More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3520 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3520  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
239 aa  477  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4050  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.79 
 
 
244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3873  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.91 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7241  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  60.18 
 
 
230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.47 
 
 
238 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5920  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.28 
 
 
234 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  normal  0.168825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1258  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48 
 
 
238 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4487  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.95 
 
 
238 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131954  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.88 
 
 
236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186959  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2650  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.11 
 
 
239 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.074338  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6913  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.35 
 
 
234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77159  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5749  amino acid ABC transporter permease  48.26 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6113  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.26 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6595  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.26 
 
 
248 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.148887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1827  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  48.44 
 
 
251 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249434  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4836  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.44 
 
 
250 aa  214  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5621  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.58 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.142283  normal  0.488767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5838  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.58 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5102  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.72 
 
 
250 aa  207  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00180467  decreased coverage  0.00233971 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.25 
 
 
248 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  46.79 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4272  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.69 
 
 
256 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000141249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2253  amino acid ABC transporter permease  44.35 
 
 
239 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.87 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.285474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4914  amino acid ABC transporter permease  47.78 
 
 
229 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4290  amino acid ABC transporter permease  49.76 
 
 
232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0303  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.77 
 
 
229 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177039  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0329  amino acid ABC transporter permease  47.25 
 
 
241 aa  195  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.76 
 
 
232 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136748  hitchhiker  0.00334449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.79 
 
 
229 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000808771  hitchhiker  0.000000082822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5360  amino acid ABC transporter, permease protein  47.78 
 
 
229 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0298  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  47.25 
 
 
241 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0280  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  48.28 
 
 
229 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139552  hitchhiker  0.000156387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.76 
 
 
232 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.60113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0298  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.28 
 
 
229 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0046472  normal  0.109587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4484  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  48.76 
 
 
232 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.76 
 
 
232 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00987001  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1927  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.38 
 
 
243 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68090  ABC transporter permease  47.76 
 
 
230 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0277184  normal  0.0135289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5893  ABC transporter permease  47.76 
 
 
230 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0309  amino acid ABC transporter permease  45.89 
 
 
229 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000829605  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52770  arginine/ornithine transport protein AotM  49.21 
 
 
232 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2072  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.53 
 
 
241 aa  187  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3569  amino acid ABC transporter permease  49.25 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118377  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5844  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.49 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2881  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  41.59 
 
 
229 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0842079  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1828  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  49.25 
 
 
232 aa  181  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0337  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.04 
 
 
236 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0698  arginine transporter permease subunit ArtM  41.63 
 
 
222 aa  178  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180995  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7506  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  46.92 
 
 
226 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05531  arginine transporter permease subunit ArtM  43.78 
 
 
222 aa  171  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.99 
 
 
231 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3310  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.84 
 
 
240 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2559  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 
244 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.498875  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001575  arginine ABC transporter permease protein ArtM  43.28 
 
 
222 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.432738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  40.53 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2783  amino acid ABC transporter permease  41.31 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1592  hypothetical protein  45.02 
 
 
223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.172559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0593  amino acid ABC transporter, permease protein  45.5 
 
 
223 aa  164  9e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.035181  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  39.21 
 
 
225 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  39.21 
 
 
225 aa  158  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4288  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  40.93 
 
 
237 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6802  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.29 
 
 
231 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1377  arginine transporter permease subunit ArtM  41.01 
 
 
222 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1960  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  40.47 
 
 
225 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223037  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.93 
 
 
237 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.93 
 
 
237 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0697  amino acid ABC transporter permease  40.93 
 
 
237 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1055  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.93 
 
 
237 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1176  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.93 
 
 
237 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
276 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.740721  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00866  arginine transporter subunit  40.09 
 
 
222 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2781  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
222 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0249493  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0934  arginine transporter permease subunit ArtM  40.09 
 
 
222 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2470  arginine transporter permease subunit ArtM  40.09 
 
 
222 aa  155  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.156065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2735  arginine transporter permease subunit ArtM  40.09 
 
 
222 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00627055  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1021  arginine transporter permease subunit ArtM  40.09 
 
 
222 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.487337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.47 
 
 
237 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  0.172644 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00872  hypothetical protein  40.09 
 
 
222 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0965  arginine transporter permease subunit ArtM  40.09 
 
 
222 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0889  arginine transporter permease subunit ArtM  40.09 
 
 
222 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.13715  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1023  arginine transporter permease subunit ArtM  40.09 
 
 
222 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0960  arginine transporter permease subunit ArtM  40.09 
 
 
222 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0992  arginine transporter permease subunit ArtM  40.09 
 
 
222 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.4 
 
 
237 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587835  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0925  arginine transporter permease subunit ArtM  40.09 
 
 
222 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.197831  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1042  arginine transporter permease subunit ArtM  40.09 
 
 
222 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241567  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1121  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.99 
 
 
237 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5067  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.16 
 
 
229 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404951  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5016  ABC transporter membrane spanning protein  38.29 
 
 
229 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2291  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
276 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1772  amino acid ABC transporter, permease protein  40 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1653  arginine transporter permease subunit ArtM  38.71 
 
 
222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  40.81 
 
 
234 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  41.7 
 
 
235 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4839  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
231 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  41.7 
 
 
235 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
222 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  41.26 
 
 
226 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  41.26 
 
 
232 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>