More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3055 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  42.81 
 
 		 955 aa  737    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  42.65 
 
 		 938 aa  745    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  42.15 
 
 		 936 aa  724    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 937 aa  1936    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  41.82 
 
 		 954 aa  734    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  34.62 
 
 		 928 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  31.12 
 
 		 941 aa  467  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  32.21 
 
 		 932 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  29.95 
 
 		 938 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  27.41 
 
 		 933 aa  343  1e-92  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  26.46 
 
 		 912 aa  302  2e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  27.9 
 
 		 912 aa  296  2e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  26.7 
 
 		 1442 aa  280  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  25.34 
 
 		 958 aa  277  6e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  27.88 
 
 		 974 aa  271  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  23.94 
 
 		 927 aa  261  5.0000000000000005e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  26.95 
 
 		 947 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0818979 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  26.36 
 
 		 927 aa  258  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  26.46 
 
 		 927 aa  258  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  26.25 
 
 		 931 aa  257  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  26.25 
 
 		 931 aa  257  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  26.36 
 
 		 927 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  26.04 
 
 		 979 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  25.53 
 
 		 992 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  26.25 
 
 		 926 aa  255  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  26.14 
 
 		 927 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  25.79 
 
 		 927 aa  253  9.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  25.81 
 
 		 927 aa  253  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  24.3 
 
 		 915 aa  250  8e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  25.79 
 
 		 948 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  26.27 
 
 		 948 aa  248  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  25.47 
 
 		 950 aa  241  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  25.29 
 
 		 963 aa  228  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  27 
 
 		 1005 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  23.55 
 
 		 948 aa  211  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  24.79 
 
 		 932 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  23.32 
 
 		 922 aa  203  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  23.08 
 
 		 961 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  22.29 
 
 		 978 aa  190  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  31.68 
 
 		 963 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  24.03 
 
 		 948 aa  183  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  23.46 
 
 		 943 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  24.94 
 
 		 934 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  25.12 
 
 		 935 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  23.54 
 
 		 924 aa  180  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  24.55 
 
 		 943 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  22.9 
 
 		 925 aa  179  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  22.86 
 
 		 924 aa  179  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  25.15 
 
 		 935 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  22.55 
 
 		 943 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  24.94 
 
 		 935 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  22.65 
 
 		 913 aa  170  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  22.28 
 
 		 916 aa  169  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  22.33 
 
 		 916 aa  156  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  21.47 
 
 		 918 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  21.71 
 
 		 940 aa  144  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  23.64 
 
 		 1032 aa  115  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  26.65 
 
 		 1088 aa  103  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  26.65 
 
 		 1088 aa  103  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  30.25 
 
 		 853 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  26.19 
 
 		 455 aa  98.2  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 		 937 aa  95.9  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  21.21 
 
 		 945 aa  94.4  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  29.6 
 
 		 878 aa  93.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  27.47 
 
 		 514 aa  93.2  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  25.54 
 
 		 489 aa  92.4  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  27.25 
 
 		 499 aa  90.1  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  25.9 
 
 		 513 aa  90.1  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  21.78 
 
 		 912 aa  89.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  25.91 
 
 		 453 aa  88.2  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  23 
 
 		 958 aa  88.2  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  23.76 
 
 		 459 aa  88.2  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  22.58 
 
 		 868 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  24.94 
 
 		 443 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  25.98 
 
 		 461 aa  87.4  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  23.18 
 
 		 879 aa  87  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  25.3 
 
 		 451 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  24.94 
 
 		 443 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  27.79 
 
 		 451 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  23.31 
 
 		 442 aa  87  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  24.3 
 
 		 439 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  29.12 
 
 		 451 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  24.94 
 
 		 443 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  22.55 
 
 		 943 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  24.49 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  25.93 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  24.72 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  26.28 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  25.45 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  25.66 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2179  M16 family peptidase  29.23 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  25.45 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  28.61 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  24.72 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1890  M16 family peptidase  28.38 
 
 		 414 aa  84  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  28.82 
 
 		 451 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  24.44 
 
 		 462 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  25 
 
 		 447 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  25.37 
 
 		 464 aa  83.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  25.96 
 
 		 443 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>