More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1471 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  100 
 
 
376 aa  747    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2857  inner-membrane translocator  70.61 
 
 
393 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5537  inner-membrane translocator  65.18 
 
 
385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  59.13 
 
 
389 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2955  inner-membrane translocator  48.36 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678807  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  54.83 
 
 
372 aa  292  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  47.33 
 
 
390 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3148  inner-membrane translocator  46.84 
 
 
390 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.178722  normal  0.58518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  43.88 
 
 
408 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  45.96 
 
 
407 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  43.37 
 
 
439 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  45.79 
 
 
407 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  46.24 
 
 
435 aa  261  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  47.44 
 
 
321 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  50 
 
 
415 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  51.67 
 
 
327 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  48.87 
 
 
443 aa  248  9e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  44.69 
 
 
477 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2843  inner-membrane translocator  41.94 
 
 
391 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123701  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3033  inner-membrane translocator  41.36 
 
 
390 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235152  normal  0.243359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3018  inner-membrane translocator  41.36 
 
 
390 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3064  inner-membrane translocator  41.36 
 
 
426 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3572  inner-membrane translocator  41.58 
 
 
381 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0134037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.38 
 
 
418 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  48.62 
 
 
423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  47.78 
 
 
418 aa  232  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  48.81 
 
 
470 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  47.59 
 
 
418 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.1 
 
 
421 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  47.59 
 
 
418 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  47.59 
 
 
418 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  43.53 
 
 
454 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  45.09 
 
 
398 aa  229  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.54 
 
 
421 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  47.27 
 
 
353 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  41.56 
 
 
463 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  46.42 
 
 
412 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.52 
 
 
423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  47.93 
 
 
418 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  44.91 
 
 
318 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  43.65 
 
 
452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  49.43 
 
 
407 aa  223  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  43.27 
 
 
454 aa  222  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  46.13 
 
 
318 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  43.18 
 
 
463 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.34 
 
 
428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.66 
 
 
428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  41.52 
 
 
389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2317  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  47.08 
 
 
425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.64 
 
 
389 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  43.94 
 
 
389 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.52 
 
 
423 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.52 
 
 
427 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  41.51 
 
 
389 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.52 
 
 
427 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  41.24 
 
 
389 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1861  inner-membrane translocator  43.19 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308242  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  40.8 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  41.64 
 
 
373 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  40.8 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  40.32 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.24 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.24 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.7 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.86 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.33 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.24 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.24 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.86 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  43.67 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.24 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.86 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.24 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  41.13 
 
 
389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5270  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.86 
 
 
423 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  41.13 
 
 
389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3350  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.86 
 
 
423 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  41.13 
 
 
389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5017  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.86 
 
 
423 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  42.73 
 
 
389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3870  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.26 
 
 
425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  43.03 
 
 
389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.39 
 
 
417 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.24 
 
 
389 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  41.82 
 
 
389 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3004  inner-membrane translocator  42.05 
 
 
583 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.21 
 
 
322 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.28 
 
 
424 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50540  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.39 
 
 
417 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0377625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  42.9 
 
 
358 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0259  inner-membrane translocator  44.92 
 
 
425 aa  209  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3625  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  46.21 
 
 
423 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1872  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  46.74 
 
 
427 aa  209  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  0.0232173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2608  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  46.08 
 
 
413 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0589092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3255  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  46.08 
 
 
413 aa  209  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632438  normal  0.0967059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3764  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.93 
 
 
425 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2752  inner-membrane translocator  44.56 
 
 
330 aa  209  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3831  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.93 
 
 
425 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3874  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.93 
 
 
425 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.212137  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3753  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.93 
 
 
425 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>