More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5397 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  42.68 
 
 
937 aa  731    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  47.65 
 
 
954 aa  873    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
955 aa  1956    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  56.68 
 
 
936 aa  1085    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  45.35 
 
 
938 aa  832    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  37.6 
 
 
928 aa  595  1e-168  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  34.64 
 
 
941 aa  530  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  33.95 
 
 
932 aa  496  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  32.21 
 
 
938 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  28.35 
 
 
912 aa  361  5e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  28.16 
 
 
992 aa  356  8.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  31.11 
 
 
912 aa  351  4e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  29.01 
 
 
915 aa  330  8e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  31.15 
 
 
933 aa  330  1.0000000000000001e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  25.55 
 
 
927 aa  328  3e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  26.55 
 
 
927 aa  300  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  26.45 
 
 
927 aa  298  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  26.45 
 
 
927 aa  299  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  26.45 
 
 
931 aa  297  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  26.45 
 
 
931 aa  297  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  26.45 
 
 
927 aa  296  9e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  26.45 
 
 
927 aa  294  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  26.34 
 
 
927 aa  294  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  26.39 
 
 
926 aa  293  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  26.47 
 
 
974 aa  280  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  25.67 
 
 
1442 aa  271  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  26.5 
 
 
963 aa  270  8e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  24.6 
 
 
947 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  24.61 
 
 
948 aa  265  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  24.46 
 
 
958 aa  259  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  26.13 
 
 
979 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  25.63 
 
 
922 aa  231  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  25.56 
 
 
950 aa  226  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  23.73 
 
 
963 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  23.27 
 
 
948 aa  218  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  25.13 
 
 
948 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  25.19 
 
 
932 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  22.45 
 
 
913 aa  206  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  24.38 
 
 
918 aa  201  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  26.45 
 
 
1005 aa  201  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  23.78 
 
 
924 aa  201  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  22.16 
 
 
916 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  23.7 
 
 
925 aa  197  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  23.13 
 
 
916 aa  195  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  25.03 
 
 
943 aa  194  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  23.87 
 
 
934 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  24.78 
 
 
948 aa  190  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  23.52 
 
 
935 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  23.03 
 
 
935 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  24.72 
 
 
943 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  24.35 
 
 
943 aa  186  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  23.32 
 
 
961 aa  185  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  23.43 
 
 
935 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  24.24 
 
 
924 aa  178  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  23.78 
 
 
940 aa  162  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  29.49 
 
 
978 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  23.58 
 
 
1088 aa  135  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  23.58 
 
 
1088 aa  135  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  25.55 
 
 
1032 aa  131  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  22.91 
 
 
945 aa  127  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  26.52 
 
 
484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  27.8 
 
 
484 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  27.58 
 
 
484 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  22.09 
 
 
937 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  31 
 
 
937 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  23 
 
 
868 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  27.23 
 
 
513 aa  102  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1890  M16 family peptidase  29.18 
 
 
414 aa  100  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  28.87 
 
 
439 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  24.44 
 
 
878 aa  99.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2179  M16 family peptidase  28.57 
 
 
414 aa  98.6  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  26.87 
 
 
492 aa  96.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  25.41 
 
 
853 aa  95.9  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  25.61 
 
 
418 aa  95.5  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  23.15 
 
 
421 aa  95.5  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  25.34 
 
 
433 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  24.68 
 
 
499 aa  94.4  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  26.48 
 
 
473 aa  94.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  27.42 
 
 
479 aa  94.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  24.67 
 
 
433 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  26 
 
 
455 aa  93.2  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  29.18 
 
 
463 aa  93.6  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  31.11 
 
 
443 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  31.11 
 
 
443 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  31.11 
 
 
443 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  30.92 
 
 
464 aa  92.8  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2732  peptidase M16 domain protein  25.51 
 
 
408 aa  92.8  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  24.93 
 
 
439 aa  92  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  31.56 
 
 
443 aa  92  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  31.56 
 
 
443 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  31.11 
 
 
443 aa  92  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  26.98 
 
 
424 aa  91.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  31.56 
 
 
443 aa  91.3  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  31.36 
 
 
431 aa  91.3  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  31.11 
 
 
443 aa  91.3  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  30.67 
 
 
443 aa  90.9  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  23.47 
 
 
447 aa  90.9  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  26.11 
 
 
470 aa  90.9  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  30.22 
 
 
441 aa  90.9  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  28.96 
 
 
962 aa  90.1  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>