More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5684 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  100 
 
 		 477 aa  951    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  49.78 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  52.52 
 
 		 470 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 372 aa  247  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  44.69 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  40.27 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  46.42 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2039  inner-membrane translocator  51.29 
 
 		 478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.85 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5537  inner-membrane translocator  42.18 
 
 		 385 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  44.79 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  42.04 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.17 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2857  inner-membrane translocator  43.92 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1861  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  44.65 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.38 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  41.38 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  44.62 
 
 		 408 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.1 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.1 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.1 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.1 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.1 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.1 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  43.87 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 398 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  43.56 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  43.56 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  43.56 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.87 
 
 		 389 aa  220  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  42.94 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  43.71 
 
 		 439 aa  216  8e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6113  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  40.46 
 
 		 358 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  40.46 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  42.44 
 
 		 390 aa  212  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  40.3 
 
 		 399 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  38.74 
 
 		 398 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 407 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  38.27 
 
 		 378 aa  207  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 358 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2030  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 385 aa  206  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.710077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  40 
 
 		 373 aa  206  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 407 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2955  inner-membrane translocator  39.84 
 
 		 386 aa  204  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678807  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  44.72 
 
 		 363 aa  203  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  43.34 
 
 		 368 aa  199  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3171  inner-membrane translocator  40.98 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2727  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  38.9 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  38.9 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3148  inner-membrane translocator  42.44 
 
 		 390 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.178722  normal  0.58518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2652  inner-membrane translocator  41.11 
 
 		 477 aa  193  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000103128  hitchhiker  0.00512558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2550  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  39.42 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  41.27 
 
 		 327 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.97 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  38.29 
 
 		 321 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  38.72 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3004  inner-membrane translocator  37.96 
 
 		 583 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.74 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3064  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  40.23 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.76 
 
 		 421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3033  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235152  normal  0.243359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.88 
 
 		 322 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3795  inner-membrane translocator  41.9 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3018  inner-membrane translocator  36.41 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.07 
 
 		 424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.73 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.84 
 
 		 418 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.46 
 
 		 418 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 		 421 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3572  inner-membrane translocator  38.82 
 
 		 381 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0134037 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.73 
 
 		 418 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3207  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 370 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.23 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2843  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.53 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.48 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 463 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.48 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  39.53 
 
 		 660 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 318 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50540  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.53 
 
 		 417 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0377625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3870  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.69 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  39.41 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0760  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 361 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000323795 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.25 
 
 		 423 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 443 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  36.87 
 
 		 318 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>