More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4144 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
954 aa  1952    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  47.38 
 
 
936 aa  894    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  41.82 
 
 
937 aa  718    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  46.53 
 
 
938 aa  842    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  47.65 
 
 
955 aa  873    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  36.46 
 
 
928 aa  570  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  34.55 
 
 
941 aa  538  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  29.71 
 
 
938 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  32.36 
 
 
932 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  29.71 
 
 
912 aa  372  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  30.47 
 
 
912 aa  353  1e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  26.31 
 
 
992 aa  318  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  30.05 
 
 
915 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  27.48 
 
 
1442 aa  291  5.0000000000000004e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  27.06 
 
 
926 aa  277  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  26.95 
 
 
927 aa  276  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  26.95 
 
 
927 aa  275  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  27.06 
 
 
931 aa  275  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  27.06 
 
 
931 aa  275  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  26.84 
 
 
927 aa  274  6e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  27.06 
 
 
927 aa  273  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  26.84 
 
 
927 aa  273  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  26.73 
 
 
927 aa  269  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  23.79 
 
 
927 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  26.46 
 
 
974 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  24.92 
 
 
963 aa  262  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  23.43 
 
 
958 aa  260  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  28.35 
 
 
933 aa  257  8e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  26.58 
 
 
979 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  24.42 
 
 
948 aa  246  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  24.3 
 
 
948 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  25.8 
 
 
950 aa  229  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  24.43 
 
 
948 aa  228  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  23.84 
 
 
947 aa  224  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  24.45 
 
 
963 aa  219  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  23.83 
 
 
1005 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  24.6 
 
 
943 aa  199  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  24.96 
 
 
922 aa  196  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  22.66 
 
 
978 aa  190  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  22.84 
 
 
932 aa  185  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  23.54 
 
 
924 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  22.86 
 
 
948 aa  181  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  22.49 
 
 
961 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  22.2 
 
 
935 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  23.02 
 
 
934 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  22.66 
 
 
943 aa  178  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  22.51 
 
 
943 aa  178  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  23.16 
 
 
916 aa  178  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  22.66 
 
 
935 aa  177  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  24.68 
 
 
918 aa  172  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  22.82 
 
 
935 aa  171  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  21.97 
 
 
925 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  22.45 
 
 
940 aa  149  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  24.42 
 
 
916 aa  145  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  21.88 
 
 
924 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  24.16 
 
 
1088 aa  137  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  24.16 
 
 
1088 aa  137  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  33.05 
 
 
913 aa  114  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  32.16 
 
 
1032 aa  113  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  32.91 
 
 
937 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  29.18 
 
 
878 aa  98.6  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  25.38 
 
 
868 aa  97.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  27.3 
 
 
489 aa  96.7  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  24.05 
 
 
470 aa  95.1  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  24.31 
 
 
484 aa  92.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  25.34 
 
 
453 aa  91.7  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  28.57 
 
 
461 aa  91.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  24.95 
 
 
477 aa  91.3  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  26.22 
 
 
493 aa  91.3  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  25.2 
 
 
439 aa  91.3  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  23.21 
 
 
504 aa  91.3  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  24.32 
 
 
459 aa  91.3  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  28.4 
 
 
464 aa  90.9  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  29.02 
 
 
853 aa  90.5  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  30.5 
 
 
467 aa  90.1  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  24.05 
 
 
442 aa  90.1  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  25.06 
 
 
494 aa  89.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  27.21 
 
 
464 aa  89  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  27.44 
 
 
479 aa  88.2  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  24.15 
 
 
501 aa  87.8  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07110  predicted Zn-dependent peptidase  26.96 
 
 
439 aa  87  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.54818  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  25.11 
 
 
461 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  26.19 
 
 
879 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  29.27 
 
 
484 aa  86.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  22.74 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  30.34 
 
 
499 aa  86.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  28.12 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  23.25 
 
 
451 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  22.94 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  24.89 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  25.12 
 
 
452 aa  84.3  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  22.44 
 
 
433 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  28.34 
 
 
431 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  26.82 
 
 
427 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  26.82 
 
 
427 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  28 
 
 
443 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  24.04 
 
 
451 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  24.32 
 
 
451 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  29.56 
 
 
463 aa  83.2  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  28.46 
 
 
484 aa  83.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>