More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0990 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  100 
 
 
961 aa  1932    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  47.11 
 
 
978 aa  820    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  31.97 
 
 
974 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  30.64 
 
 
947 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  30.09 
 
 
948 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  29.34 
 
 
948 aa  358  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  30.15 
 
 
963 aa  355  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  27.06 
 
 
924 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  27.51 
 
 
943 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  26.93 
 
 
943 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  26.6 
 
 
943 aa  317  9e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  29.17 
 
 
948 aa  307  6e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  26.19 
 
 
948 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  26.46 
 
 
935 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  27.5 
 
 
979 aa  300  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  26.8 
 
 
935 aa  300  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  26.26 
 
 
935 aa  300  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  26.77 
 
 
934 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  24.92 
 
 
1442 aa  288  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  28.08 
 
 
932 aa  287  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  25.28 
 
 
958 aa  260  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  23.97 
 
 
950 aa  232  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  25.69 
 
 
963 aa  218  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  22.46 
 
 
938 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  22.13 
 
 
936 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  24.25 
 
 
927 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  23.08 
 
 
937 aa  190  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  23.32 
 
 
955 aa  187  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  22.49 
 
 
954 aa  184  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  25.87 
 
 
1005 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  24.46 
 
 
928 aa  169  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  23.63 
 
 
912 aa  144  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  21.68 
 
 
912 aa  144  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  26.67 
 
 
916 aa  140  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  22.73 
 
 
915 aa  139  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  23.13 
 
 
927 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  23.13 
 
 
927 aa  138  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  23.13 
 
 
931 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  23.13 
 
 
931 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  23.13 
 
 
926 aa  137  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  20.76 
 
 
938 aa  137  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  22.96 
 
 
927 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  22.96 
 
 
927 aa  135  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  22.8 
 
 
927 aa  135  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  22.96 
 
 
927 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  30.42 
 
 
922 aa  132  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  29.82 
 
 
932 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  29.63 
 
 
916 aa  128  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  28.32 
 
 
933 aa  126  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  28.89 
 
 
918 aa  122  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  30.12 
 
 
992 aa  114  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  29.64 
 
 
940 aa  110  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  27.6 
 
 
941 aa  107  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  27.23 
 
 
458 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  27.48 
 
 
458 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  26.85 
 
 
458 aa  102  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  29.01 
 
 
470 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  29.44 
 
 
924 aa  93.6  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  30.66 
 
 
455 aa  92.4  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  28.03 
 
 
419 aa  90.5  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  31.43 
 
 
440 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  28.17 
 
 
913 aa  90.1  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  29.63 
 
 
878 aa  90.1  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  33.02 
 
 
484 aa  90.1  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  32.77 
 
 
427 aa  89.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  32.55 
 
 
492 aa  89  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  32.5 
 
 
1088 aa  89  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  32.5 
 
 
1088 aa  89  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  28.74 
 
 
470 aa  89  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1890  M16 family peptidase  28.57 
 
 
414 aa  89  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  30.19 
 
 
454 aa  88.6  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2179  M16 family peptidase  28.26 
 
 
414 aa  88.2  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  28.4 
 
 
465 aa  88.2  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  28.5 
 
 
925 aa  87.8  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  32.58 
 
 
954 aa  87  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  30.35 
 
 
439 aa  87  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  31.28 
 
 
484 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.48 
 
 
942 aa  86.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  28.45 
 
 
424 aa  86.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  30.81 
 
 
957 aa  85.9  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  25.09 
 
 
959 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  30.73 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  32.08 
 
 
484 aa  85.5  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  29.17 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  31.98 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  26.82 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4891  peptidase, M16 (pitrilysin) family  27.13 
 
 
498 aa  85.1  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271502  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3989  hypothetical protein  27.53 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.801432  normal  0.0802476 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3929  hypothetical protein  27.53 
 
 
495 aa  85.1  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0881778  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3821  protein YhjJ  27.53 
 
 
495 aa  85.1  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2523  peptidase M16-like  27.84 
 
 
950 aa  85.1  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.786382  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3885  hypothetical protein  27.53 
 
 
495 aa  85.1  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  27.69 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3808  protein YhjJ  27.53 
 
 
495 aa  85.1  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03375  predicted zinc-dependent peptidase  27.13 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0186  peptidase M16 domain protein  27.13 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3933  peptidase, M16 (pitrilysin) family  27.13 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0190  peptidase M16 domain-containing protein  27.13 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03328  hypothetical protein  27.13 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3730  M16 family peptidase  27.13 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>