More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1038 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  100 
 
 
948 aa  1898    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  42.23 
 
 
963 aa  704    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  39.11 
 
 
948 aa  557  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  34.24 
 
 
935 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  34.1 
 
 
934 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  33.81 
 
 
935 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  33.52 
 
 
948 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
935 aa  489  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  33.88 
 
 
943 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  33.48 
 
 
943 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  33.48 
 
 
924 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  33.15 
 
 
943 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  34.97 
 
 
974 aa  462  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  32.74 
 
 
947 aa  445  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  32.84 
 
 
948 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  33.09 
 
 
979 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  29.29 
 
 
1442 aa  409  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  30.45 
 
 
978 aa  340  5e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  29.12 
 
 
961 aa  330  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  27.08 
 
 
958 aa  311  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  29.24 
 
 
932 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  24.95 
 
 
936 aa  277  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  24.64 
 
 
954 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  26.26 
 
 
937 aa  252  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  27.33 
 
 
963 aa  243  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  24.97 
 
 
955 aa  237  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  28.52 
 
 
1005 aa  221  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  23.43 
 
 
950 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  24.27 
 
 
938 aa  214  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  22.88 
 
 
941 aa  213  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  25.35 
 
 
928 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  24.73 
 
 
932 aa  181  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  21.7 
 
 
938 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  36.57 
 
 
916 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  27.14 
 
 
927 aa  167  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  34.22 
 
 
933 aa  159  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  33.33 
 
 
915 aa  158  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  35.62 
 
 
912 aa  154  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  33.46 
 
 
922 aa  154  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  34.11 
 
 
918 aa  154  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  30.93 
 
 
912 aa  150  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  35.92 
 
 
927 aa  144  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  35.92 
 
 
927 aa  144  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  35.92 
 
 
931 aa  144  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  35.92 
 
 
931 aa  144  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  35.92 
 
 
927 aa  144  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  34.72 
 
 
916 aa  144  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  35.92 
 
 
927 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  35.44 
 
 
926 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  35.44 
 
 
927 aa  141  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  35.44 
 
 
927 aa  141  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  34.91 
 
 
913 aa  124  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  24.96 
 
 
992 aa  124  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  27.67 
 
 
924 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  26.23 
 
 
940 aa  119  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  24.32 
 
 
925 aa  109  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  24.32 
 
 
868 aa  108  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  20.23 
 
 
1032 aa  107  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  33.5 
 
 
878 aa  103  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  29.69 
 
 
879 aa  96.3  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  29.36 
 
 
1088 aa  95.5  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  29.36 
 
 
1088 aa  95.5  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3821  protein YhjJ  22.72 
 
 
495 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3929  hypothetical protein  22.72 
 
 
495 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0881778  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3885  hypothetical protein  22.72 
 
 
495 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  30.8 
 
 
949 aa  95.1  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3808  protein YhjJ  22.87 
 
 
495 aa  94.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  30.8 
 
 
929 aa  94.7  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3989  hypothetical protein  22.73 
 
 
481 aa  94.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.801432  normal  0.0802476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  30.91 
 
 
967 aa  94  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  31.25 
 
 
947 aa  94.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  29.52 
 
 
443 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1286  M16 family metallopeptidase  25.67 
 
 
966 aa  92  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  30.83 
 
 
440 aa  92.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1462  peptidase M16 domain protein  33.04 
 
 
413 aa  91.3  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.287908  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  30.29 
 
 
461 aa  90.9  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  32.56 
 
 
439 aa  90.5  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  29.41 
 
 
937 aa  90.9  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  33.19 
 
 
427 aa  90.1  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3924  peptidase M16 domain-containing protein  21.74 
 
 
497 aa  89.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  31.38 
 
 
440 aa  89  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  30.64 
 
 
482 aa  89  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6664  peptidase M16 domain protein  32.03 
 
 
452 aa  89  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  30.96 
 
 
489 aa  88.6  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  31.51 
 
 
470 aa  88.2  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  32.17 
 
 
947 aa  88.2  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  32.27 
 
 
464 aa  88.2  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  31.11 
 
 
943 aa  88.2  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  28.94 
 
 
921 aa  88.2  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  34.09 
 
 
901 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03375  predicted zinc-dependent peptidase  22.98 
 
 
498 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0186  peptidase M16 domain protein  22.98 
 
 
498 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3835  M16 family peptidase  22.98 
 
 
498 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.173464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  30.2 
 
 
413 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3730  M16 family peptidase  22.98 
 
 
498 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0190  peptidase M16 domain-containing protein  22.98 
 
 
498 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4015  M16 family peptidase  22.98 
 
 
498 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03328  hypothetical protein  22.98 
 
 
498 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4891  peptidase, M16 (pitrilysin) family  22.98 
 
 
498 aa  87  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271502  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  29.71 
 
 
493 aa  86.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>