More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3148 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  96.15 
 
 		 390 aa  711    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3148  inner-membrane translocator  100 
 
 		 390 aa  764    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.178722  normal  0.58518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  51.17 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  47.34 
 
 		 376 aa  298  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  45.27 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2955  inner-membrane translocator  47.09 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678807  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  50.31 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  44.39 
 
 		 408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5537  inner-membrane translocator  47.15 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2843  inner-membrane translocator  46.11 
 
 		 391 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3572  inner-membrane translocator  47.2 
 
 		 381 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0134037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2857  inner-membrane translocator  51.58 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3033  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235152  normal  0.243359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3018  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3064  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 426 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  47.7 
 
 		 435 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  48.45 
 
 		 443 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  45.4 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  41.73 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  44.35 
 
 		 389 aa  236  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  44.16 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.22 
 
 		 418 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  46.18 
 
 		 415 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  43.07 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.58 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  41.76 
 
 		 398 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  44.03 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  43.75 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.14 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.54 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.54 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.54 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.82 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.54 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.54 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.54 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  43.27 
 
 		 358 aa  226  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 358 aa  226  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 389 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 389 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 389 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.54 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  42.98 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  42.51 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.76 
 
 		 423 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  42.73 
 
 		 389 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  43.43 
 
 		 407 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.16 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.22 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 327 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.22 
 
 		 418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.13 
 
 		 418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 470 aa  219  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  45.91 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.49 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6113  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  45.29 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  42.44 
 
 		 477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.04 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.08 
 
 		 421 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3870  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.89 
 
 		 425 aa  217  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.03 
 
 		 423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  41.79 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.41 
 
 		 423 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  41.5 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3171  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.12 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.41 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.41 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  44.55 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4057  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.12 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  44.38 
 
 		 363 aa  210  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2030  inner-membrane translocator  41.71 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.710077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 359 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.88 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3859  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.01 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.107872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3207  inner-membrane translocator  43.34 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.9 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2317  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.69 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.77 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.04 
 
 		 428 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.04 
 
 		 428 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1872  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.25 
 
 		 427 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  0.0232173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  39.77 
 
 		 463 aa  206  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.37 
 
 		 423 aa  205  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0259  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3654  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.78 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4773  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.41 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3935  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.78 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3866  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.41 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03258  hypothetical protein  42.41 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3738  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.78 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.37 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>