More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0444 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0444  inner-membrane translocator  100 
 
 		 359 aa  701    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0590  inner-membrane translocator  70.72 
 
 		 363 aa  513  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.293157  hitchhiker  0.0000778251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1581  inner-membrane translocator  67.22 
 
 		 363 aa  495  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1760  inner-membrane translocator  70.08 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0155295  hitchhiker  0.000793372 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 349 aa  209  7e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0318  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.936924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1803  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 369 aa  176  8e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.68636 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1505  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1578  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0304091  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0827  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 339 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  26.58 
 
 		 504 aa  115  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 454 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 294 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  27.09 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  33.14 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1276  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 441 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.521519 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0858  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0325  inner-membrane translocator  25.54 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  27.37 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0332  inner-membrane translocator  25.27 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1517  hypothetical protein  27.87 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845937  normal  0.47549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  26.91 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 345 aa  99.8  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  26.33 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  26.07 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2157  inner-membrane translocator  27.32 
 
 		 443 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 377 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  26.48 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3928  inner-membrane translocator  27.41 
 
 		 446 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 295 aa  96.3  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  26.52 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  26.51 
 
 		 435 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  27.7 
 
 		 463 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3962  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  26.26 
 
 		 347 aa  93.6  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  25.64 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  29 
 
 		 463 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  27.25 
 
 		 372 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3841  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 295 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  25.85 
 
 		 393 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3705  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4911  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2097  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 440 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.877591  normal  0.0148892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2030  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.710077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  28.51 
 
 		 326 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1828  inner-membrane translocator  26.22 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  27.43 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0922  inner-membrane translocator  27.43 
 
 		 431 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.636778  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4469  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 295 aa  90.5  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1207  inner-membrane translocator  26.3 
 
 		 541 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0120652  normal  0.236247 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1572  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 431 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.207353  normal  0.412707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2933  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  26.86 
 
 		 320 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  26.49 
 
 		 358 aa  89.7  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2927  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.33 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  27.12 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  29.6 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  27.07 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  26.76 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0772  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.4 
 
 		 350 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4551  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  30.83 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  27.08 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  28.1 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  25.71 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  25.86 
 
 		 310 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  28.11 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.7 
 
 		 562 aa  87  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 352 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 		 307 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1035  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.69 
 
 		 350 aa  86.7  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.977456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  26.42 
 
 		 463 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.79 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3148  inner-membrane translocator  25.78 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.178722  normal  0.58518 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 407 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0477  inner-membrane translocator  25.51 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000104814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  26.27 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  25.2 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1160  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.625358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  28.57 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  25.14 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  26.35 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  26.69 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  26.06 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  24.18 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  24.18 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  24.18 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  26.48 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  26.88 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>