More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2152 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  99.57 
 
 
931 aa  1897    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
927 aa  1906    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  99.03 
 
 
927 aa  1889    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  99.57 
 
 
931 aa  1897    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  98.92 
 
 
927 aa  1888    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  99.03 
 
 
926 aa  1863    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  99.03 
 
 
927 aa  1892    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  99.35 
 
 
927 aa  1892    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  99.14 
 
 
927 aa  1889    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  26.45 
 
 
955 aa  294  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  25.59 
 
 
927 aa  292  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  27.06 
 
 
954 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  25.03 
 
 
938 aa  273  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  26.36 
 
 
941 aa  269  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  25.77 
 
 
936 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  26.5 
 
 
938 aa  262  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  25.42 
 
 
932 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  25.64 
 
 
928 aa  254  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  26.36 
 
 
937 aa  244  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  27.08 
 
 
912 aa  244  7e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  24.97 
 
 
933 aa  243  1e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  23.63 
 
 
915 aa  243  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  24.54 
 
 
1442 aa  238  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  24.5 
 
 
912 aa  231  4e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  23.61 
 
 
940 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  23.4 
 
 
924 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  23.97 
 
 
913 aa  201  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  24.4 
 
 
950 aa  194  5e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  26.19 
 
 
979 aa  190  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  24.24 
 
 
992 aa  188  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  24.29 
 
 
958 aa  188  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  24.26 
 
 
925 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  23.73 
 
 
932 aa  175  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  22.96 
 
 
948 aa  173  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  23.88 
 
 
948 aa  169  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  22.92 
 
 
943 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  29.27 
 
 
1005 aa  160  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  37.23 
 
 
963 aa  160  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  25.07 
 
 
947 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  35.42 
 
 
922 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  22.81 
 
 
934 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  22.42 
 
 
935 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  22.46 
 
 
943 aa  157  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  23.15 
 
 
943 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  22.34 
 
 
935 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  34.4 
 
 
963 aa  153  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  38.68 
 
 
974 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  34.44 
 
 
918 aa  152  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  36.51 
 
 
916 aa  152  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  22.37 
 
 
935 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  22.78 
 
 
924 aa  152  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  35.44 
 
 
948 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  33.49 
 
 
978 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  32.7 
 
 
948 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  28.97 
 
 
916 aa  135  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  22.96 
 
 
961 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  23.07 
 
 
921 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  25.89 
 
 
484 aa  110  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  28.16 
 
 
470 aa  108  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  27.59 
 
 
921 aa  106  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  26.18 
 
 
484 aa  106  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  36.11 
 
 
443 aa  105  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  25.31 
 
 
439 aa  103  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  33.49 
 
 
530 aa  103  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  24.17 
 
 
431 aa  103  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  26.45 
 
 
484 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  31.6 
 
 
465 aa  102  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  27.53 
 
 
479 aa  102  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  33.33 
 
 
453 aa  101  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  31.67 
 
 
463 aa  101  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  31.28 
 
 
878 aa  101  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  27.3 
 
 
492 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  28.74 
 
 
433 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  30.62 
 
 
1088 aa  99.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  31.27 
 
 
467 aa  99  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  30.62 
 
 
1088 aa  99.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  24.86 
 
 
493 aa  99  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  27.95 
 
 
433 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  26.03 
 
 
423 aa  97.8  8e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  24.61 
 
 
489 aa  97.8  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  23.2 
 
 
947 aa  97.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  26.84 
 
 
513 aa  97.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  32.37 
 
 
937 aa  97.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  29.73 
 
 
464 aa  95.5  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  28.88 
 
 
957 aa  95.1  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  26.24 
 
 
470 aa  94.7  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  26.17 
 
 
441 aa  93.6  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  24.55 
 
 
442 aa  94  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3889  peptidase M16 domain protein  21.29 
 
 
491 aa  94  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  29.71 
 
 
868 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  25.87 
 
 
499 aa  94  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  22.22 
 
 
422 aa  93.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  30.32 
 
 
464 aa  93.2  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3924  peptidase M16 domain-containing protein  23.35 
 
 
497 aa  93.6  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  28.44 
 
 
431 aa  92.8  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27040  zinc protease  30.61 
 
 
908 aa  92.8  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.883186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  27.97 
 
 
919 aa  92.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1329  peptidase M16 domain protein  29.17 
 
 
951 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.785747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  29.51 
 
 
469 aa  92  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1343  peptidase M16 domain-containing protein  30.05 
 
 
951 aa  91.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.690972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>