More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1653 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1653  arginine transporter permease subunit ArtM  100 
 
 
222 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1580  arginine transporter permease subunit ArtM  91.44 
 
 
222 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2713  arginine transporter permease subunit ArtM  91.44 
 
 
222 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2628  arginine transporter permease subunit ArtM  91.44 
 
 
222 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0454966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00866  arginine transporter subunit  81.53 
 
 
222 aa  380  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2781  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  81.53 
 
 
222 aa  380  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0249493  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0934  arginine transporter permease subunit ArtM  81.53 
 
 
222 aa  380  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00872  hypothetical protein  81.53 
 
 
222 aa  380  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2470  arginine transporter permease subunit ArtM  81.53 
 
 
222 aa  380  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.156065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0965  arginine transporter permease subunit ArtM  81.53 
 
 
222 aa  380  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1021  arginine transporter permease subunit ArtM  81.53 
 
 
222 aa  380  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.487337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2735  arginine transporter permease subunit ArtM  81.53 
 
 
222 aa  380  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00627055  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0889  arginine transporter permease subunit ArtM  81.53 
 
 
222 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.13715  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0925  arginine transporter permease subunit ArtM  81.08 
 
 
222 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.197831  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1042  arginine transporter permease subunit ArtM  81.08 
 
 
222 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241567  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1023  arginine transporter permease subunit ArtM  80.63 
 
 
222 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1377  arginine transporter permease subunit ArtM  78.83 
 
 
222 aa  371  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0960  arginine transporter permease subunit ArtM  80.63 
 
 
222 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0992  arginine transporter permease subunit ArtM  80.63 
 
 
222 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1965  arginine transporter permease subunit ArtM  85.14 
 
 
222 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.385135  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1699  arginine transporter permease subunit ArtM  84.68 
 
 
222 aa  361  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0315735  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2379  arginine transporter permease subunit ArtM  82.88 
 
 
223 aa  340  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.423139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2279  arginine transporter permease subunit ArtM  81.53 
 
 
223 aa  328  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0698  arginine transporter permease subunit ArtM  60.09 
 
 
222 aa  263  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180995  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0326  arginine transporter permease subunit ArtM  57.66 
 
 
223 aa  262  3e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05531  arginine transporter permease subunit ArtM  60.28 
 
 
222 aa  252  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001575  arginine ABC transporter permease protein ArtM  59.81 
 
 
222 aa  251  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.432738  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0254  arginine transporter permease subunit ArtM  55.25 
 
 
227 aa  241  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000745827  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7241  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  41.7 
 
 
230 aa  165  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228007  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0298  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 
241 aa  160  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
236 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186959  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0329  amino acid ABC transporter permease  41.01 
 
 
241 aa  158  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4272  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.4 
 
 
256 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000141249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  40.91 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3520  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 
239 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5893  ABC transporter permease  37.21 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68090  ABC transporter permease  36.74 
 
 
230 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0277184  normal  0.0135289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2253  amino acid ABC transporter permease  39.25 
 
 
239 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2072  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.01 
 
 
241 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5360  amino acid ABC transporter, permease protein  39.07 
 
 
229 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209442  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0280  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  39.07 
 
 
229 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139552  hitchhiker  0.000156387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4050  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.35 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0298  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0046472  normal  0.109587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0303  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177039  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.64 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.285474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
229 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000808771  hitchhiker  0.000000082822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0309  amino acid ABC transporter permease  40 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000829605  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52770  arginine/ornithine transport protein AotM  40.45 
 
 
232 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.15 
 
 
265 aa  144  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6913  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
234 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77159  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4914  amino acid ABC transporter permease  38.14 
 
 
229 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0593  amino acid ABC transporter, permease protein  45.56 
 
 
223 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.035181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4290  amino acid ABC transporter permease  39.09 
 
 
232 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1592  hypothetical protein  44.97 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.172559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3873  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.69 
 
 
232 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136748  hitchhiker  0.00334449 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5920  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
234 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  normal  0.168825 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5844  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1960  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  35 
 
 
225 aa  138  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223037  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.18 
 
 
248 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2559  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.59 
 
 
244 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.498875  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.19 
 
 
232 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.60113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3310  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.94 
 
 
240 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4484  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  37.69 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1828  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  40.88 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.69 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00987001  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  35 
 
 
225 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2881  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  39.46 
 
 
229 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0842079  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1258  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.23 
 
 
238 aa  134  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.24 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.740721  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0952  amino acid ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 
277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4487  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.51 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131954  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2783  amino acid ABC transporter permease  35.68 
 
 
243 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1927  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.09 
 
 
243 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2237  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.26 
 
 
277 aa  131  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.655968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  34.55 
 
 
225 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3569  amino acid ABC transporter permease  39.78 
 
 
232 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118377  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2650  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.23 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.074338  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4836  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.81 
 
 
250 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7506  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  33.49 
 
 
226 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2291  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.76 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1827  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  38.81 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249434  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2430  putative arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0588  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein, putative  36.79 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2861  putative arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2731  histidine transport system permease protein  36.79 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1740  putative arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.74 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587835  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2790  histidine ABC transporter, permease protein HisM  36.79 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2852  histidine transport system permease protein  36.45 
 
 
516 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2064  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  32.39 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3392  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  36.79 
 
 
237 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.44 
 
 
231 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5621  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
248 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.142283  normal  0.488767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5838  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
248 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6602  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.11 
 
 
246 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1121  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.98 
 
 
237 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0596  amino acid ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 
235 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.165061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>