More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0535 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  88.34 
 
 
943 aa  1713    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  77.02 
 
 
935 aa  1476    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  77.12 
 
 
935 aa  1475    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  97.73 
 
 
924 aa  1843    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
943 aa  1921    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  77.73 
 
 
948 aa  1508    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  91.83 
 
 
943 aa  1779    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  76.91 
 
 
935 aa  1470    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  76.91 
 
 
934 aa  1467    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  36.81 
 
 
963 aa  536  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  33.3 
 
 
948 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  33.15 
 
 
948 aa  452  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  31.64 
 
 
974 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  28.95 
 
 
1442 aa  397  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  29.94 
 
 
948 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  30.05 
 
 
947 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  30.67 
 
 
979 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  28.5 
 
 
932 aa  331  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  27.72 
 
 
958 aa  328  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  26.46 
 
 
961 aa  310  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  27.15 
 
 
963 aa  270  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  26 
 
 
1005 aa  255  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  23.92 
 
 
978 aa  239  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  24.19 
 
 
936 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  24.43 
 
 
950 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  23.4 
 
 
941 aa  193  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  24.72 
 
 
955 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  23.81 
 
 
938 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  24.57 
 
 
928 aa  185  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  22.51 
 
 
954 aa  178  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  23.46 
 
 
937 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  27.11 
 
 
927 aa  164  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  23.15 
 
 
927 aa  160  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  23.07 
 
 
927 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  22.56 
 
 
927 aa  159  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  34.51 
 
 
916 aa  159  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  22.43 
 
 
938 aa  159  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  22.96 
 
 
927 aa  159  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  23.04 
 
 
931 aa  158  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  23.04 
 
 
931 aa  158  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  22.96 
 
 
927 aa  158  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  23.13 
 
 
926 aa  157  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  23.04 
 
 
927 aa  156  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  22.56 
 
 
915 aa  156  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  23.57 
 
 
933 aa  152  3e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  31.47 
 
 
932 aa  138  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  33.18 
 
 
912 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  33.48 
 
 
918 aa  136  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  23.46 
 
 
912 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  23.6 
 
 
922 aa  136  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  30.14 
 
 
916 aa  133  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  22.93 
 
 
940 aa  115  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  31.1 
 
 
924 aa  110  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  20.57 
 
 
992 aa  106  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.3 
 
 
942 aa  105  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  30.48 
 
 
913 aa  104  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  28.68 
 
 
1032 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  28.3 
 
 
925 aa  100  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  30.57 
 
 
1088 aa  97.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  30.57 
 
 
1088 aa  97.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  30.62 
 
 
879 aa  93.2  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  30.43 
 
 
455 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  23.12 
 
 
878 aa  90.1  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  32.31 
 
 
464 aa  90.1  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  23.47 
 
 
439 aa  88.6  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  27.85 
 
 
967 aa  87.4  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  24.3 
 
 
489 aa  86.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  30.7 
 
 
464 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  28.08 
 
 
513 aa  86.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  31.7 
 
 
476 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  27.59 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  29.57 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  29.87 
 
 
461 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  31.25 
 
 
868 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  33.49 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  23.65 
 
 
493 aa  84.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  31.65 
 
 
440 aa  83.2  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  30.48 
 
 
937 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  31.86 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3989  hypothetical protein  27.73 
 
 
481 aa  82  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.801432  normal  0.0802476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3821  protein YhjJ  27.73 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3929  hypothetical protein  27.73 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0881778  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3808  protein YhjJ  27.73 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3885  hypothetical protein  27.73 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  30.14 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  31.8 
 
 
853 aa  80.9  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  25.32 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  22.79 
 
 
530 aa  80.5  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  28.17 
 
 
419 aa  79.7  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  30.84 
 
 
433 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  31.63 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  28.76 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  31.22 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  28.45 
 
 
427 aa  79  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1890  M16 family peptidase  23.21 
 
 
414 aa  79  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3445  peptidase M16 domain-containing protein  30.84 
 
 
490 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  29.89 
 
 
415 aa  79  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3924  peptidase M16 domain-containing protein  27.6 
 
 
497 aa  78.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  26.95 
 
 
943 aa  78.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2179  M16 family peptidase  23.21 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>