151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0084 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0081  peptidase M16 domain protein  92.48 
 
 		 500 aa  923    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4077  peptidase M16 domain protein  66.12 
 
 		 485 aa  681    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0084  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 505 aa  1035    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0154  peptidase M16 domain-containing protein  63.1 
 
 		 497 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.389358 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3889  peptidase M16 domain protein  66.04 
 
 		 491 aa  669    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4063  M16 family peptidase  64.57 
 
 		 499 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4069  M16 family peptidase  64.57 
 
 		 499 aa  634  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.187129 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0100  peptidase M16 domain-containing protein  64.57 
 
 		 499 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3924  peptidase M16 domain-containing protein  57.64 
 
 		 497 aa  585  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4891  peptidase, M16 (pitrilysin) family  57.81 
 
 		 498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271502  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03375  predicted zinc-dependent peptidase  57.59 
 
 		 498 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0186  peptidase M16 domain protein  57.59 
 
 		 498 aa  570  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03328  hypothetical protein  57.59 
 
 		 498 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3730  M16 family peptidase  57.59 
 
 		 498 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4015  M16 family peptidase  57.84 
 
 		 498 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0190  peptidase M16 domain-containing protein  57.59 
 
 		 498 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3835  M16 family peptidase  57.84 
 
 		 498 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3933  peptidase, M16 (pitrilysin) family  57.63 
 
 		 498 aa  568  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3885  hypothetical protein  56.76 
 
 		 495 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3929  hypothetical protein  56.76 
 
 		 495 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0881778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3808  protein YhjJ  56.56 
 
 		 495 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3821  protein YhjJ  56.76 
 
 		 495 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3989  hypothetical protein  57.39 
 
 		 481 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.801432  normal  0.0802476 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  22.75 
 
 		 922 aa  90.9  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  30.29 
 
 		 979 aa  90.5  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  22 
 
 		 916 aa  90.5  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  24.19 
 
 		 916 aa  90.1  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  20.71 
 
 		 918 aa  89.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  29.36 
 
 		 932 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  31.82 
 
 		 932 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  26.9 
 
 		 958 aa  87  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  24.14 
 
 		 941 aa  86.7  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  23.37 
 
 		 927 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  24.38 
 
 		 927 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  23.6 
 
 		 927 aa  85.9  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  23.6 
 
 		 927 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  23.37 
 
 		 931 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  23.37 
 
 		 931 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  30.52 
 
 		 928 aa  84  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  23.37 
 
 		 927 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  23.02 
 
 		 926 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  23.15 
 
 		 927 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  24.01 
 
 		 974 aa  80.9  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  30.87 
 
 		 955 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  23.75 
 
 		 933 aa  79.7  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  26.87 
 
 		 937 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  24.28 
 
 		 927 aa  79.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  27.13 
 
 		 938 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  21.99 
 
 		 954 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  27.84 
 
 		 936 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  27.39 
 
 		 963 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  27.73 
 
 		 948 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  24.68 
 
 		 938 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  25.37 
 
 		 963 aa  68.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  24.48 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  25.45 
 
 		 940 aa  67.8  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  23.01 
 
 		 948 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  23.7 
 
 		 943 aa  67  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  25.1 
 
 		 924 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  27.6 
 
 		 947 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  26.13 
 
 		 948 aa  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  27.85 
 
 		 1005 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  23.33 
 
 		 935 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  22.64 
 
 		 948 aa  64.3  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  23.06 
 
 		 935 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  23.04 
 
 		 935 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  19.65 
 
 		 992 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  22.97 
 
 		 924 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  22.97 
 
 		 943 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  23.65 
 
 		 934 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  24.71 
 
 		 925 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  26.18 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  27.43 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  25.09 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  25.13 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  25.13 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  25.13 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  25.13 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  25.13 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  25.13 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  25.13 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  25.45 
 
 		 961 aa  57  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  25.13 
 
 		 413 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  24.61 
 
 		 413 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  24.61 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  24.61 
 
 		 913 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  21.74 
 
 		 943 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  22.92 
 
 		 950 aa  54.7  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  21.6 
 
 		 912 aa  53.9  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  26.29 
 
 		 1442 aa  53.9  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  22.04 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4233  peptidase M16 domain protein  25.11 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4194  peptidase M16 domain protein  25.11 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  27.36 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  20.29 
 
 		 912 aa  52.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  24.39 
 
 		 447 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  23.11 
 
 		 853 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.02 
 
 		 937 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4309  peptidase M16-like  24.34 
 
 		 413 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  24.07 
 
 		 978 aa  50.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>