More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4022 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  100 
 
 		 943 aa  1918    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  78.56 
 
 		 935 aa  1493    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  80.38 
 
 		 948 aa  1540    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  78.99 
 
 		 935 aa  1496    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  88.41 
 
 		 924 aa  1686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  88.34 
 
 		 943 aa  1713    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  88.12 
 
 		 943 aa  1710    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  78.45 
 
 		 935 aa  1492    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  78.56 
 
 		 934 aa  1489    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  36.33 
 
 		 963 aa  525  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  33.51 
 
 		 948 aa  485  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  33.55 
 
 		 948 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  31.59 
 
 		 974 aa  419  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  30.14 
 
 		 948 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  29.6 
 
 		 947 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  30.18 
 
 		 979 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  27.41 
 
 		 1442 aa  381  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  28.99 
 
 		 932 aa  345  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  28.18 
 
 		 958 aa  336  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  26.82 
 
 		 961 aa  312  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  26.53 
 
 		 963 aa  275  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  26.68 
 
 		 1005 aa  268  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  23.86 
 
 		 978 aa  241  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  24.65 
 
 		 950 aa  229  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  23.34 
 
 		 936 aa  211  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  23.74 
 
 		 938 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  24.35 
 
 		 955 aa  186  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  22.27 
 
 		 941 aa  179  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  22.66 
 
 		 954 aa  178  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  22.79 
 
 		 927 aa  173  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  23.03 
 
 		 927 aa  172  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  23.06 
 
 		 927 aa  172  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  22.93 
 
 		 927 aa  171  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  22.93 
 
 		 927 aa  171  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  22.67 
 
 		 931 aa  170  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  22.67 
 
 		 931 aa  170  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  33.92 
 
 		 916 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  23.46 
 
 		 928 aa  169  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  22.25 
 
 		 937 aa  167  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  23.04 
 
 		 926 aa  167  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  22.92 
 
 		 927 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  25.98 
 
 		 927 aa  166  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  35.4 
 
 		 933 aa  157  1e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  22.56 
 
 		 912 aa  156  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  30.24 
 
 		 915 aa  152  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  30.67 
 
 		 916 aa  148  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  23.77 
 
 		 922 aa  147  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  33.93 
 
 		 918 aa  144  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  19.7 
 
 		 912 aa  144  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  31.47 
 
 		 932 aa  142  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  20.62 
 
 		 938 aa  131  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  28.35 
 
 		 924 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  31.05 
 
 		 913 aa  112  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  22.94 
 
 		 940 aa  108  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  22.88 
 
 		 992 aa  105  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  26.07 
 
 		 925 aa  104  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  29.91 
 
 		 1088 aa  100  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  29.91 
 
 		 1088 aa  100  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  24.86 
 
 		 439 aa  99.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  27.55 
 
 		 1032 aa  99.4  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  30.03 
 
 		 476 aa  95.1  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  28.12 
 
 		 443 aa  94.7  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  29.59 
 
 		 461 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  27.4 
 
 		 879 aa  92  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.1 
 
 		 942 aa  91.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  28.47 
 
 		 440 aa  91.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  30.91 
 
 		 464 aa  90.5  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  26.46 
 
 		 513 aa  88.2  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  28.85 
 
 		 455 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  33.19 
 
 		 433 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  29.6 
 
 		 464 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2179  M16 family peptidase  23.17 
 
 		 414 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1890  M16 family peptidase  23.17 
 
 		 414 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  27.78 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  27.93 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  30.68 
 
 		 853 aa  84.3  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  24.24 
 
 		 489 aa  84  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  25.33 
 
 		 514 aa  84  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  29.3 
 
 		 431 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  22.39 
 
 		 530 aa  84  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  28.04 
 
 		 419 aa  83.6  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  27.46 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  27.66 
 
 		 453 aa  83.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  33 
 
 		 440 aa  83.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  25.73 
 
 		 470 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  32.56 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  28.94 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  30 
 
 		 868 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  23.23 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  28.17 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  27.16 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  32.09 
 
 		 433 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3808  protein YhjJ  26.87 
 
 		 495 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  29.01 
 
 		 463 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3885  hypothetical protein  26.87 
 
 		 495 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3929  hypothetical protein  26.87 
 
 		 495 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0881778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3821  protein YhjJ  26.87 
 
 		 495 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3989  hypothetical protein  26.87 
 
 		 481 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.801432  normal  0.0802476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  29.09 
 
 		 461 aa  80.9  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  27.16 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>