More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1400 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
958 aa  1960    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  38.23 
 
 
979 aa  590  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  31 
 
 
1442 aa  426  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  30.23 
 
 
974 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  30.6 
 
 
963 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  30.51 
 
 
932 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  30.36 
 
 
948 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  31.43 
 
 
963 aa  375  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  28.83 
 
 
948 aa  352  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  31.17 
 
 
1005 aa  349  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  29.19 
 
 
947 aa  346  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  28.18 
 
 
943 aa  336  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  27.85 
 
 
934 aa  332  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  27.36 
 
 
950 aa  330  8e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  27.72 
 
 
943 aa  328  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  27.57 
 
 
935 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  28.06 
 
 
924 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  27.95 
 
 
943 aa  325  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  27.62 
 
 
935 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  27.46 
 
 
935 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  27.14 
 
 
948 aa  320  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  25.67 
 
 
936 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  27.61 
 
 
948 aa  276  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  25.13 
 
 
937 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  27.28 
 
 
978 aa  266  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  23.43 
 
 
954 aa  260  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  24.46 
 
 
955 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  25.27 
 
 
961 aa  253  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  23.8 
 
 
938 aa  250  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  30.44 
 
 
928 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  23.45 
 
 
941 aa  214  7.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  23.2 
 
 
927 aa  209  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  22.65 
 
 
932 aa  209  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  23.1 
 
 
912 aa  203  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  21.75 
 
 
912 aa  195  4e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  24.54 
 
 
927 aa  193  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  24.35 
 
 
927 aa  191  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  24.17 
 
 
927 aa  191  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  24.29 
 
 
931 aa  191  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  24.29 
 
 
931 aa  191  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  24.26 
 
 
926 aa  190  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  24.41 
 
 
927 aa  190  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  21.04 
 
 
933 aa  189  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  24.17 
 
 
927 aa  189  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  24.29 
 
 
927 aa  188  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  21.35 
 
 
915 aa  174  5.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  25.04 
 
 
992 aa  172  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  23.76 
 
 
922 aa  164  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  21.04 
 
 
938 aa  152  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  35.89 
 
 
918 aa  147  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  33.21 
 
 
916 aa  147  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  33.48 
 
 
916 aa  129  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  34.35 
 
 
913 aa  127  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  26.51 
 
 
940 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  32.33 
 
 
925 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 
924 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  24.83 
 
 
1032 aa  115  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4069  M16 family peptidase  31.38 
 
 
499 aa  111  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.187129 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0100  peptidase M16 domain-containing protein  31.38 
 
 
499 aa  111  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4063  M16 family peptidase  31.38 
 
 
499 aa  111  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  24.35 
 
 
1088 aa  110  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  24.35 
 
 
1088 aa  110  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4077  peptidase M16 domain protein  30 
 
 
485 aa  102  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3924  peptidase M16 domain-containing protein  28.81 
 
 
497 aa  102  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  31.53 
 
 
878 aa  101  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  32.91 
 
 
458 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  32.91 
 
 
458 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  32.91 
 
 
458 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0154  peptidase M16 domain-containing protein  30.42 
 
 
497 aa  95.9  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.389358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  30.97 
 
 
937 aa  94.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  31.02 
 
 
868 aa  93.2  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03375  predicted zinc-dependent peptidase  23.53 
 
 
498 aa  92.4  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0186  peptidase M16 domain protein  23.53 
 
 
498 aa  92.4  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3730  M16 family peptidase  23.53 
 
 
498 aa  92.4  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4015  M16 family peptidase  23.53 
 
 
498 aa  92.4  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03328  hypothetical protein  23.53 
 
 
498 aa  92.4  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4891  peptidase, M16 (pitrilysin) family  23.53 
 
 
498 aa  92.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271502  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0190  peptidase M16 domain-containing protein  23.53 
 
 
498 aa  92.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3933  peptidase, M16 (pitrilysin) family  23.53 
 
 
498 aa  92.4  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3885  hypothetical protein  26.34 
 
 
495 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3929  hypothetical protein  26.34 
 
 
495 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0881778  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3821  protein YhjJ  26.34 
 
 
495 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3989  hypothetical protein  26.34 
 
 
481 aa  92  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.801432  normal  0.0802476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  31.25 
 
 
464 aa  91.7  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3808  protein YhjJ  26.34 
 
 
495 aa  91.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3835  M16 family peptidase  27.24 
 
 
498 aa  91.7  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.173464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  34.96 
 
 
448 aa  90.5  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1699  M16 family peptidase  31.05 
 
 
872 aa  90.5  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  29.37 
 
 
461 aa  89.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  29.35 
 
 
853 aa  89  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  32.35 
 
 
476 aa  89  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  30.09 
 
 
459 aa  88.6  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3889  peptidase M16 domain protein  29.05 
 
 
491 aa  88.2  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  31.47 
 
 
489 aa  87.8  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  31.25 
 
 
433 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  31.03 
 
 
461 aa  87.8  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  30.8 
 
 
451 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  31.67 
 
 
459 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  32.89 
 
 
429 aa  87  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  31 
 
 
451 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>