More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1592 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1592  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  441  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.172559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0593  amino acid ABC transporter, permease protein  98.65 
 
 
223 aa  437  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.035181  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2072  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.58 
 
 
241 aa  208  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0298  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  48.17 
 
 
241 aa  202  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0329  amino acid ABC transporter permease  48.17 
 
 
241 aa  202  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.72 
 
 
236 aa  201  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186959  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5893  ABC transporter permease  45.37 
 
 
230 aa  194  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68090  ABC transporter permease  45.37 
 
 
230 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0277184  normal  0.0135289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4914  amino acid ABC transporter permease  44.44 
 
 
229 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5360  amino acid ABC transporter, permease protein  44.91 
 
 
229 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209442  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3520  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.02 
 
 
239 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0303  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.3 
 
 
229 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177039  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0309  amino acid ABC transporter permease  45.37 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000829605  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.83 
 
 
229 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000808771  hitchhiker  0.000000082822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0298  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.37 
 
 
229 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0046472  normal  0.109587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0280  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  44.91 
 
 
229 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139552  hitchhiker  0.000156387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3873  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.13 
 
 
244 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4050  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.65 
 
 
244 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7241  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  46.48 
 
 
230 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228007  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1258  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.72 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4272  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.98 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000141249 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0698  arginine transporter permease subunit ArtM  42.22 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180995  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.63 
 
 
248 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2881  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  41.43 
 
 
229 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0842079  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.33 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.285474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2650  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.86 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.074338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  42.86 
 
 
232 aa  177  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2559  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
244 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.498875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2253  amino acid ABC transporter permease  43.98 
 
 
239 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001575  arginine ABC transporter permease protein ArtM  41.82 
 
 
222 aa  175  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.432738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05531  arginine transporter permease subunit ArtM  41.82 
 
 
222 aa  175  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1927  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.75 
 
 
243 aa  175  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6602  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.45 
 
 
246 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0254  arginine transporter permease subunit ArtM  40 
 
 
227 aa  168  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000745827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4290  amino acid ABC transporter permease  42.38 
 
 
232 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52770  arginine/ornithine transport protein AotM  43.33 
 
 
232 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  42.33 
 
 
225 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2566  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 
238 aa  165  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1653  arginine transporter permease subunit ArtM  40.28 
 
 
222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.78 
 
 
232 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136748  hitchhiker  0.00334449 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0992  arginine transporter permease subunit ArtM  42.59 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2783  amino acid ABC transporter permease  42.86 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1023  arginine transporter permease subunit ArtM  42.59 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0960  arginine transporter permease subunit ArtM  42.59 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4484  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  46.39 
 
 
232 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.39 
 
 
232 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00987001  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1042  arginine transporter permease subunit ArtM  42.59 
 
 
222 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241567  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0925  arginine transporter permease subunit ArtM  42.59 
 
 
222 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.197831  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.39 
 
 
232 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.60113 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  41.47 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1960  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  39.35 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3310  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.99 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0337  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
236 aa  161  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.96 
 
 
238 aa  161  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00866  arginine transporter subunit  42.59 
 
 
222 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501538  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00872  hypothetical protein  42.59 
 
 
222 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2781  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.59 
 
 
222 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0249493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1828  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  44.07 
 
 
232 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2581  histidine ABC transporter permease HisM  40.36 
 
 
235 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2735  arginine transporter permease subunit ArtM  42.59 
 
 
222 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00627055  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0965  arginine transporter permease subunit ArtM  42.59 
 
 
222 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2593  histidine ABC transporter permease HisM  40.36 
 
 
235 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2470  arginine transporter permease subunit ArtM  42.59 
 
 
222 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.156065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1021  arginine transporter permease subunit ArtM  42.59 
 
 
222 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.487337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2539  histidine ABC transporter permease protein HisM  40.36 
 
 
235 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2493  histidine ABC transporter, permease protein HisM  40.36 
 
 
235 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.411167  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
231 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0934  arginine transporter permease subunit ArtM  42.59 
 
 
222 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0889  arginine transporter permease subunit ArtM  42.13 
 
 
222 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.13715  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1378  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 
238 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1430  histidine ABC transporter, permease protein HisM  40.72 
 
 
238 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00742165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1540  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.72 
 
 
238 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3569  amino acid ABC transporter permease  43.5 
 
 
232 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118377  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1377  arginine transporter permease subunit ArtM  41.2 
 
 
222 aa  158  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1580  arginine transporter permease subunit ArtM  41.2 
 
 
222 aa  158  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2628  arginine transporter permease subunit ArtM  41.2 
 
 
222 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0454966  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2713  arginine transporter permease subunit ArtM  41.2 
 
 
222 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2788  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.07 
 
 
238 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.133608  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0351  histidine transport system permease HisM  40.72 
 
 
238 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0315453  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2702  histidine ABC transporter permease HisM  39.91 
 
 
235 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6913  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.05 
 
 
234 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77159  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5920  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  normal  0.168825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.46 
 
 
237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.503523  normal  0.240176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02232  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  39.82 
 
 
238 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1349  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.82 
 
 
238 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.184069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2601  histidine ABC transporter, permease protein HisM  39.82 
 
 
238 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0344679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1345  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.82 
 
 
238 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.470643  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02192  hypothetical protein  39.82 
 
 
238 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2685  histidine ABC transporter, permease protein HisM  39.82 
 
 
238 aa  155  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.334636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4284  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.55 
 
 
231 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3447  histidine ABC transporter, permease protein HisM  39.82 
 
 
238 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.885693  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2463  histidine ABC transporter, permease protein HisM  39.82 
 
 
238 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.624067  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3324  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.37 
 
 
234 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.453192  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4288  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  37.85 
 
 
237 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4839  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
231 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5844  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.58 
 
 
226 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2457  histidine ABC transporter, permease protein HisM  39.37 
 
 
238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.426511  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6802  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
231 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.85 
 
 
237 aa  151  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>