More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2058 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
276 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.740721  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2291  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  94.57 
 
 
276 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1590  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.75 
 
 
276 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2064  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  67.39 
 
 
276 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2237  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.71 
 
 
277 aa  351  8e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.655968  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0952  amino acid ABC transporter, permease protein  66.67 
 
 
277 aa  350  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.06 
 
 
265 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2321  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.56 
 
 
236 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2810  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60 
 
 
236 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619104  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3595  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  58.22 
 
 
236 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2177  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.22 
 
 
236 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0363854  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0596  amino acid ABC transporter, permease protein  51.77 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.165061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44 
 
 
236 aa  185  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186959  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7241  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  45.05 
 
 
230 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  42.86 
 
 
225 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  42.4 
 
 
225 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5893  ABC transporter permease  45.62 
 
 
230 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68090  ABC transporter permease  45.16 
 
 
230 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0277184  normal  0.0135289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2253  amino acid ABC transporter permease  43.87 
 
 
239 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4914  amino acid ABC transporter permease  43.84 
 
 
229 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5360  amino acid ABC transporter, permease protein  44.29 
 
 
229 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4272  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.91 
 
 
256 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000141249 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  41.47 
 
 
225 aa  168  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
229 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000808771  hitchhiker  0.000000082822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1927  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.02 
 
 
243 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0303  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
229 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177039  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0309  amino acid ABC transporter permease  43.78 
 
 
229 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000829605  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1960  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  40.55 
 
 
225 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223037  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2783  amino acid ABC transporter permease  40 
 
 
243 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0280  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.94 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139552  hitchhiker  0.000156387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0298  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 
229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0046472  normal  0.109587 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2559  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.498875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  40.28 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.76 
 
 
232 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.285474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.22 
 
 
238 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2881  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  41.52 
 
 
229 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0842079  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4050  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.45 
 
 
244 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2650  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.22 
 
 
239 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.074338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3310  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
240 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4487  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 
238 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131954  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0298  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  38.67 
 
 
241 aa  156  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3520  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
239 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0329  amino acid ABC transporter permease  39.74 
 
 
241 aa  156  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3873  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.51 
 
 
244 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2072  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
241 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52770  arginine/ornithine transport protein AotM  40.76 
 
 
232 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.85 
 
 
248 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1258  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
238 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.27 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136748  hitchhiker  0.00334449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2831  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  41.84 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.78 
 
 
232 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.60113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4484  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  38.27 
 
 
232 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.784127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4290  amino acid ABC transporter permease  38.43 
 
 
232 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.27 
 
 
232 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00987001  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6802  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.53 
 
 
231 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1699  arginine transporter permease subunit ArtM  37.74 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0315735  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5920  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.68 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  normal  0.168825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00866  arginine transporter subunit  36.62 
 
 
222 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2781  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.62 
 
 
222 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0249493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2735  arginine transporter permease subunit ArtM  36.62 
 
 
222 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00627055  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2470  arginine transporter permease subunit ArtM  36.62 
 
 
222 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.156065  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4284  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
231 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00872  hypothetical protein  36.62 
 
 
222 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0934  arginine transporter permease subunit ArtM  36.62 
 
 
222 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1021  arginine transporter permease subunit ArtM  36.62 
 
 
222 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.487337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0965  arginine transporter permease subunit ArtM  36.62 
 
 
222 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0698  arginine transporter permease subunit ArtM  37.62 
 
 
222 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3392  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  41.04 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0889  arginine transporter permease subunit ArtM  36.15 
 
 
222 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.13715  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2566  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
238 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167761  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5222  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
318 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.162381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5733  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
237 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02232  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  38.77 
 
 
238 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1349  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.77 
 
 
238 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.184069  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2410  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
237 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752088 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1345  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.77 
 
 
238 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.470643  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2601  histidine ABC transporter, permease protein HisM  38.77 
 
 
238 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0344679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1121  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.65 
 
 
237 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2685  histidine ABC transporter, permease protein HisM  38.77 
 
 
238 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.334636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3447  histidine ABC transporter, permease protein HisM  38.77 
 
 
238 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.885693  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4839  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
231 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2463  histidine ABC transporter, permease protein HisM  38.77 
 
 
238 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.624067  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02192  hypothetical protein  38.77 
 
 
238 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.11 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1794  amino acid ABC transporter permease  39.73 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1055  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.11 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2406  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
237 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000275553  hitchhiker  0.0000000592731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4288  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  38.67 
 
 
237 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1965  arginine transporter permease subunit ArtM  37.26 
 
 
222 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.385135  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6913  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.21 
 
 
234 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77159  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0888  amino acid ABC transporter, permease protein  41.47 
 
 
237 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
238 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0884  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
237 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.542408 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2790  histidine ABC transporter, permease protein HisM  38.67 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.22 
 
 
237 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2852  histidine transport system permease protein  39.34 
 
 
516 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2926  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, innermembrane subunit  39.56 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353786  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0697  amino acid ABC transporter permease  38.22 
 
 
237 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>