
428 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1775  peptidase M16 domain-containing protein  57.55 
 
 
438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  56.53 
 
 
428 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06870  predicted Zn-dependent peptidase  54.83 
 
 
428 aa  455  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.677092  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  56.81 
 
 
434 aa  441  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0081  peptidase M16 domain-containing protein  44.05 
 
 
463 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2243  peptidase M16 domain-containing protein  36.18 
 
 
476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193562  normal  0.100659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  41.95 
 
 
429 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  41.22 
 
 
429 aa  243  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  38.78 
 
 
458 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  38.54 
 
 
458 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  38.54 
 
 
458 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  37.5 
 
 
470 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  33.49 
 
 
947 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  34.31 
 
 
411 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  35.59 
 
 
921 aa  216  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  35.9 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  34.06 
 
 
950 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  35.71 
 
 
466 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  32.2 
 
 
414 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  37.65 
 
 
447 aa  209  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  33.1 
 
 
947 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  36.65 
 
 
457 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  32.62 
 
 
411 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  33.95 
 
 
952 aa  206  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  30.73 
 
 
440 aa  206  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  30.64 
 
 
440 aa  206  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  35.93 
 
 
959 aa  206  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  33.01 
 
 
945 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  38.24 
 
 
442 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  36.41 
 
 
428 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  33.5 
 
 
413 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  33.66 
 
 
954 aa  203  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  36.89 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  40.58 
 
 
423 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  30.32 
 
 
454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  36.8 
 
 
457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  34.71 
 
 
952 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  33.96 
 
 
465 aa  196  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  31.74 
 
 
930 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  33.74 
 
 
943 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 
413 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  33.17 
 
 
954 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  34.15 
 
 
453 aa  192  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  36.96 
 
 
967 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  36.51 
 
 
949 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  32.24 
 
 
943 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  30.63 
 
 
441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  33.41 
 
 
470 aa  190  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  33.33 
 
 
949 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  30.39 
 
 
441 aa  189  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  30.62 
 
 
459 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
950 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  32.18 
 
 
504 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
950 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  29.48 
 
 
455 aa  189  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  32.5 
 
 
950 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  33.41 
 
 
944 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  37.15 
 
 
427 aa  188  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  32.48 
 
 
949 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  30.02 
 
 
442 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  32.48 
 
 
949 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  29.79 
 
 
459 aa  186  7e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  31.48 
 
 
443 aa  186  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  32.25 
 
 
949 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  33.57 
 
 
945 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  33.5 
 
 
944 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  33.5 
 
 
945 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  32.08 
 
 
499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  31.64 
 
 
441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  30.86 
 
 
461 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  31.93 
 
 
443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  33.6 
 
 
411 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  32.35 
 
 
959 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  36.08 
 
 
479 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  32.46 
 
 
944 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  31.11 
 
 
974 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  30.21 
 
 
493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  33.49 
 
 
489 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.35 
 
 
452 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  32.69 
 
 
944 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  31.81 
 
 
442 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  39.22 
 
 
903 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  39.22 
 
 
901 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  39.22 
 
 
904 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  33.96 
 
 
484 aa  179  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  32.1 
 
 
501 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  34.2 
 
 
962 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  31.78 
 
 
492 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  30.79 
 
 
958 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  34.93 
 
 
910 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  30.14 
 
 
443 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  30.93 
 
 
443 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  33.02 
 
 
459 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  31.58 
 
 
443 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  30.28 
 
 
443 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>