More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0254 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0254  arginine transporter permease subunit ArtM  100 
 
 
227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000745827  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0698  arginine transporter permease subunit ArtM  54.71 
 
 
222 aa  244  9e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1653  arginine transporter permease subunit ArtM  55.25 
 
 
222 aa  241  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0889  arginine transporter permease subunit ArtM  53.88 
 
 
222 aa  235  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.13715  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00866  arginine transporter subunit  53.42 
 
 
222 aa  235  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501538  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00872  hypothetical protein  53.42 
 
 
222 aa  235  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2781  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.42 
 
 
222 aa  235  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0249493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1021  arginine transporter permease subunit ArtM  53.42 
 
 
222 aa  235  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.487337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2470  arginine transporter permease subunit ArtM  53.42 
 
 
222 aa  235  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.156065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0934  arginine transporter permease subunit ArtM  53.42 
 
 
222 aa  235  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1042  arginine transporter permease subunit ArtM  53.42 
 
 
222 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241567  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2735  arginine transporter permease subunit ArtM  53.42 
 
 
222 aa  235  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00627055  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0965  arginine transporter permease subunit ArtM  53.42 
 
 
222 aa  235  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0925  arginine transporter permease subunit ArtM  53.42 
 
 
222 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.197831  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0960  arginine transporter permease subunit ArtM  53.42 
 
 
222 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0992  arginine transporter permease subunit ArtM  53.42 
 
 
222 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1023  arginine transporter permease subunit ArtM  53.42 
 
 
222 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2628  arginine transporter permease subunit ArtM  55.71 
 
 
222 aa  231  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0454966  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2713  arginine transporter permease subunit ArtM  55.71 
 
 
222 aa  231  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1580  arginine transporter permease subunit ArtM  55.71 
 
 
222 aa  231  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1377  arginine transporter permease subunit ArtM  52.05 
 
 
222 aa  231  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001575  arginine ABC transporter permease protein ArtM  52.73 
 
 
222 aa  226  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.432738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05531  arginine transporter permease subunit ArtM  52.73 
 
 
222 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1699  arginine transporter permease subunit ArtM  55.5 
 
 
222 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0315735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1965  arginine transporter permease subunit ArtM  55.5 
 
 
222 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.385135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2379  arginine transporter permease subunit ArtM  59.67 
 
 
223 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.423139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2279  arginine transporter permease subunit ArtM  55.71 
 
 
223 aa  204  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0326  arginine transporter permease subunit ArtM  47.75 
 
 
223 aa  198  5e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2881  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  42.25 
 
 
229 aa  161  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0842079  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7241  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  41.23 
 
 
230 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228007  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1927  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.14 
 
 
243 aa  157  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
236 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186959  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  41.43 
 
 
232 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.48 
 
 
232 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.285474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1828  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 
232 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0337  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
236 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3873  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.48 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0593  amino acid ABC transporter, permease protein  44 
 
 
223 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.035181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4050  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 
244 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1592  hypothetical protein  43.1 
 
 
223 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.172559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3569  amino acid ABC transporter permease  44.32 
 
 
232 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118377  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 
248 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4290  amino acid ABC transporter permease  47.06 
 
 
232 aa  147  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2783  amino acid ABC transporter permease  36.06 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.39 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136748  hitchhiker  0.00334449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4484  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  45.78 
 
 
232 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.78 
 
 
232 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00987001  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52770  arginine/ornithine transport protein AotM  42.78 
 
 
232 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.78 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.60113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0329  amino acid ABC transporter permease  37.27 
 
 
241 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0298  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  37.73 
 
 
241 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6802  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.05 
 
 
231 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 
265 aa  142  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3520  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.18 
 
 
239 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2926  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, innermembrane subunit  36.41 
 
 
237 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353786  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2072  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.24 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.4 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.79 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587835  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68090  ABC transporter permease  36.1 
 
 
230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0277184  normal  0.0135289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000808771  hitchhiker  0.000000082822 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  36.49 
 
 
225 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2650  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.05 
 
 
239 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.074338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5893  ABC transporter permease  37.2 
 
 
230 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4284  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.42 
 
 
231 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0280  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  39.23 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139552  hitchhiker  0.000156387 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6913  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.14 
 
 
234 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77159  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2253  amino acid ABC transporter permease  38.46 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4839  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.43 
 
 
231 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0298  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.23 
 
 
229 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0046472  normal  0.109587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 
237 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  0.172644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4914  amino acid ABC transporter permease  37.32 
 
 
229 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1772  amino acid ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 
237 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0697  amino acid ABC transporter permease  36.49 
 
 
237 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1055  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 
237 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1176  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 
237 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 
237 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1258  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
238 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 
237 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4288  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2790  histidine ABC transporter, permease protein HisM  36.02 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0952  amino acid ABC transporter, permease protein  38.53 
 
 
277 aa  135  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0588  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein, putative  36.02 
 
 
237 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0303  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.28 
 
 
229 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177039  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2852  histidine transport system permease protein  36.19 
 
 
516 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2731  histidine transport system permease protein  36.02 
 
 
237 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1740  putative arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  36.02 
 
 
237 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2430  putative arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  36.02 
 
 
237 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2861  putative arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  36.02 
 
 
237 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  36.04 
 
 
225 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5360  amino acid ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
229 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209442  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2237  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
277 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.655968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0309  amino acid ABC transporter permease  39.23 
 
 
229 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000829605  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2788  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.35 
 
 
238 aa  134  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.133608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.86 
 
 
238 aa  134  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2559  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.34 
 
 
244 aa  135  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.498875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4272  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.28 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000141249 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5920  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.53 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  normal  0.168825 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7502  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.65 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>