More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1564 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
265 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0952  amino acid ABC transporter, permease protein  67.55 
 
 
277 aa  350  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2291  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.81 
 
 
276 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2237  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.53 
 
 
277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.655968  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1590  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.58 
 
 
276 aa  340  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2058  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.06 
 
 
276 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.740721  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2064  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  63.12 
 
 
276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2321  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.22 
 
 
236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3595  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  58.67 
 
 
236 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2177  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.67 
 
 
236 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0363854  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2810  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.33 
 
 
236 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619104  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0596  amino acid ABC transporter, permease protein  51.72 
 
 
235 aa  236  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.165061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1115  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.41 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186959  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01552  ABC transporter permease  42.15 
 
 
225 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1960  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  43.52 
 
 
225 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223037  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003970  histidine ABC transporter permease protein HisM  41.7 
 
 
225 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7241  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  47.25 
 
 
230 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228007  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2072  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.61 
 
 
241 aa  175  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1452  amino acid ABC transporter, permease protein  41.7 
 
 
225 aa  175  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000068563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2253  amino acid ABC transporter permease  42.48 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5893  ABC transporter permease  42.15 
 
 
230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68090  ABC transporter permease  41.7 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0277184  normal  0.0135289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2559  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.44 
 
 
244 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.498875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4914  amino acid ABC transporter permease  40.72 
 
 
229 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0298  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 
241 aa  170  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5360  amino acid ABC transporter, permease protein  40.72 
 
 
229 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0329  amino acid ABC transporter permease  38.94 
 
 
241 aa  168  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
229 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000808771  hitchhiker  0.000000082822 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2831  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  45.02 
 
 
224 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4272  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.7 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000141249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2881  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  42.67 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0842079  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2783  amino acid ABC transporter permease  40.68 
 
 
243 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0303  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177039  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0280  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  39.27 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139552  hitchhiker  0.000156387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0298  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0046472  normal  0.109587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0309  amino acid ABC transporter permease  40.64 
 
 
229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000829605  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4624  arginine/ornithine transport protein AotM  42.18 
 
 
232 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3310  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.72 
 
 
240 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.37 
 
 
232 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.285474 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6802  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
231 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1927  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.61 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4284  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.67 
 
 
231 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4839  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 
231 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  38.39 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52770  arginine/ornithine transport protein AotM  41.71 
 
 
232 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5002  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
237 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613276  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5181  cystine ABC transporter, permease protein, putative  41.4 
 
 
222 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0357  amino acid ABC transporter permease  41.4 
 
 
222 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1653  arginine transporter permease subunit ArtM  36.15 
 
 
222 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4930  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.23 
 
 
248 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1699  arginine transporter permease subunit ArtM  39.15 
 
 
222 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0315735  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3608  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
237 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.925152  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2650  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.25 
 
 
239 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.074338  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5465  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
237 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2032  amino acid ABC transporter permease  37.84 
 
 
220 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.73 
 
 
219 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2376  ABC His/Glu/Gln/Arg/opine transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
237 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230602  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0243  amino acid ABC transporter permease  42.79 
 
 
221 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0254  arginine transporter permease subunit ArtM  37.16 
 
 
227 aa  142  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000745827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1965  arginine transporter permease subunit ArtM  38.68 
 
 
222 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.385135  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3520  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
239 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00866  arginine transporter subunit  35.21 
 
 
222 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2781  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.21 
 
 
222 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0249493  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2470  arginine transporter permease subunit ArtM  35.21 
 
 
222 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.156065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00872  hypothetical protein  35.21 
 
 
222 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0934  arginine transporter permease subunit ArtM  35.21 
 
 
222 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4487  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.82 
 
 
238 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131954  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0965  arginine transporter permease subunit ArtM  35.21 
 
 
222 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2735  arginine transporter permease subunit ArtM  35.21 
 
 
222 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00627055  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 
228 aa  142  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1021  arginine transporter permease subunit ArtM  35.21 
 
 
222 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.487337 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0588  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein, putative  43.27 
 
 
237 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2731  histidine transport system permease protein  43.27 
 
 
237 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1740  putative arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  43.27 
 
 
237 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 
220 aa  141  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2430  putative arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  43.27 
 
 
237 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2861  putative arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  43.27 
 
 
237 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0889  arginine transporter permease subunit ArtM  34.74 
 
 
222 aa  141  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.13715  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4637  amino acid ABC transporter permease  39.11 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4050  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3726  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.11 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0910034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3795  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.56 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2790  histidine ABC transporter, permease protein HisM  42.79 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1377  arginine transporter permease subunit ArtM  34.74 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0698  arginine transporter permease subunit ArtM  38.46 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180995  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.78 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.136748  hitchhiker  0.00334449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2566  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.4 
 
 
238 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167761  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0925  arginine transporter permease subunit ArtM  36.15 
 
 
222 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.197831  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1409  histidine ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 
237 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1258  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.52 
 
 
238 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1042  arginine transporter permease subunit ArtM  36.15 
 
 
222 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241567  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  37.61 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  37.61 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  37.61 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  37.61 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  37.61 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2181  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
224 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979966 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  37.61 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  37.61 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1772  amino acid ABC transporter, permease protein  42.79 
 
 
237 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>