More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04785 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  66.27 
 
 
916 aa  1309    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  100 
 
 
916 aa  1898    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  40.61 
 
 
918 aa  699    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  36.1 
 
 
922 aa  635  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  26.06 
 
 
932 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  23.93 
 
 
936 aa  211  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  23.13 
 
 
955 aa  205  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  24.77 
 
 
933 aa  202  3e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  25 
 
 
941 aa  180  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  23.19 
 
 
950 aa  177  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  24.35 
 
 
927 aa  172  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  21.96 
 
 
928 aa  168  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  23.69 
 
 
912 aa  164  6e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  31.07 
 
 
943 aa  163  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  24.06 
 
 
938 aa  161  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  29.38 
 
 
1005 aa  162  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  33.94 
 
 
963 aa  161  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  22.53 
 
 
937 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  34.72 
 
 
948 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  24.84 
 
 
938 aa  157  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  24.42 
 
 
954 aa  157  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  29.19 
 
 
943 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  24.59 
 
 
948 aa  153  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  24.04 
 
 
926 aa  151  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  35.09 
 
 
963 aa  151  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  28.97 
 
 
927 aa  151  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  28.97 
 
 
927 aa  151  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  28.97 
 
 
927 aa  151  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  28.97 
 
 
931 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  36.62 
 
 
935 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  28.97 
 
 
931 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  35.59 
 
 
935 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  30.42 
 
 
924 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  28.97 
 
 
927 aa  149  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  36.15 
 
 
935 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  28.97 
 
 
927 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  28.72 
 
 
927 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  24.08 
 
 
912 aa  148  6e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  30.14 
 
 
943 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  36.15 
 
 
934 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  32.58 
 
 
958 aa  144  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  35.21 
 
 
948 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  34.33 
 
 
979 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  32.27 
 
 
978 aa  138  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  31.98 
 
 
932 aa  138  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  33.04 
 
 
947 aa  135  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  29.63 
 
 
961 aa  132  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  23.97 
 
 
1442 aa  131  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  32.58 
 
 
974 aa  131  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  30.33 
 
 
948 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  22.39 
 
 
992 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  32.3 
 
 
913 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  30.08 
 
 
915 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  29.11 
 
 
439 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  29.71 
 
 
879 aa  108  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3889  peptidase M16 domain protein  23.08 
 
 
491 aa  105  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0081  peptidase M16 domain protein  23.08 
 
 
500 aa  104  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3924  peptidase M16 domain-containing protein  28.97 
 
 
497 aa  104  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  31.47 
 
 
940 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0084  peptidase M16 domain protein  24.43 
 
 
505 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0154  peptidase M16 domain-containing protein  24.57 
 
 
497 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.389358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4077  peptidase M16 domain protein  23.95 
 
 
485 aa  103  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3445  peptidase M16 domain-containing protein  30.56 
 
 
490 aa  101  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  29.96 
 
 
924 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1699  M16 family peptidase  31.11 
 
 
872 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  26.96 
 
 
878 aa  97.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6664  peptidase M16 domain protein  26.94 
 
 
452 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  28.26 
 
 
868 aa  95.9  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  31.7 
 
 
414 aa  94  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  30.1 
 
 
925 aa  94.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3808  protein YhjJ  23.44 
 
 
495 aa  94  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.57 
 
 
421 aa  93.6  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4063  M16 family peptidase  23.17 
 
 
499 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  29.41 
 
 
937 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0100  peptidase M16 domain-containing protein  23.17 
 
 
499 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4069  M16 family peptidase  23.17 
 
 
499 aa  93.2  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.187129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3929  hypothetical protein  27.5 
 
 
495 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0881778  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3821  protein YhjJ  27.5 
 
 
495 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  28.4 
 
 
453 aa  92.8  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3885  hypothetical protein  27.5 
 
 
495 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  30.33 
 
 
415 aa  90.5  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1286  M16 family metallopeptidase  26.11 
 
 
966 aa  90.1  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3933  peptidase, M16 (pitrilysin) family  26.07 
 
 
498 aa  89.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3989  hypothetical protein  27.11 
 
 
481 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.801432  normal  0.0802476 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03375  predicted zinc-dependent peptidase  26.56 
 
 
498 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0186  peptidase M16 domain protein  26.56 
 
 
498 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4891  peptidase, M16 (pitrilysin) family  26.56 
 
 
498 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271502  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3730  M16 family peptidase  26.56 
 
 
498 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3835  M16 family peptidase  26.56 
 
 
498 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.173464 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03328  hypothetical protein  26.56 
 
 
498 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  30.29 
 
 
427 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  30.29 
 
 
427 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0190  peptidase M16 domain-containing protein  26.56 
 
 
498 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4015  M16 family peptidase  26.56 
 
 
498 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  31.78 
 
 
530 aa  89  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3824  peptidase M16 domain-containing protein  26.21 
 
 
469 aa  88.6  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000529085 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1343  peptidase M16 domain-containing protein  29.22 
 
 
951 aa  88.6  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.690972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  29.03 
 
 
431 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0941  peptidase M16 domain-containing protein  29.36 
 
 
472 aa  88.2  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  30.7 
 
 
433 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>