More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4050 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4050  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
244 aa  484  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3873  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  97.13 
 
 
244 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3520  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.79 
 
 
239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2650  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.58 
 
 
239 aa  238  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.074338  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7241  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  56.5 
 
 
230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1827  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  50.21 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249434  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1258  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.22 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4836  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.07 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5920  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
234 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  normal  0.168825 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6913  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.34 
 
 
234 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77159  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5749  amino acid ABC transporter permease  49.37 
 
 
248 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6113  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.37 
 
 
248 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6595  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.76 
 
 
248 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.148887 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5838  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
248 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5621  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.66 
 
 
248 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.142283  normal  0.488767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.39 
 
 
238 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5102  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.85 
 
 
250 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00180467  decreased coverage  0.00233971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4487  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.42 
 
 
238 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131954  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 
236 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186959  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
248 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2253  amino acid ABC transporter permease  48.13 
 
 
239 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68090  ABC transporter permease  45.7 
 
 
230 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0277184  normal  0.0135289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5893  ABC transporter permease  45.7 
 
 
230 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1927  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.33 
 
 
243 aa  194  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0303  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.7 
 
 
229 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177039  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0280  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  46.23 
 
 
229 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139552  hitchhiker  0.000156387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5360  amino acid ABC transporter, permease protein  46.19 
 
 
229 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4914  amino acid ABC transporter permease  46.19 
 
 
229 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0298  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.23 
 
 
229 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0046472  normal  0.109587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.62 
 
 
229 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000808771  hitchhiker  0.000000082822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0309  amino acid ABC transporter permease  45.28 
 
 
229 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000829605  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4272  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.22 
 
 
256 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000141249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0298  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  43.3 
 
 
241 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0329  amino acid ABC transporter permease  43.75 
 
 
241 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  44.2 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2881  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  43.36 
 
 
229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0842079  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4290  amino acid ABC transporter permease  45.98 
 
 
232 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
232 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.285474 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5844  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.43 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.42 
 
 
232 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136748  hitchhiker  0.00334449 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0698  arginine transporter permease subunit ArtM  44 
 
 
222 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.42 
 
 
232 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.60113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4484  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  47.42 
 
 
232 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.42 
 
 
232 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00987001  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2072  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.73 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52770  arginine/ornithine transport protein AotM  44.2 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1828  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  50.88 
 
 
232 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3569  amino acid ABC transporter permease  50.88 
 
 
232 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118377  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001575  arginine ABC transporter permease protein ArtM  45 
 
 
222 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.432738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0337  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.27 
 
 
236 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7506  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  43.95 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05531  arginine transporter permease subunit ArtM  44.5 
 
 
222 aa  165  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2559  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
244 aa  165  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.498875  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  41.67 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.2 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1960  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  40.09 
 
 
225 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.45 
 
 
276 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.740721  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1592  hypothetical protein  42.65 
 
 
223 aa  158  9e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.172559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0593  amino acid ABC transporter, permease protein  42.65 
 
 
223 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.035181  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5016  ABC transporter membrane spanning protein  41.2 
 
 
229 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  40.35 
 
 
225 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2831  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  40.69 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6802  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.99 
 
 
231 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1590  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.35 
 
 
276 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4839  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.99 
 
 
231 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2291  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.51 
 
 
276 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_004310  BR0952  amino acid ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 
277 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4284  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.52 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2237  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.18 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.655968  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0254  arginine transporter permease subunit ArtM  42.51 
 
 
227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000745827  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5067  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
229 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404951  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3310  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.24 
 
 
240 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6393  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 
229 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100475  normal  0.579181 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
225 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2783  amino acid ABC transporter permease  37.09 
 
 
243 aa  148  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4533  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.25 
 
 
229 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  35.71 
 
 
501 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2588  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.91 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1653  arginine transporter permease subunit ArtM  39.35 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.22 
 
 
235 aa  144  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1377  arginine transporter permease subunit ArtM  40.95 
 
 
222 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.67 
 
 
513 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0889  arginine transporter permease subunit ArtM  40.95 
 
 
222 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.13715  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00866  arginine transporter subunit  40.95 
 
 
222 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0965  arginine transporter permease subunit ArtM  40.95 
 
 
222 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2781  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.95 
 
 
222 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0249493  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0934  arginine transporter permease subunit ArtM  40.95 
 
 
222 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1021  arginine transporter permease subunit ArtM  40.95 
 
 
222 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.487337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3392  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 
237 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00872  hypothetical protein  40.95 
 
 
222 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2470  arginine transporter permease subunit ArtM  40.95 
 
 
222 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.156065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2735  arginine transporter permease subunit ArtM  40.95 
 
 
222 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00627055  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1121  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.17 
 
 
237 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
237 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000275553  hitchhiker  0.0000000592731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3547  amino acid ABC transproter permease protein  35.96 
 
 
222 aa  141  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.443422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5733  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
237 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3549  amino acid ABC transproter permease protein  35.96 
 
 
222 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3235  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.56 
 
 
222 aa  141  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1023  arginine transporter permease subunit ArtM  40.87 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0446  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  36.89 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>