More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2852 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2852  histidine transport system permease protein  100 
 
 
516 aa  1016    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1246  histidine transport system permease protein  69.57 
 
 
492 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2594  histidine transport system permease protein  64.99 
 
 
636 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2790  histidine ABC transporter, permease protein HisM  100 
 
 
237 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2731  histidine transport system permease protein  99.58 
 
 
237 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0588  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein, putative  99.58 
 
 
237 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1740  putative arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  99.58 
 
 
237 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2861  putative arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  99.58 
 
 
237 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2430  putative arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  99.58 
 
 
237 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1772  amino acid ABC transporter, permease protein  97.05 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4288  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  93.67 
 
 
237 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  93.67 
 
 
237 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1055  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  93.67 
 
 
237 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  92.41 
 
 
237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  0.172644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  91.98 
 
 
237 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0697  amino acid ABC transporter permease  91.98 
 
 
237 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1176  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  91.98 
 
 
237 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  86.08 
 
 
237 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587835  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2926  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, innermembrane subunit  85.23 
 
 
237 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353786  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  84.81 
 
 
237 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7502  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  76.72 
 
 
236 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2410  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  75.86 
 
 
237 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1794  amino acid ABC transporter permease  75.86 
 
 
237 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2406  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  75.86 
 
 
237 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5733  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  75 
 
 
237 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0884  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  75 
 
 
237 aa  362  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.542408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2316  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  74.57 
 
 
237 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247214  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2451  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  74.57 
 
 
237 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195128  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1121  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  73.71 
 
 
237 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3016  histidine ABC transporter, permease protein  74.14 
 
 
237 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121232  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1581  histidine ABC transporter, permease protein HisM  74.14 
 
 
237 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0745  amino acid ABC transporter, permease protein  74.14 
 
 
237 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0396612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1088  histidine ABC transporter, permease protein HisM  74.14 
 
 
237 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890652  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1093  histidine ABC transporter, permease protein HisM  74.14 
 
 
237 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0986  histidine ABC transporter, permease protein  74.14 
 
 
237 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.983697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0888  amino acid ABC transporter, permease protein  74.14 
 
 
237 aa  359  7e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3392  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  73.28 
 
 
237 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  72.41 
 
 
237 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000275553  hitchhiker  0.0000000592731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3876  amino acid ABC transporter permease  69.83 
 
 
236 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4138  amino acid ABC transporter, permease protein  69.4 
 
 
236 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1208  amino acid ABC transporter permease  68.53 
 
 
236 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2376  ABC His/Glu/Gln/Arg/opine transporter, inner membrane subunit  66.09 
 
 
237 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230602  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4637  amino acid ABC transporter permease  66.09 
 
 
237 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3726  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.09 
 
 
237 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0910034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3795  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.52 
 
 
237 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5002  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.24 
 
 
237 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613276  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5465  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.09 
 
 
237 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3608  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.09 
 
 
237 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.925152  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1090  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  68.53 
 
 
237 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1239  histidine ABC transporter, permease protein  68.53 
 
 
237 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1356  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  68.53 
 
 
237 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.623  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0482  histidine ABC transporter, permease protein  68.53 
 
 
237 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.194829  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1441  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  68.53 
 
 
237 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0209  histidine ABC transporter, permease protein  68.53 
 
 
237 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1409  histidine ABC transporter, permease protein  68.1 
 
 
237 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169311  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3324  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.91 
 
 
234 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.453192  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1540  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.36 
 
 
238 aa  312  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1430  histidine ABC transporter, permease protein HisM  63.36 
 
 
238 aa  312  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00742165  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2539  histidine ABC transporter permease protein HisM  63.32 
 
 
235 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2593  histidine ABC transporter permease HisM  63.32 
 
 
235 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2581  histidine ABC transporter permease HisM  63.32 
 
 
235 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2493  histidine ABC transporter, permease protein HisM  63.32 
 
 
235 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.411167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0351  histidine transport system permease HisM  62.93 
 
 
238 aa  310  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0315453  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2566  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.81 
 
 
238 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2702  histidine ABC transporter permease HisM  62.88 
 
 
235 aa  309  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2788  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.81 
 
 
238 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.133608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02232  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  62.01 
 
 
238 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1349  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.01 
 
 
238 aa  307  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.184069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02192  hypothetical protein  62.01 
 
 
238 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2463  histidine ABC transporter, permease protein HisM  62.01 
 
 
238 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.624067  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2685  histidine ABC transporter, permease protein HisM  62.01 
 
 
238 aa  307  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.334636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26220  histidine ABC transporter, inner membrane permease  63.29 
 
 
237 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal  0.637983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3447  histidine ABC transporter, permease protein HisM  62.01 
 
 
238 aa  307  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.885693  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2601  histidine ABC transporter, permease protein HisM  62.01 
 
 
238 aa  307  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0344679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1345  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.01 
 
 
238 aa  307  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.470643  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.07 
 
 
237 aa  305  9.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.503523  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.38 
 
 
238 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2457  histidine ABC transporter, permease protein HisM  61.57 
 
 
238 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.426511  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1378  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.63 
 
 
238 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2881  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  54.46 
 
 
229 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0842079  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.23 
 
 
232 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.285474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1927  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.08 
 
 
243 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  52.04 
 
 
232 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  51.17 
 
 
225 aa  206  9e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  50.7 
 
 
225 aa  200  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2559  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.01 
 
 
244 aa  196  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.498875  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  50.7 
 
 
225 aa  196  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52770  arginine/ornithine transport protein AotM  52.49 
 
 
232 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.76 
 
 
232 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136748  hitchhiker  0.00334449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1828  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  52.69 
 
 
232 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2783  amino acid ABC transporter permease  48.61 
 
 
243 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.78 
 
 
232 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.60113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3310  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.22 
 
 
240 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4484  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  48.29 
 
 
232 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.29 
 
 
232 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00987001  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3569  amino acid ABC transporter permease  52.15 
 
 
232 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118377  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1960  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  47.57 
 
 
225 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223037  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4290  amino acid ABC transporter permease  49.54 
 
 
232 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.95 
 
 
231 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.89 
 
 
248 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>