More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4487 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4487  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
238 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131954  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  86.55 
 
 
238 aa  362  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3520  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.95 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7241  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  56.95 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4050  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.42 
 
 
244 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3873  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.42 
 
 
244 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1258  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.85 
 
 
238 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2650  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.074338  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5920  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.78 
 
 
234 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  normal  0.168825 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6913  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.78 
 
 
234 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77159  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4836  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.15 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1827  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  49.79 
 
 
251 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249434  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6595  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.09 
 
 
248 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.148887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5749  amino acid ABC transporter permease  48.09 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6113  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.09 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4914  amino acid ABC transporter permease  48.36 
 
 
229 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5360  amino acid ABC transporter, permease protein  48.36 
 
 
229 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209442  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5838  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.46 
 
 
248 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5621  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.46 
 
 
248 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.142283  normal  0.488767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.25 
 
 
236 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186959  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4272  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.11 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000141249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5102  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.94 
 
 
250 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00180467  decreased coverage  0.00233971 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.85 
 
 
248 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.6 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.740721  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0309  amino acid ABC transporter permease  46.3 
 
 
229 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000829605  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0280  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  45.54 
 
 
229 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139552  hitchhiker  0.000156387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.54 
 
 
229 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000808771  hitchhiker  0.000000082822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0298  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.54 
 
 
229 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0046472  normal  0.109587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2291  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.19 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0303  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.07 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177039  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5893  ABC transporter permease  44.08 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2253  amino acid ABC transporter permease  43.58 
 
 
239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68090  ABC transporter permease  43.6 
 
 
230 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0277184  normal  0.0135289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2559  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.42 
 
 
244 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.498875  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0698  arginine transporter permease subunit ArtM  44.65 
 
 
222 aa  168  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180995  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2072  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.23 
 
 
241 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0298  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  43.4 
 
 
241 aa  160  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2064  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  42.92 
 
 
276 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1927  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.67 
 
 
243 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  41.44 
 
 
232 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0329  amino acid ABC transporter permease  43.4 
 
 
241 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.44 
 
 
232 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.285474 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1590  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.51 
 
 
276 aa  158  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5844  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.95 
 
 
226 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05531  arginine transporter permease subunit ArtM  44.17 
 
 
222 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  41.05 
 
 
225 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001575  arginine ABC transporter permease protein ArtM  43.69 
 
 
222 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.432738  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7506  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  42.41 
 
 
226 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2810  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.34 
 
 
236 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619104  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.18 
 
 
265 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2881  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  43.46 
 
 
229 aa  151  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0842079  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.62 
 
 
232 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136748  hitchhiker  0.00334449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52770  arginine/ornithine transport protein AotM  46.39 
 
 
232 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  39.3 
 
 
225 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4290  amino acid ABC transporter permease  42.72 
 
 
232 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0952  amino acid ABC transporter, permease protein  41.51 
 
 
277 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.54 
 
 
232 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.60113 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.66 
 
 
237 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587835  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4484  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.54 
 
 
232 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.54 
 
 
232 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00987001  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  38.86 
 
 
225 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1960  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  37.89 
 
 
225 aa  148  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223037  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2237  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 
277 aa  148  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.655968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2783  amino acid ABC transporter permease  41.7 
 
 
243 aa  148  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2831  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  44.71 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.43 
 
 
231 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2321  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.4 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00866  arginine transporter subunit  41.63 
 
 
222 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2781  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.63 
 
 
222 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0249493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1021  arginine transporter permease subunit ArtM  41.63 
 
 
222 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.487337 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00872  hypothetical protein  41.63 
 
 
222 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0965  arginine transporter permease subunit ArtM  41.63 
 
 
222 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3569  amino acid ABC transporter permease  42.05 
 
 
232 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118377  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2735  arginine transporter permease subunit ArtM  41.63 
 
 
222 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00627055  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2470  arginine transporter permease subunit ArtM  41.63 
 
 
222 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.156065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0934  arginine transporter permease subunit ArtM  41.63 
 
 
222 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3310  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.67 
 
 
240 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0337  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.99 
 
 
236 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3595  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  42.46 
 
 
236 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1828  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  44.58 
 
 
232 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2177  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.46 
 
 
236 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0363854  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0889  arginine transporter permease subunit ArtM  41.63 
 
 
222 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.13715  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0697  amino acid ABC transporter permease  43.2 
 
 
237 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1055  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.2 
 
 
237 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2566  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.2 
 
 
238 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167761  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1176  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.2 
 
 
237 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.2 
 
 
237 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.2 
 
 
237 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 
237 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  0.172644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1042  arginine transporter permease subunit ArtM  42.11 
 
 
222 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241567  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0925  arginine transporter permease subunit ArtM  42.11 
 
 
222 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.197831  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1023  arginine transporter permease subunit ArtM  42.11 
 
 
222 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0992  arginine transporter permease subunit ArtM  42.11 
 
 
222 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0960  arginine transporter permease subunit ArtM  42.11 
 
 
222 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1377  arginine transporter permease subunit ArtM  41.15 
 
 
222 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4288  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  43.2 
 
 
237 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.35 
 
 
220 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1772  amino acid ABC transporter, permease protein  44.17 
 
 
237 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2926  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, innermembrane subunit  41.75 
 
 
237 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353786  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5016  ABC transporter membrane spanning protein  42.18 
 
 
229 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>