More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2134 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  100 
 
 
968 aa  2010    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  37.62 
 
 
925 aa  624  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  37.28 
 
 
929 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  37.5 
 
 
929 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  37.5 
 
 
929 aa  618  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  37.28 
 
 
929 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  36.87 
 
 
929 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  37.95 
 
 
929 aa  611  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  36.71 
 
 
929 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  36.99 
 
 
929 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  36.69 
 
 
929 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  36.99 
 
 
929 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  36.99 
 
 
929 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  36.99 
 
 
929 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  35.98 
 
 
939 aa  594  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  36.54 
 
 
929 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  36.78 
 
 
929 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  36.74 
 
 
929 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  36.16 
 
 
925 aa  579  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  34.93 
 
 
904 aa  544  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  34.17 
 
 
947 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  32.97 
 
 
936 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  32.93 
 
 
1162 aa  463  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  30.23 
 
 
941 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  31.14 
 
 
1100 aa  443  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  32.04 
 
 
1074 aa  415  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  30.7 
 
 
963 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  29.03 
 
 
915 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  28.04 
 
 
945 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  26.89 
 
 
958 aa  379  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  28.77 
 
 
962 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  28.77 
 
 
962 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  28.77 
 
 
962 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  28.37 
 
 
986 aa  373  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  28.37 
 
 
982 aa  373  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  28.79 
 
 
962 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  28.9 
 
 
1008 aa  357  7.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  29.37 
 
 
995 aa  353  7e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  27.52 
 
 
962 aa  352  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  27.88 
 
 
960 aa  350  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  27.52 
 
 
962 aa  350  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  27.52 
 
 
962 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  27.5 
 
 
962 aa  349  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  27.3 
 
 
962 aa  349  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  27.5 
 
 
962 aa  349  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.436713 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  27.39 
 
 
962 aa  347  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  27.39 
 
 
962 aa  347  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  27.39 
 
 
962 aa  347  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  28.14 
 
 
981 aa  347  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  27.28 
 
 
962 aa  346  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  27.28 
 
 
962 aa  346  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  27.28 
 
 
962 aa  345  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  27.3 
 
 
962 aa  344  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  27.17 
 
 
962 aa  343  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  27.69 
 
 
967 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  27.05 
 
 
946 aa  340  7e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  29.03 
 
 
952 aa  327  6e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  25.14 
 
 
916 aa  310  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  24.38 
 
 
939 aa  218  5e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  27.05 
 
 
1272 aa  204  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  29.26 
 
 
1246 aa  145  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  31.29 
 
 
775 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  31.38 
 
 
763 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  32.52 
 
 
766 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  31.17 
 
 
766 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  32.04 
 
 
809 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  29.01 
 
 
808 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  28.76 
 
 
779 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  31.19 
 
 
762 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  26.54 
 
 
932 aa  112  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  30.58 
 
 
760 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  29.63 
 
 
843 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  28.14 
 
 
853 aa  102  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  26.25 
 
 
794 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  25.91 
 
 
954 aa  95.5  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2224  peptidase M16-like protein  26.46 
 
 
408 aa  94.7  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.606568  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  26.69 
 
 
469 aa  93.2  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  27.36 
 
 
945 aa  92.8  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  25.5 
 
 
441 aa  90.9  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  26.81 
 
 
454 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  26.67 
 
 
530 aa  90.1  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  26.35 
 
 
974 aa  90.1  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  29.54 
 
 
453 aa  89.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  25.21 
 
 
442 aa  89.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  25.5 
 
 
459 aa  89  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  28.45 
 
 
440 aa  88.6  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  25.91 
 
 
460 aa  88.2  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  23.81 
 
 
440 aa  88.2  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  26.96 
 
 
958 aa  87.8  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  26.36 
 
 
426 aa  87.4  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  27.12 
 
 
878 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  26.81 
 
 
944 aa  87  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  26.39 
 
 
463 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  29.66 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  25.45 
 
 
476 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  26.2 
 
 
950 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  25.55 
 
 
460 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  25.55 
 
 
460 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  26.2 
 
 
950 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  26.2 
 
 
944 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>