More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1679 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  99.03 
 
 
931 aa  1889    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  99.14 
 
 
927 aa  1889    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  99.03 
 
 
927 aa  1889    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  99.03 
 
 
927 aa  1886    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  98.92 
 
 
927 aa  1887    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  100 
 
 
927 aa  1903    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  98.92 
 
 
926 aa  1862    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  99.03 
 
 
931 aa  1889    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  98.92 
 
 
927 aa  1885    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  26.55 
 
 
955 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  25.59 
 
 
927 aa  295  3e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  25.14 
 
 
938 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  26.95 
 
 
954 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  26.55 
 
 
941 aa  271  5.9999999999999995e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  25.67 
 
 
936 aa  270  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  26.5 
 
 
938 aa  261  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  26.02 
 
 
928 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  25.2 
 
 
932 aa  254  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  24.48 
 
 
933 aa  249  1e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  27.2 
 
 
912 aa  248  3e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  23.63 
 
 
915 aa  248  4.9999999999999997e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  26.46 
 
 
937 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  24.54 
 
 
1442 aa  241  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  24.82 
 
 
912 aa  239  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  23.89 
 
 
940 aa  207  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  24.08 
 
 
913 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  23.4 
 
 
924 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  24.51 
 
 
950 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  24.35 
 
 
979 aa  194  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  24.17 
 
 
958 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  24.51 
 
 
992 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  24.26 
 
 
925 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  23.84 
 
 
932 aa  181  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  23.18 
 
 
948 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  23.06 
 
 
943 aa  172  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  23.65 
 
 
948 aa  171  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  22.52 
 
 
934 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  22.42 
 
 
935 aa  164  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  29.27 
 
 
1005 aa  164  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  22.56 
 
 
935 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  22.49 
 
 
943 aa  160  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  24.9 
 
 
947 aa  160  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  23.17 
 
 
943 aa  160  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  35.42 
 
 
922 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  36.8 
 
 
963 aa  158  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  22.58 
 
 
935 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  34.86 
 
 
963 aa  156  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  22.8 
 
 
924 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  23.93 
 
 
974 aa  155  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  34.44 
 
 
918 aa  154  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  36.51 
 
 
916 aa  154  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  23.48 
 
 
948 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  35.92 
 
 
948 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  33.94 
 
 
978 aa  142  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  28.72 
 
 
916 aa  135  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  22.96 
 
 
961 aa  131  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  25.89 
 
 
484 aa  111  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  27.85 
 
 
921 aa  109  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  26.18 
 
 
484 aa  108  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  25.56 
 
 
439 aa  107  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  27.89 
 
 
470 aa  107  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  26.72 
 
 
484 aa  106  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  36.11 
 
 
443 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  33.49 
 
 
530 aa  105  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  22.88 
 
 
921 aa  105  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  24.17 
 
 
431 aa  104  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  27.79 
 
 
479 aa  104  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  31.6 
 
 
465 aa  103  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  33.33 
 
 
453 aa  102  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  31.67 
 
 
463 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  27.53 
 
 
433 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  27.82 
 
 
492 aa  101  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  30.62 
 
 
1088 aa  101  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  30.62 
 
 
1088 aa  101  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  31.28 
 
 
878 aa  100  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  31.27 
 
 
467 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  26.83 
 
 
433 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  25.35 
 
 
423 aa  99.4  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  24.59 
 
 
493 aa  98.6  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  32.86 
 
 
937 aa  98.2  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  26.84 
 
 
513 aa  98.2  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  29.74 
 
 
957 aa  97.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  24.35 
 
 
489 aa  97.1  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  29.73 
 
 
464 aa  96.3  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  26.24 
 
 
470 aa  95.9  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  25.87 
 
 
499 aa  95.5  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3924  peptidase M16 domain-containing protein  23.24 
 
 
497 aa  94.7  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3889  peptidase M16 domain protein  21.51 
 
 
491 aa  95.1  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  22.97 
 
 
947 aa  94.7  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  30.32 
 
 
464 aa  94.4  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  24.29 
 
 
442 aa  94.4  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  26.17 
 
 
441 aa  94.4  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  28.35 
 
 
919 aa  93.6  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  30.13 
 
 
868 aa  94.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27040  zinc protease  30.61 
 
 
908 aa  93.2  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.883186  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  29.73 
 
 
453 aa  93.2  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1343  peptidase M16 domain-containing protein  30.52 
 
 
951 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.690972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.31 
 
 
942 aa  92  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  28.19 
 
 
489 aa  92  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  29.77 
 
 
461 aa  91.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>