More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001575 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001575  arginine ABC transporter permease protein ArtM  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.432738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05531  arginine transporter permease subunit ArtM  98.64 
 
 
222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0698  arginine transporter permease subunit ArtM  86.88 
 
 
222 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00866  arginine transporter subunit  61.01 
 
 
222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2781  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.01 
 
 
222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0249493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1021  arginine transporter permease subunit ArtM  61.01 
 
 
222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.487337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2735  arginine transporter permease subunit ArtM  61.01 
 
 
222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00627055  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0934  arginine transporter permease subunit ArtM  61.01 
 
 
222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2470  arginine transporter permease subunit ArtM  61.01 
 
 
222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.156065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00872  hypothetical protein  61.01 
 
 
222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0965  arginine transporter permease subunit ArtM  61.01 
 
 
222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0889  arginine transporter permease subunit ArtM  61.01 
 
 
222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.13715  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0925  arginine transporter permease subunit ArtM  61.01 
 
 
222 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.197831  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1042  arginine transporter permease subunit ArtM  61.01 
 
 
222 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241567  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0960  arginine transporter permease subunit ArtM  61.01 
 
 
222 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1023  arginine transporter permease subunit ArtM  61.01 
 
 
222 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0992  arginine transporter permease subunit ArtM  61.01 
 
 
222 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1377  arginine transporter permease subunit ArtM  61.01 
 
 
222 aa  269  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1653  arginine transporter permease subunit ArtM  59.81 
 
 
222 aa  261  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2713  arginine transporter permease subunit ArtM  60.55 
 
 
222 aa  255  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1580  arginine transporter permease subunit ArtM  60.55 
 
 
222 aa  255  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2628  arginine transporter permease subunit ArtM  60.55 
 
 
222 aa  255  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0454966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1699  arginine transporter permease subunit ArtM  60.47 
 
 
222 aa  245  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0315735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1965  arginine transporter permease subunit ArtM  59.53 
 
 
222 aa  241  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.385135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2379  arginine transporter permease subunit ArtM  60.83 
 
 
223 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.423139  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0254  arginine transporter permease subunit ArtM  52.73 
 
 
227 aa  237  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000745827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2279  arginine transporter permease subunit ArtM  60.37 
 
 
223 aa  228  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0326  arginine transporter permease subunit ArtM  50.47 
 
 
223 aa  208  7e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.95 
 
 
236 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186959  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68090  ABC transporter permease  43.4 
 
 
230 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0277184  normal  0.0135289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5893  ABC transporter permease  43.4 
 
 
230 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  43.4 
 
 
232 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3520  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.28 
 
 
239 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3873  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45 
 
 
244 aa  175  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4050  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.11 
 
 
232 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.285474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0280  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.55 
 
 
229 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139552  hitchhiker  0.000156387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0298  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
229 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0046472  normal  0.109587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4272  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.87 
 
 
256 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000141249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2881  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  43.66 
 
 
229 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0842079  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4914  amino acid ABC transporter permease  43.4 
 
 
229 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0303  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
229 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177039  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5360  amino acid ABC transporter, permease protein  43.4 
 
 
229 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 
229 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000808771  hitchhiker  0.000000082822 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7241  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  43.33 
 
 
230 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.5 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136748  hitchhiker  0.00334449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4484  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.5 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.5 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00987001  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4290  amino acid ABC transporter permease  46.67 
 
 
232 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.60113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3569  amino acid ABC transporter permease  47.27 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118377  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0298  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  42.06 
 
 
241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0309  amino acid ABC transporter permease  41.1 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000829605  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  39.81 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1927  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.13 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1828  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  47.27 
 
 
232 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52770  arginine/ornithine transport protein AotM  46.67 
 
 
232 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0329  amino acid ABC transporter permease  41.59 
 
 
241 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1258  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.51 
 
 
238 aa  158  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.61 
 
 
238 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1960  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  40.09 
 
 
225 aa  158  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2650  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.57 
 
 
239 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.074338  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2783  amino acid ABC transporter permease  39.05 
 
 
243 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  39.25 
 
 
225 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0593  amino acid ABC transporter, permease protein  47.17 
 
 
223 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.035181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.91 
 
 
231 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1592  hypothetical protein  46.54 
 
 
223 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.172559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  38.86 
 
 
225 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5920  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.4 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  normal  0.168825 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6913  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.4 
 
 
234 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77159  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2253  amino acid ABC transporter permease  38.28 
 
 
239 aa  151  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2072  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.06 
 
 
241 aa  150  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4487  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.66 
 
 
238 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131954  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5844  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.87 
 
 
226 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.65 
 
 
248 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4836  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.43 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0697  amino acid ABC transporter permease  41.55 
 
 
237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1176  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1827  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  43.43 
 
 
251 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249434  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3310  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.39 
 
 
240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4288  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
237 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5838  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.35 
 
 
248 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
237 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
237 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  0.172644 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5621  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.35 
 
 
248 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.142283  normal  0.488767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1055  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
237 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2399  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.32 
 
 
240 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 
238 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0337  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 
236 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0952  amino acid ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
277 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5102  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.24 
 
 
250 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00180467  decreased coverage  0.00233971 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6595  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.37 
 
 
248 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.148887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.25 
 
 
237 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587835  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5749  amino acid ABC transporter permease  43.37 
 
 
248 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6113  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.37 
 
 
248 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2831  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  36.57 
 
 
224 aa  141  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1378  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.89 
 
 
238 aa  141  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2788  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 
238 aa  141  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.133608  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7502  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.81 
 
 
236 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>