More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0925 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0960  arginine transporter permease subunit ArtM  99.55 
 
 
222 aa  440  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1042  arginine transporter permease subunit ArtM  100 
 
 
222 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241567  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0925  arginine transporter permease subunit ArtM  100 
 
 
222 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.197831  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1023  arginine transporter permease subunit ArtM  99.55 
 
 
222 aa  440  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0992  arginine transporter permease subunit ArtM  99.55 
 
 
222 aa  440  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00866  arginine transporter subunit  94.59 
 
 
222 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2781  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  94.59 
 
 
222 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0249493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0889  arginine transporter permease subunit ArtM  94.14 
 
 
222 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.13715  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2735  arginine transporter permease subunit ArtM  94.59 
 
 
222 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00627055  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2470  arginine transporter permease subunit ArtM  94.59 
 
 
222 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.156065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0934  arginine transporter permease subunit ArtM  94.59 
 
 
222 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1021  arginine transporter permease subunit ArtM  94.59 
 
 
222 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.487337 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00872  hypothetical protein  94.59 
 
 
222 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0965  arginine transporter permease subunit ArtM  94.59 
 
 
222 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1377  arginine transporter permease subunit ArtM  92.34 
 
 
222 aa  421  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1653  arginine transporter permease subunit ArtM  81.08 
 
 
222 aa  374  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2713  arginine transporter permease subunit ArtM  83.33 
 
 
222 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1580  arginine transporter permease subunit ArtM  83.33 
 
 
222 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2628  arginine transporter permease subunit ArtM  83.33 
 
 
222 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0454966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1699  arginine transporter permease subunit ArtM  80.18 
 
 
222 aa  348  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0315735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1965  arginine transporter permease subunit ArtM  80.63 
 
 
222 aa  345  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.385135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2379  arginine transporter permease subunit ArtM  77.03 
 
 
223 aa  323  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.423139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2279  arginine transporter permease subunit ArtM  77.48 
 
 
223 aa  312  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0698  arginine transporter permease subunit ArtM  61.47 
 
 
222 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180995  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001575  arginine ABC transporter permease protein ArtM  61.01 
 
 
222 aa  260  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.432738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05531  arginine transporter permease subunit ArtM  60.55 
 
 
222 aa  259  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0326  arginine transporter permease subunit ArtM  56.31 
 
 
223 aa  249  2e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0254  arginine transporter permease subunit ArtM  53.42 
 
 
227 aa  235  4e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000745827  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7241  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  46.19 
 
 
230 aa  177  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.38 
 
 
236 aa  164  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186959  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2253  amino acid ABC transporter permease  41.59 
 
 
239 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4272  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.4 
 
 
256 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000141249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5893  ABC transporter permease  39.07 
 
 
230 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68090  ABC transporter permease  38.6 
 
 
230 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0277184  normal  0.0135289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3520  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
239 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0280  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.1 
 
 
229 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139552  hitchhiker  0.000156387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5360  amino acid ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 
229 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 
229 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000808771  hitchhiker  0.000000082822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0303  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
229 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177039  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0298  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
229 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0046472  normal  0.109587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4914  amino acid ABC transporter permease  39.73 
 
 
229 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0309  amino acid ABC transporter permease  40.64 
 
 
229 aa  147  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000829605  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0298  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2072  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
241 aa  145  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0329  amino acid ABC transporter permease  39.37 
 
 
241 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6913  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.13 
 
 
234 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77159  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0952  amino acid ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 
277 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1592  hypothetical protein  42.59 
 
 
223 aa  142  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.172559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0593  amino acid ABC transporter, permease protein  42.59 
 
 
223 aa  142  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.035181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2237  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.26 
 
 
277 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.655968  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.98 
 
 
248 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4050  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.87 
 
 
244 aa  141  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5920  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.2 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  normal  0.168825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.15 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.51 
 
 
238 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 
232 aa  138  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.285474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  37.16 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3873  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4487  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.71 
 
 
238 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131954  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.15 
 
 
276 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.740721  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1590  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.96 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2783  amino acid ABC transporter permease  37.09 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2064  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  35.05 
 
 
276 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3310  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 
240 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2650  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.23 
 
 
239 aa  131  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.074338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1960  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  34.68 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223037  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5844  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.62 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52770  arginine/ornithine transport protein AotM  37.61 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2291  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.27 
 
 
276 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1927  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.68 
 
 
243 aa  128  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1258  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
238 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  36.73 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4290  amino acid ABC transporter permease  37.56 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4288  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  37.85 
 
 
237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  36.28 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
225 aa  125  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.63 
 
 
232 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136748  hitchhiker  0.00334449 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 
237 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0697  amino acid ABC transporter permease  37.38 
 
 
237 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1176  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 
237 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2881  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  37.5 
 
 
229 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0842079  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.75 
 
 
232 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.60113 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7506  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  33.49 
 
 
226 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 
237 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  0.172644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2559  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
244 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.498875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1828  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
232 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2167  L-cystine transport system permease TcyB  36.77 
 
 
222 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0765863  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4484  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  38.82 
 
 
232 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2114  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  36.77 
 
 
222 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000270288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.82 
 
 
232 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00987001  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.92 
 
 
237 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1055  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.92 
 
 
237 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3569  amino acid ABC transporter permease  39.13 
 
 
232 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118377  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 
237 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587835  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4138  amino acid ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 
236 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1827  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  39.88 
 
 
251 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249434  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3876  amino acid ABC transporter permease  33.49 
 
 
236 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1168  amino acid ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family, permease protein  36.77 
 
 
222 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.066667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2108  amino acid ABC transporter His/Glu/Gln/Arg/opine family, permease  36.77 
 
 
222 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0113123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4836  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.29 
 
 
250 aa  121  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.14573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>