154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3889 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0081  peptidase M16 domain protein  66.88 
 
 
500 aa  664    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3889  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
491 aa  1006    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4077  peptidase M16 domain protein  80.45 
 
 
485 aa  800    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0084  peptidase M16 domain protein  66.11 
 
 
505 aa  667    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4063  M16 family peptidase  64.3 
 
 
499 aa  631  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4069  M16 family peptidase  64.3 
 
 
499 aa  631  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.187129 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0100  peptidase M16 domain-containing protein  64.3 
 
 
499 aa  631  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0154  peptidase M16 domain-containing protein  61.49 
 
 
497 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.389358 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3924  peptidase M16 domain-containing protein  59.18 
 
 
497 aa  584  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3821  protein YhjJ  56.85 
 
 
495 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3885  hypothetical protein  56.85 
 
 
495 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3929  hypothetical protein  56.85 
 
 
495 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0881778  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03375  predicted zinc-dependent peptidase  57.23 
 
 
498 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0186  peptidase M16 domain protein  57.23 
 
 
498 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03328  hypothetical protein  57.23 
 
 
498 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4891  peptidase, M16 (pitrilysin) family  57.23 
 
 
498 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271502  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3730  M16 family peptidase  57.23 
 
 
498 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0190  peptidase M16 domain-containing protein  57.23 
 
 
498 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3835  M16 family peptidase  57.47 
 
 
498 aa  559  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.173464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3808  protein YhjJ  57.41 
 
 
495 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4015  M16 family peptidase  57.05 
 
 
498 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3933  peptidase, M16 (pitrilysin) family  56.84 
 
 
498 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3989  hypothetical protein  57.89 
 
 
481 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.801432  normal  0.0802476 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  24.53 
 
 
916 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  23.57 
 
 
922 aa  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  21.38 
 
 
927 aa  95.9  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  21.38 
 
 
927 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  23.79 
 
 
932 aa  94.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  21.15 
 
 
927 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  21.15 
 
 
927 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  21.33 
 
 
918 aa  94  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  21.15 
 
 
931 aa  94  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  21.15 
 
 
931 aa  94  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  21.15 
 
 
927 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  21.02 
 
 
926 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 
979 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  20.92 
 
 
927 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  26.41 
 
 
955 aa  90.1  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  23.09 
 
 
916 aa  88.2  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  29.05 
 
 
958 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  24.78 
 
 
948 aa  87.8  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  21.52 
 
 
936 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  27.53 
 
 
928 aa  87.8  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  28.44 
 
 
932 aa  87  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  21.78 
 
 
933 aa  86.3  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  26.43 
 
 
963 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  27.02 
 
 
937 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  23.7 
 
 
927 aa  81.3  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  22.27 
 
 
992 aa  81.3  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  26.48 
 
 
938 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  26.23 
 
 
954 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  23.46 
 
 
935 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  24.62 
 
 
950 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  23.46 
 
 
935 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
974 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  21.78 
 
 
948 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  23.94 
 
 
935 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  23.46 
 
 
948 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  22.31 
 
 
941 aa  76.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  23.94 
 
 
934 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  23.97 
 
 
924 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  25.67 
 
 
963 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  23.89 
 
 
943 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  22.69 
 
 
947 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  24.73 
 
 
943 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  27.85 
 
 
948 aa  73.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  26.8 
 
 
1005 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  21.94 
 
 
912 aa  72  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  26.3 
 
 
453 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  19.14 
 
 
915 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  25.81 
 
 
961 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  24.15 
 
 
938 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  24.9 
 
 
924 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  26.14 
 
 
913 aa  65.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  25.83 
 
 
940 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  24.57 
 
 
978 aa  62.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  20 
 
 
912 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  21.98 
 
 
943 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  22.96 
 
 
925 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  21.88 
 
 
1442 aa  60.1  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4194  peptidase M16 domain protein  24.02 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4233  peptidase M16 domain protein  24.02 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  21.43 
 
 
439 aa  59.3  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  22 
 
 
477 aa  57  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  23.79 
 
 
431 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  26.09 
 
 
493 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2341  peptidase M16-like  22.01 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  24.1 
 
 
919 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  23.41 
 
 
945 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
456 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  22.94 
 
 
469 aa  51.2  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  24.69 
 
 
447 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  22.02 
 
 
921 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  24.29 
 
 
853 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  23.83 
 
 
489 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  21.53 
 
 
464 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  22.1 
 
 
949 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  21.09 
 
 
929 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0119  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase)  20.99 
 
 
413 aa  50.4  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.369766  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  25.11 
 
 
448 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>