More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1842 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1842  inner-membrane translocator  100 
 
 		 330 aa  639    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.428217 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  75.38 
 
 		 334 aa  505  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1646  inner-membrane translocator  78.9 
 
 		 335 aa  482  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.12829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  75.91 
 
 		 334 aa  476  1e-133  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 362 aa  172  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  35.47 
 
 		 365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  34.86 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 371 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 365 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 355 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  35 
 
 		 442 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 344 aa  145  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 377 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 360 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.42 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 367 aa  139  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  29.48 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  32.01 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.08 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 356 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 376 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  32.73 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 451 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.94 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  31.9 
 
 		 361 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  31 
 
 		 360 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  31 
 
 		 360 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  35 
 
 		 364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  27.61 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.7 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  30.89 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  29.66 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.33 
 
 		 471 aa  125  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 355 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 366 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 370 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  29.66 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  31.46 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  29.88 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 388 aa  122  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  30.47 
 
 		 368 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4443  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 363 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0008  ABC transporter, permease protein, putative  29.63 
 
 		 359 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  28.79 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  29.2 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  28.36 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  31.5 
 
 		 352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  31.5 
 
 		 352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  31.5 
 
 		 352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.35 
 
 		 381 aa  116  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>